TPSB2

TPSB2
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, TPS2, tryptaseB, tryptaseC, tryptas beta 2 (gen/pseudogen), tryptas beta 2
Externa IDs
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS n/a
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Tryptas beta-2 , även känt som tryptas II , är ett proteolytiskt enzym som hos människor kodas av TPSB2 -genen .

Tidigare var enzymet känt som Tryptase Clara.

Fungera

Tryptaser innefattar en familj av trypsinliknande serinproteaser , peptidasfamiljen S1. Tryptaser är enzymatiskt aktiva endast som heparinstabiliserade tetramerer och de är resistenta mot alla kända endogena proteinashämmare.

Flera tryptasgener är klustrade på kromosom 16p13.3. Dessa gener kännetecknas av flera distinkta egenskaper. De har en mycket konserverad 3'-UTR och innehåller tandemupprepningssekvenser vid 5'-flanken och 3'-UTR som tros spela en roll i regleringen av mRNA-stabiliteten. Dessa gener har en intron omedelbart uppströms om initiatorn Met-kodon , som separerar platsen för transkriptionsinitiering från proteinkodande sekvens. Denna egenskap är karakteristisk för tryptaser men är ovanlig i andra gener. Allelerna av denna gen uppvisar en ovanlig mängd sekvensvariationer, så att allelerna en gång troddes representera två separata gener, beta II och beta III.

Beta-tryptaser verkar vara de huvudsakliga isoenzymer som uttrycks i mastceller och klubbceller , medan alfa-tryptaser dominerar i basofiler.

Tryptaser har varit inblandade som mediatorer i patogenesen av astma och andra allergiska och inflammatoriska störningar. I synnerhet influensa A-virus av TPSB2-medierad proteolytisk klyvning i de övre luftvägarna.

Vidare läsning

•    Miller JS, Moxley G, Schwartz LB (september 1990). "Kloning och karakterisering av ett andra komplementärt DNA för humant tryptas" . The Journal of Clinical Investigation . 86 (3): 864–870. doi : 10.1172/JCI114786 . PMC 296804 . PMID 2203827 .
•   Hallgren J, Lindahl S, Pejler G (januari 2005). "Strukturella krav och mekanism för heparinberoende aktivering och tetramerisering av humant betaI- och betaII-tryptas". Journal of Molecular Biology . 345 (1): 129–139. doi : 10.1016/j.jmb.2004.10.029 . PMID 15567416 .
•   Sommerhoff CP, Bode W, Matschiner G, Bergner A, Fritz H (mars 2000). "Den mänskliga mastcellen tryptase tetramer: en fascinerande gåta löst av struktur". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteinstruktur och molekylär enzymologi . 1477 (1–2): 75–89. doi : 10.1016/s0167-4838(99)00265-4 . PMID 10708850 .
•   Huang C, Li L, Krilis SA, Chanasyk K, Tang Y, Li Z, et al. (juli 1999). "Humana tryptaser alfa och beta/II är funktionellt distinkta, delvis på grund av en enda aminosyraskillnad i en av ytslingorna som bildar den substratbindande klyftan" . Journal of Biological Chemistry . 274 (28): 19670–19676. doi : 10.1074/jbc.274.28.19670 . PMID 10391906 .
•   Caughey GH, Raymond WW, Blount JL, Hau LW, Pallaoro M, Wolters PJ, Verghese GM (juni 2000). "Karakterisering av mänskliga gamma-tryptaser, nya medlemmar av kromosom 16p mastcell tryptas och prostasin genfamiljer" . Journal of Immunology . 164 (12): 6566–6575. doi : 10.4049/jimmunol.164.12.6566 . PMID 10843716 .
•    Vanderslice P, Ballinger SM, Tam EK, Goldstein SM, Craik CS, Caughey GH (maj 1990). "Tryptas från mänskliga mastceller: flera cDNA och gener avslöjar en multigen serinproteasfamilj" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 87 (10): 3811–3815. Bibcode : 1990PNAS...87.3811V . doi : 10.1073/pnas.87.10.3811 . PMC 53993 . PMID 2187193 .
•   Guida M, Riedy M, Lee D, Hall J (juli 2000). "Karakterisering av två mycket polymorfa humana tryptasloki och jämförelse med en nyupptäckt aptryptasortolog". Farmakogenetik . 10 (5): 389–396. doi : 10.1097/00008571-200007000-00002 . PMID 10898108 .
•    Blom T, Hellman L (februari 1993). "Karakterisering av ett tryptas-mRNA uttryckt i den humana basofila cellinjen KU812". Scandinavian Journal of Immunology . 37 (2): 203–208. doi : 10.1111/j.1365-3083.1993.tb01757.x . PMID 8434231 . S2CID 22041090 .
•   Pallaoro M, Fejzo MS, Shayesteh L, Blount JL, Caughey GH (februari 1999). "Karakterisering av gener som kodar för kända och nya humana mastcelltryptaser på kromosom 16p13.3" . Journal of Biological Chemistry . 274 (6): 3355–3362. doi : 10.1074/jbc.274.6.3355 . PMID 9920877 .
•   Caughey GH (september 2002). "Ny utveckling inom genetik och aktivering av mastcellsproteaser". Molecular Immunology . 38 (16–18): 1353–1357. doi : 10.1016/S0161-5890(02)00087-1 . PMID 12217407 .
•    Akin C, Soto D, Brittain E, Chhabra A, Schwartz LB, Caughey GH, Metcalfe DD (juni 2007). "Tryptashaplotyp i mastocytos: förhållande till sjukdomsvariant och diagnostisk användbarhet av totala tryptasnivåer" . Klinisk immunologi . 123 (3): 268–271. doi : 10.1016/j.clim.2007.02.007 . PMC 1949411 . PMID 17449330 .
•    Sommerhoff CP, Bode W, Pereira PJ, Stubbs MT, Stürzebecher J, Piechottka GP, et al. (september 1999). "Strukturen av den mänskliga betaII-tryptas-tetrameren: för(u)r bättre eller sämre" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 96 (20): 10984–10991. Bibcode : 1999PNAS...9610984S . doi : 10.1073/pnas.96.20.10984 . PMC 34230 . PMID 10500112 .
•   Daniels RJ, Peden JF, Lloyd C, Horsley SW, Clark K, Tufarelli C, et al. (februari 2001). "Sekvens, struktur och patologi för den fullständigt kommenterade terminalen 2 Mb av den korta armen av human kromosom 16" . Human molekylär genetik . 10 (4): 339–352. doi : 10.1093/hmg/10.4.339 . PMID 11157797 .
•    Trivedi NN, Tamraz B, Chu C, Kwok PY, Caughey GH (november 2009). "Mänskliga försökspersoner är skyddade från mastcells-tryptasbrist trots frekvent nedärvning av mutationer med förlust av funktion. " Journal of Allergy and Clinical Immunology . 124 (5): 1099–1105.e4. doi : 10.1016/j.jaci.2009.07.026 . PMC 2783561 . PMID 19748655 .
•    Pereira PJ, Bergner A, Macedo-Ribeiro S, Huber R, Matschiner G, Fritz H, et al. (mars 1998). "Humant beta-tryptas är en ringliknande tetramer med aktiva platser vända mot en central por". Naturen . 392 (6673): 306–311. Bibcode : 1998Natur.392..306P . doi : 10.1038/32703 . PMID 9521329 . S2CID 4421972 .
•    Wu C, Ma MH, Brown KR, Geisler M, Li L, Tzeng E, et al. (juni 2007). "Systematisk identifiering av SH3-domänförmedlade humana protein-proteininteraktioner genom peptidarraymålscreening". Proteomik . 7 (11): 1775–1785. doi : 10.1002/pmic.200601006 . PMID 17474147 . S2CID 22474278 .

Denna artikel innehåller text från United States National Library of Medicine, som är allmän egendom .