Afadin

AFDN
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, AF6, MLL-AF6, MLLT4, myeloid/lymfoid eller blandad härstamning leukemi; translokerad till, 4, afadin, adherens junction formation factor, l-afadin
Externa IDs
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Afadin är ett protein som hos människor kodas av AFDN -genen .

Fungera

Afadin är ett Ras (se HRAS; MIM 190020) mål som reglerar cell-celladhesion nedströms Ras-aktivering. Det är sammansmält med MLL (MIM 159555) vid leukemier orsakade av t(6;11) translokationer (Taya et al., 1998).[tillhandahålls av OMIM]

Interaktioner

Afadin har visat sig interagera med:

• BCR gen ,
• EPHB3 ,
• F11-receptor ,
• HRAS och
• LMO2 ,
• PVRL1 ,
• PVRL3 ,
• Profilin 1 ,
• RAP1A ,
• RAP1GAP ,
• SORBS1 ,
• SSX2IP ,
• Tight junction protein 1 , och
• USP9X .

Vidare läsning

•     Takai Y, Nakanishi H (januari 2003). "Nektin och afadin: nya organisatörer av intercellulära korsningar". Journal of Cell Science . 116 (Pt 1): 17–27. CiteSeerX 10.1.1.321.6596 . doi : 10.1242/jcs.00167 . PMID 12456712 . S2CID 6465469 .
•    Saha V, Lillington DM, Shelling AN, Chaplin T, Yaspo ML, Ganesan TS, Young BD (nov 1995). "AF6-genen på kromosombandet 6q27 kartläggs distalt till den minimala delen av deletion i epitelial äggstockscancer". Gener, kromosomer och cancer . 14 (3): 220–2. doi : 10.1002/gcc.2870140311 . PMID 8589040 . S2CID 23752846 .
•   Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (sep 1996). "Normalisering och subtraktion: två metoder för att underlätta genupptäckt" . Genomforskning . 6 (9): 791-806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
•    Mandai K, Nakanishi H, Satoh A, Obaishi H, Wada M, Nishioka H, ​​Itoh M, Mizoguchi A, Aoki T, Fujimoto T, Matsuda Y, Tsukita S, Takai Y (okt 1997). "Afadin: Ett nytt aktinfilamentbindande protein med en PDZ-domän lokaliserad vid cadherinbaserad cell-till-cell-adherens-övergång" . Journal of Cell Biology . 139 (2): 517–28. doi : 10.1083/jcb.139.2.517 . PMC 2139800 . PMID 9334353 .
•   Joh T, Yamamoto K, Kagami Y, Kakuda H, Sato T, Yamamoto T, Takahashi T, Ueda R, Kaibuchi K, Seto M (okt 1997). "Chimeriska MLL-produkter med ett Ras-bindande cytoplasmatiskt protein AF6 involverat i t(6;11) (q27;q23) leukemi lokaliseras i kärnan" . Onkogen . 15 (14): 1681–7. doi : 10.1038/sj.onc.1201332 . PMID 9349501 .
•   Saito S, Matsushima M, Shirahama S, Minaguchi T, Kanamori Y, Minami M, Nakamura Y (april 1998). "Fullständig genomisk struktur DNA-polymorfismer och alternativ splitsning av den humana AF-6-genen" . DNA-forskning . 5 (2): 115–20. doi : 10.1093/dnares/5.2.115 . PMID 9679199 .
•    Hock B, Böhme B, Karn T, Yamamoto T, Kaibuchi K, Holtrich U, Holland S, Pawson T, Rübsamen-Waigmann H, Strebhardt K (aug 1998). "PDZ-domänmedierad interaktion av det Eph-relaterade receptortyrosinkinaset EphB3 och det ras-bindande proteinet AF6 beror på receptorns kinasaktivitet" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 95 (17): 9779–84. Bibcode : 1998PNAS...95.9779H . doi : 10.1073/pnas.95.17.9779 . PMC 21413 . PMID 9707552 .
•    Taya S, Yamamoto T, Kano K, Kawano Y, Iwamatsu A, Tsuchiya T, Tanaka K, Kanai-Azuma M, Wood SA, Mattick JS, Kaibuchi K (aug 1998). "Ras target AF-6 är ett substrat för det fam deubiquitinating enzymet" . Journal of Cell Biology . 142 (4): 1053–62. doi : 10.1083/jcb.142.4.1053 . PMC 2132865 . PMID 9722616 .
•    Mandai K, Nakanishi H, Satoh A, Takahashi K, Satoh K, Nishioka H, ​​Mizoguchi A, Takai Y (mars 1999). "Ponsin/SH3P12: ett l-afadin- och vinkulinbindande protein lokaliserat vid cell-cell- och cell-matrix adherens-övergångar" . Journal of Cell Biology . 144 (5): 1001–17. doi : 10.1083/jcb.144.5.1001 . PMC 2148189 . PMID 10085297 .
•   Linnemann T, Geyer M, Jaitner BK, Block C, Kalbitzer HR, Wittinghofer A, Herrmann C (maj 1999). "Termodynamisk och kinetisk karakterisering av interaktionen mellan Ras-bindningsdomänen hos AF6 och medlemmar av Ras-underfamiljen" . Journal of Biological Chemistry . 274 (19): 13556–62. doi : 10.1074/jbc.274.19.13556 . PMID 10224125 .
•    Takahashi K, Nakanishi H, Miyahara M, Mandai K, Satoh K, Satoh A, Nishioka H, ​​Aoki J, Nomoto A, Mizoguchi A, Takai Y (maj 1999). "Nectin/PRR: en immunglobulinliknande celladhesionsmolekyl rekryterad till cadherinbaserade adherens-övergångar genom interaktion med Afadin, ett PDZ-domäninnehållande protein" . Journal of Cell Biology . 145 (3): 539–49. doi : 10.1083/jcb.145.3.539 . PMC 2185068 . PMID 10225955 .
•   Yamamoto T, Harada N, Kawano Y, Taya S, Kaibuchi K (maj 1999). "In vivo interaktion av AF-6 med aktiverad Ras och ZO-1". Biokemisk och biofysisk forskningskommunikation . 259 (1): 103–7. doi : 10.1006/bbrc.1999.0731 . PMID 10334923 .
•   Minaguchi T, Matsushima M, Saito S, Kanamori Y, Shirahama S, Okamoto S, Minami M, Taketani Y, Nakamura Y (april 1999). "Fullständig DNA-sekvens och karakterisering av en 330-kb VNTR-rik region på kromosom 6q27 som vanligtvis raderas vid äggstockscancer" . DNA-forskning . 6 (2): 131–6. doi : 10.1093/dnares/6.2.131 . PMID 10382971 .
•   Quilliam LA, Castro AF, Rogers-Graham KS, Martin CB, Der CJ, Bi C (aug 1999). "M-Ras/R-Ras3, ett transformerande ras-protein som regleras av Sos1, GRF1 och p120 Ras GTPase-aktiverande protein, interagerar med den förmodade Ras-effektorn AF6" . Journal of Biological Chemistry . 274 (34): 23850–7. doi : 10.1074/jbc.274.34.23850 . PMID 10446149 .
•   Kawabe H, Hata Y, Takeuchi M, Ide N, Mizoguchi A, Takai Y (okt 1999). "nArgBP2, en ny neural medlem av ponsin/ArgBP2/vinexin-familjen som interagerar med synapsassocierat protein 90/postsynaptisk densitet-95-associerat protein (SAPAP)" . Journal of Biological Chemistry . 274 (43): 30914–8. doi : 10.1074/jbc.274.43.30914 . PMID 10521485 .
•   Shao H, Kadono-Okuda K, Finlin BS, Andres DA (nov 1999). "Biokemisk karakterisering av de Ras-relaterade GTPaserna Rit och Rin". Arkiv för biokemi och biofysik . 371 (2): 207–19. doi : 10.1006/abbi.1999.1448 . PMID 10545207 .
•    Asakura T, Nakanishi H, Sakisaka T, Takahashi K, Mandai K, Nishimura M, Sasaki T, Takai Y (okt 1999). "Liknande och differentiellt beteende mellan nectin-afadin-ponsin- och cadherin-catenin-systemen under bildandet och störningen av den polariserade junctional inriktningen i epitelceller" . Gener till celler . 4 (10): 573–81. doi : 10.1046/j.1365-2443.1999.00283.x . PMID 10583506 . S2CID 24023429 .
•   Miyahara M, Nakanishi H, Takahashi K, Satoh-Horikawa K, Tachibana K, Takai Y (januari 2000). "Interaktion av nektin med afadin är nödvändig för dess klustring vid cell-cell-kontaktställen men inte för dess cis-dimerisering eller trans-interaktion. " Journal of Biological Chemistry . 275 (1): 613–8. doi : 10.1074/jbc.275.1.613 . PMID 10617658 .
•    Bouchard MJ, Dong Y, McDermott BM, Lam DH, Brown KR, Shelanski M, Bellvé AR, Racaniello VR (april 2000). "Defekter i kärn- och cytoskelettmorfologi och mitokondriell lokalisering i spermier hos möss som saknar nectin-2, en komponent i cell-cell adherens-övergångspunkter" . Molekylär och cellulär biologi . 20 (8): 2865–73. doi : 10.1128/MCB.20.8.2865-2873.2000 . PMC 85510 . PMID 10733589 .