Upptäcka denguedroger – tillsammans
Discovering Dengue Drugs – Together ( DDDT ) var ett World Community Grid -projekt som lanserades 2007 sponsrat av forskare vid University of Texas Medical Branch i Galveston och University of Chicago . Dess mål var att identifiera nya antivirala läkemedel som är effektiva mot virus från familjen Flaviviridae . Projektet avslutades 2015.
Liksom alla World Community Grid-projekt använde Discovering Dengue Drugs – Together ett beräkningsnät som består av tusentals klientdatorer som tillhör oberoende volontärer , i kombination med servrar som distribuerar delar av arbetet till klienterna.
Fas 1
Den första fasen av projektet lanserades den 21 augusti 2007 och använde AutoDock 2007 (samma programvara som används för FightAIDS@Home ) för att testa hur väl antivirala läkemedelskandidater förutspås binda till målvirusets proteaser . De specifika virus som projektet inriktade sig på var:
Föreningar som förutspåddes binda starkt ( proteashämmare ) identifierades som potentiella antivirala läkemedelskandidater. Cirka 2,2 miljoner föreningar undersöktes i Fas 1, med cirka 20 000 av de bästa ämnen som gick vidare till den andra fasen av projektet.
2008 avbröts projektet tillfälligt på grund av orkanen Ike . Bearbetningen återupptogs i januari 2009, med serverfunktionen överförd från University of Texas Medical Branch i Galveston till Texas Advanced Computing Center i Austin. Fas 1 avslutades i augusti 2009.
Fas 2
Den andra fasen av projektet var utformad för att minska antalet falska positiva förutsägelser som gjordes under fas 1, genom att använda CHARMM- programpaketet för att förutsäga hur tätt små läkemedelsliknande molekyler binder till de olika flavivirusproteaserna.
Läkemedelskandidater som tar sig igenom fas 2 labbtestades och 2014 tillkännagavs en ny liten molekylhämmare av denguevirusproteas. Fas 2 av projektet avslutades i mars 2015.