proteiner@home
 Proteins@Home skärmsläckare
| |
| Operativ system | plattformsoberoende |
|---|---|
| Plattform | BOINC |
proteins@home var ett frivilligt datorprojekt som använde BOINC -arkitekturen. Projektet drevs av institutionen för biologi vid École Polytechnique . Projektet påbörjades den 28 december 2006 och avslutades i juni 2008.
Syfte
proteins@home var ett storskaligt icke-vinstdrivande projekt för förutsägelse av proteinstruktur som använder volontärberäkningar för att utföra intensiva beräkningar på kort tid. Från deras hemsida:
Aminosyrasekvensen för ett protein bestämmer dess tredimensionella struktur, eller "veck". Omvänt är den tredimensionella strukturen kompatibel med en stor men begränsad uppsättning aminosyrasekvenser. Att räkna upp de tillåtna sekvenserna för ett givet veck är känt som det "omvända proteinveckningsproblemet". Vi arbetar för att lösa detta problem för ett stort antal kända proteinveck (en representativ undergrupp: cirka 1500 veck). Det dyraste steget är att bygga en databas med energifunktioner som beskriver alla dessa strukturer. För varje struktur överväger vi alla möjliga sekvenser av aminosyror. Förvånansvärt nog är detta beräkningsmässigt genomförbart, eftersom våra energifunktioner är summor över par av interaktioner. När detta är gjort kan vi utforska utrymmet för aminosyrasekvenser på ett snabbt och effektivt sätt och behålla de mest gynnsamma sekvenserna. Denna storskaliga kartläggning av proteinsekvensutrymme kommer att ha tillämpningar för att förutsäga proteinstruktur och funktion, för att förstå proteinutveckling och för att designa nya proteiner. Genom att gå med i projektet kommer du att hjälpa till att bygga databasen över energifunktioner och främja ett viktigt vetenskapsområde med potentiella biomedicinska tillämpningar.
Se även
externa länkar