RecLOH
RecLOH är en term inom genetik som är en förkortning för " Recombinant Loss of Heterozygosity ".
Detta är en typ av mutation som sker med DNA genom rekombination . Från ett par ekvivalenta ("homologa"), men något olika ( heterozygota ) gener, uppstår ett par identiska gener. I det här fallet sker ett icke-ömsesidigt utbyte av genetisk kod mellan kromosomerna, i motsats till kromosomal korsning , eftersom genetisk information går förlorad.
För Y-kromosom
Inom genetisk genealogi används termen särskilt om liknande skenbara händelser i Y-kromosom- DNA. Denna typ av mutation sker inom en kromosom och involverar inte en ömsesidig överföring. Snarare "skriver" ett homologt segment över det andra. Mekanismen antas vara annorlunda än RecLOH-händelser i autosomala kromosomer , eftersom målet är samma kromosom istället för den homologa.
Under mutationen skriver en av dessa kopior över den andra. Därmed är skillnaderna mellan de två förlorade. Eftersom skillnader går förlorade heterozygositeten förlorad.
Rekombination på Y-kromosomen sker inte bara under meios , utan praktiskt taget vid varje mitos när Y-kromosomen kondenserar, eftersom det inte kräver parning mellan kromosomerna. Rekombinationsfrekvensen överstiger till och med ramskiftmutationsfrekvensen ( felparning av strängar ) för (medelsnabb) Y-STR , men många rekombinationsprodukter kan leda till infertila könsceller och "dotter ut".
Rekombinationshändelser (RecLOH) kan observeras om YSTR-databaser söks efter tvillingalleler vid 3 eller fler duplicerade markörer på samma palindrom ( hårnål ). T.ex. DYS459, DYS464 och DYS724 (CDY) finns på samma palindrom P1. En hög andel 9-9, 15-15-17-17, 36-36 kombinationer och liknande tvillingallelmönster kommer att hittas. PCR-typningsteknologier har utvecklats (t.ex. DYS464X ) som kan verifiera att det oftast verkligen finns två alleler av varje, så vi kan vara säkra på att det inte finns någon gendeletion . Släktsläkter har många gånger bevisat att parallella förändringar på alla markörer som finns på samma palindrom ofta observeras och resultatet av dessa förändringar alltid är tvillingalleler. Så en 9-10, 15-16-17-17, 36-38 haplotyp kan ändras i en rekombinationshändelse till den som nämns ovan, eftersom alla tre markörerna ( DYS459, DYS464 och DYS724 ) påverkas av en och samma recLOH-händelse .
- Krahn, Thomas (2005). "Rekombinationell förlust av heterozygositet (recLOH)" . DNA-fingeravtryck, Tyskland. Arkiverad från originalet 2010-11-29 . Hämtad 2006-07-11 .