Sphingomonas yanoikuyae
| Sphingomonas yanoikuyae | |
|---|---|
| Vetenskaplig klassificering | |
| Domän: | |
| Provins: | |
| Klass: | |
| Beställa: | |
| Familj: | |
| Släkte: | |
| Binomialt namn | |
|
Sphingomonas yanoikuyae Yabuuchi et al. 1990
|
|
Sphingomonas yanoikuyae är en kort stavformad , strikt aerob , gramnegativ , icke-rörlig , icke-sporbildande, kemoheterotrofa bakterieart som är gul eller benvit till färgen. Dess typstam är JCM 7371 (= GIFU 9882). Det är anmärkningsvärt för att nedbryta en mängd olika aromatiska föreningar inklusive bifenyl , naftalen , fenantren , toluen , m- och p- xylen . S. yanoikuyae upptäcktes av Brian Goodman på södra kusten av Papua Nya Guinea . Sphingomonas har dock en bred spridning över sötvatten, havsvatten och landlevande livsmiljöer. Detta beror på bakteriernas förmåga att växa och överleva under låga näringsämnen eftersom den kan utnyttja ett brett spektrum av organiska föreningar.
Mikrobiologiska egenskaper
Mogna S. yanoikuyae -celler består vanligtvis av korta stavformade grupper som är 0,3-0,8 µm gånger 1,0-2,7 µm i dimension och bildar gulpigmenterade kolonier. Denna bakterie är unik bland gramnegativa bakterier eftersom den saknar endotoxinbärarlipopolysackarider (LPS), och istället har ett cellmembran som består av fosfolipider, proteiner och respiratoriska kinoner och ett yttre membran som innehåller glykosfingolipider (GSL). Detta gör S. yanoikuyae mer hydrofob i jämförelse med andra gramnegativa bakterier. Går över till metabolism, eftersom S. yanoikuyae är en kemoheterotrof, den får i första hand sin energi från kemikalier och andra organismer. S. yanoikuyae har förmågan att metabolisera en mängd olika kolkällor, såsom L-arabinos, D-xylos, galaktos, salicin, mannos, D-turanos och kaprat. S. yanoikuyae använder främst glukos för att uppmuntra tillväxt, men använder också andra sockerarter som arabinos, galaktos, mannos, fukos, laktos, xylos, trehalos, melibios och sackaros. Mer så erhåller bakterierna energi från källor som dimetylftalat (DMP), bifenyl, naftalen, fenantren, toluen och m-/p-xylen.
Miljö
På grund av S. yanoikuyaes förmåga att överleva under förhållanden med låga koncentrationer av näringsämnen, har denna bakterie hittats i olika miljöer, allt från terrestra till vattenhaltiga livsmiljöer. Inte bara detta, utan S. yanoikuyae har också hittats på ett fåtal platser förorenade av giftiga föreningar, såsom pentaklorfenol , PCB , herbicider och kreosot , och visade omedelbart sin mångsidighet när forskare upptäckte att den använde en eller flera av föroreningarna som deras kolkällor. Dessutom, S. yanoikuyae kan bryta ner monosackarider , polysackarider och disackarider . När det gäller deras unika biologiskt nedbrytande och biosyntetiska förmågor S. yanoikuyae potentiella kandidater som eventuellt kan användas i framtida biotekniska tillämpningar, såsom biosanering av miljöföroreningar . Detta är betydelsefullt eftersom dess metaboliska mekanismer kan användas inom bioremediering och livsmedelsteknologi. Detta innebär att medan S. yanoikuyae har hittats i Papua Nya Guinea och marina sediment utanför havsbotten i Sydkinesiska havet, kommer det sannolikt att odlas från sina livsmiljöer och överföras till olika miljöer.
Fenotypiska och genetiska egenskaper
S. yanoikuyaes genomstorlek är cirka 5 353 044 baspar , bakterierna färgas gramnegativa, har en G+C-halt på 64,3 % och är icke-rörlig. Denna bakterie har ett pH- optima på 6,8, men kan överleva i pH-förhållanden som sträcker sig från 6,0 till 9,0. Dessutom är dess temperaturoptima 28𝇈C, med ett intervall på 13𝇈C-30𝇈C, och det är en lätt halofil (2-5% NaCl).
Vidare läsning
- Stallforth, Pierre; Adibekian, Alexander; Seeberger, Peter H. (2008). "De Novo-syntes av ad-galakturonsyratioglykosid som nyckel till den totala syntesen av en glykosfingolipid från Sphingomonasyanoikuyae". Organiska bokstäver . 10 (8): 1573–1576. doi : 10.1021/ol800227b . ISSN 1523-7060 . PMID 18363404 .
- Cho O, Choi KY, Zylstra GJ, et al. (februari 2005). "Katabolisk roll för ett trekomponents salicylatoxygenas från Sphingomonas yanoikuyae B1 i polycyklisk aromatisk kolvätenedbrytning". Biokemisk och biofysisk forskningskommunikation . 327 (3): 656–62. doi : 10.1016/j.bbrc.2004.12.060 . PMID 15649397 .