USP9X
| USP9X- | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| identifierare | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| , DFFRX, FAF, FAM, MRX99, MRXS99F, ubiquitin-specifikt peptidas 9, X-linked, ubiquitin-specifikt peptidas 9 X-linked, XLID99 Externa | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IDs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikidata | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Troligt ubiquitin carboxyl-terminal hydrolas FAF-X är ett enzym som hos människor kodas av USP9X - genen .
Fungera
Denna gen är en medlem av peptidas C19-familjen och kodar för ett protein som liknar ubiquitin- specifika proteaser. Även om denna gen är belägen på X-kromosomen, slipper den X-inaktivering .
Utarmning av USP9X från tvåcelliga musembryon stoppar blastocystutvecklingen och resulterar i långsammare blastomerklyvningshastighet, försämrad cellvidhäftning och en förlust av cellpolaritet. Det har också inblandats att USP9X sannolikt kommer att påverka utvecklingsprocesser genom signalvägar av Notch , Wnt , EGF och mTOR . USP9X har erkänts i studier av mus- och mänskliga stamceller som involverar embryonala, neurala och hematopoetiska stamceller . Högt uttryck bibehålls i odifferentierade progenitor- och stamceller och minskar när differentieringen fortsätter. USP9X är en proteinkodande gen som har varit inblandad antingen direkt genom mutationer eller indirekt i ett antal neuroutvecklings- och neurodegenerativa störningar. Tre mutationer har kopplats till X-kopplad intellektuell funktionsnedsättning genom störd neuronal tillväxt och cellmigration. Neurodegenerativa störningar , såsom Alzheimers, Parkinsons och Huntingtons sjukdom, har också kopplats till USP9X. Specifikt har USP9X varit inblandad i regleringen av fosforyleringen och uttrycket av det mikrotule-associerade proteinet tau , som bildar patologiska aggregat vid Alzheimers och andra tauopatier . Forskare har skapat en knockout-modell där de isolerade hippocampala neuroner från en USP9X-knockout-hanmus, som visade en 43% minskning av axonal längd och arborisering jämfört med vildtyp .
Interaktioner
USP9X har visat sig interagera med:
USP9X syndrom
Varianter av USP9X -genen har visat sig orsaka ett neurodevelopmentalt USP9X- syndrom hos både män och kvinnor. USP9X är starkt evolutionärt konserverat hos människor och är intolerant mot variation. Detta beror på den viktiga rollen för USP9X-enzymet, som omvänder proteinubiquitylering, och därigenom minskar den enzymatiska nedbrytningen och ökar livslängden för dessa proteiner. Att vara på X-kromosomen manifesterar USP9X-syndromet annorlunda hos kvinnor jämfört med män. Hos kvinnor leder förlust av funktionsvariationer i en kopia av genen till haploinsufficiens . Detta beror på att USP9X undkommer den vanligtvis skyddande processen med X-inaktivering . Som ett resultat uppvisar även " bärar "-honor syndromet.
Varianter som hittas hos kvinnor med USP9X-syndrom inkluderar hela eller partiella deletioner av en kopia av USP9X- genen, såväl som felkänningsmutationer eller små deletionsmutationer inom ramen. Symtom hos kvinnor inkluderar intellektuell funktionsnedsättning , ansiktsdysmorfi och språkstörning . Mindre vanliga symtom inkluderar kortväxthet , skolios , polydaktyli och tandförändringar . Kvinnor har ett bredare spektrum av symtom än män, troligtvis på grund av deras bredare utbud av USP9X -genvarianter jämfört med män. Andra symtom som ibland finns hos kvinnor men sällan eller aldrig hos män inkluderar höftdysplasi , hjärtdysmorfi, hörselproblem och onormal hudpigmentering.
USP9X -varianter som ses hos överlevande män orsakar endast funktionsförlust i hjärnspecifika processer, eftersom total förlust av funktion hos denna gen är dödlig i embryonalstadiet. Hanar är hemizygota för denna gen eftersom de bara har en X-kromosom. Symtom som ses hos drabbade män inkluderar intellektuell funktionsnedsättning, problem med språk, tal, beteende och syn, och ansiktsdysmorfi. Specifika hjärnavvikelser inkluderar störningar i vita substanser , en tunn corpus callosum och vidgade ventriklar .
Vidare läsning
- D'Andrea A, Pellman D (1998). "Deubiquitinating enzymes: en ny klass av biologiska regulatorer". Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol . 33 (5): 337–52. doi : 10.1080/10409239891204251 . PMID 9827704 .
- Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (1996). "En "dubbel adapter"-metod för förbättrad konstruktion av hagelgevärsbibliotek. Anal. Biochem . 236 (1): 107–13. doi : 10.1006/abio.1996.0138 . PMID 8619474 .
- Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G, Gibbs RA (1997). "Storskalig sammanlänkning av cDNA-sekvensering" . Genome Res . 7 (4): 353–8. doi : 10.1101/gr.7.4.353 . PMC 139146 . PMID 9110174 .
- Dias Neto E, Correa RG, Verjovski-Almeida S, Briones MR, Nagai MA, da Silva W, Zago MA, Bordin S, Costa FF, Goldman GH, Carvalho AF, Matsukuma A, Baia GS, Simpson DH, Brunstein A, de Oliveira PS, Bucher P, Jongeneel CV, O'Hare MJ, Soares F, Brentani RR, Reis LF, de Souza SJ, Simpson AJ (2000). "Hagelgevärssekvensering av det mänskliga transkriptomet med ORF-uttryckta sekvenstaggar" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 97 (7): 3491–6. Bibcode : 2000PNAS...97.3491D . doi : 10.1073/pnas.97.7.3491 . PMC 16267 . PMID 10737800 .
- Noma T, Kanai Y, Kanai-Azuma M, Ishii M, Fujisawa M, Kurohmaru M, Kawakami H, Wood SA, Hayashi Y (2002). "Stage- och könsberoende uttryck av Usp9x, en X-länkad musortolog av Drosophila Fat facetter, under gonadal utveckling och oogenes hos möss. " Gene Expr. Mönster . 2 (1–2): 87–91. doi : 10.1016/S0925-4773(02)00290-3 . PMID 12617843 .
- Murray RZ, Jolly LA, Wood SA (2004). "FAM-deubiquitylerande enzym lokaliseras till flera punkter av proteinhandel i epitel, där det associeras med E-cadherin och beta-catenin" . Mol. Biol. Cell . 15 (4): 1591–9. doi : 10.1091/mbc.E03-08-0630 . PMC 379258 . PMID 14742711 .
- Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, Angrand PO, Bergamini G, Croughton K, Cruciat C, Eberhard D, Gagneur J, Ghidelli S, Hopf C, Huhse B, Mangano R, Michon AM, Schirle M, Schlegl J, Schwab M , Stein MA, Bauer A, Casari G, Drewes G, Gavin AC, Jackson DB, Joberty G, Neubauer G, Rick J, Kuster B, Superti-Furga G (2004). "En fysisk och funktionell karta över den mänskliga TNF-alfa/NF-kappa B-signaltransduktionsvägen". Nat. Cell Biol . 6 (2): 97–105. doi : 10.1038/ncb1086 . PMID 14743216 . S2CID 11683986 .
- Fu GK, Wang JT, Yang J, Au-Young J, Stuve LL (2004). "Cirkulär snabb amplifiering av cDNA slutar för förlängningskloning med hög genomströmning av partiella gener". Genomik . 84 (1): 205–10. doi : 10.1016/j.ygeno.2004.01.011 . PMID 15203218 .
- Rush J, Moritz A, Lee KA, Guo A, Goss VL, Spek EJ, Zhang H, Zha XM, Polakiewicz RD, Comb MJ (2005). "Immunaffinitetsprofilering av tyrosinfosforylering i cancerceller". Nat. Biotechnol . 23 (1): 94–101. doi : 10.1038/nbt1046 . PMID 15592455 . S2CID 7200157 .
- Al-Hakim AK, Göransson O, Deak M, Toth R, Campbell DG, Morrice NA, Prescott AR, Alessi DR (2005). "14-3-3 samarbetar med LKB1 för att reglera aktiviteten och lokaliseringen av QSK och SIK" . J. Cell Sci . 118 (Pt 23): 5661–73. doi : 10.1242/jcs.02670 . PMID 16306228 .
- Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, Yamamoto J, Sekine M, Tsuritani K, Wakaguri H, Ishii S, Sugiyama T, Saito K, Isono Y, Irie R, Kushida N, Yoneyama T , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (2006) . "Diversifiering av transkriptionsmodulering: storskalig identifiering och karakterisering av förmodade alternativa promotorer av mänskliga gener" . Genome Res . 16 (1): 55–65. doi : 10.1101/gr.4039406 . PMC 1356129 . PMID 16344560 .
- Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA, Rush J, Gygi SP (2006). "Ett sannolikhetsbaserat tillvägagångssätt för högkapacitetsproteinfosforyleringsanalys och platslokalisering". Nat. Biotechnol . 24 (10): 1285–92. doi : 10.1038/nbt1240 . PMID 16964243 . S2CID 14294292 .
- Mouchantaf R, Azakir BA, McPherson PS, Millard SM, Wood SA, Angers A (2006). "Ubiquitinligase itch är autoubiquitylerad in vivo och in vitro men skyddas från nedbrytning genom att interagera med det deubiquitylerande enzymet FAM/USP9X" ( PDF) . J. Biol. Chem . 281 (50): 38738–47. doi : 10.1074/jbc.M605959200 . PMID 17038327 .
- Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (2006). "Global, in vivo och platsspecifik fosforyleringsdynamik i signalnätverk" . Cell . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 .