Sparsomycin
 | |
| Identifierare | |
|---|---|
| |
| CAS-nummer | |
| PubChem CID | |
| ChemSpider | |
| UNII | |
| KEGG | |
| ChEMBL | |
| CompTox Dashboard ( EPA ) | |
| Kemiska och fysikaliska data | |
| Formel | C13H19N3O5S2 _ _ _ _ _ _ _ _ _ |
| Molar massa | 361,43 g·mol -1 |
| 3D-modell ( JSmol ) | |
| |
Sparsomycin är en förening, ursprungligen upptäckt som en metabolit av bakterien Streptomyces sparsogenes , som binder till 50S ribosomala subenheten och hämmar proteinsyntes genom peptidyltransferas- hämning. Eftersom det binder till 50S ribosomala subenheten, inducerar det translokation på 30S subenheten . Det är en nukleotidanalog . Det ansågs också tidigare vara ett möjligt antitumörmedel , men intresset för detta läkemedel förkastades senare efter att det upptäcktes att det resulterade i retinopati och som ett verktyg för att studera proteinsyntes; det är inte specifikt för bakteriella ribosomer och kan därför inte användas som antibiotikum .
Föreningen upptäcktes 1962 och strukturen bestämdes 1970; en första total syntes rapporterades 1981.
Ett derivat av denna förening är fenol-alanin-sparsomycin och tros vara ett mer effektivt antitumörmedel än sparsomycin i sig.
Biosyntes
Även om strukturen för sparsomycin publicerades 1970, föreslogs ingen biosyntetisk väg för dess bildning i litteraturen fram till 1988. Ronald J. Parry et al. har undersökt biosyntetiska prekursorer för den ovanliga monooxoditioacetalgruppen. Genom att administrera det radioaktivt märkta L -metioninet till S. sparsogenes kom de fram till att det var den mest sannolika prekursorn för C-4'- och C-5'-atomerna i sparsomycinet. Men vid administrering av märkt cystein fann de att C-4' inte innehöll något 13C medan C-3' fortfarande gjorde det. Detta fynd ledde dem till ett antagande att ett enzym som kallas serintranshydroximetylas kunde vara ansvarigt för observationen genom omvandling av cysteinet till serinresten . Detta antagande bekräftades dock inte, eftersom administrering av 13C -serin inte producerade något märkt sparsomycin. I den här studien har författarna slutligen kommit fram till att S-metyl- D -cystein bör vara prekursorn för denna del av molekylen . I denna artikel har de också föreslagit en L -tryptofan som en källa till den uracil- innehållande delen av molekylen. [ citat behövs ]
studie av biosyntesen av sparsomycin har visat att L -cystein och S-metylgruppen av metionin är verkliga föregångare för monooxoditioacetalgruppen. Dessa studier har också bekräftat att L-tryptofan är en föregångare till uracildelen av sparsomycin. Det förblev dock fortfarande oklart om transformationen fortsätter genom kynureinvägen eller inte. Nästa artikel publicerad av samma forskargrupp har visat att denna väg inte är ansvarig för transformationerna av L -tryfofan i biosyntesen av sparsomycin. I denna artikel har författarna också bekräftat (E)-3-(4-oxo-6-metyl-5-pyrimidinyl)akrylsyra (PCA) och (E)3-(2,4-dioxo-6-metyl-5) -pyrimidinyl)akrylsyra (UCA) är mellanprodukter i den studerade biosyntesvägen. Flera år senare hittades ett enzym som katalyserar omvandlingen av PCA till UCA.
