Proteinsorterande transpeptidas

Ett proteinsorterande transpeptidas är ett enzym , såsom sortaset SrtA från Staphylococcus aureus , som klyver ett eller flera målproteiner som produceras av samma cell, som en del av en specialiserad väg för proteinmålsökning . Det typiska prokaryota proteinsorterande transpeptidaset karakteriseras som ett proteas , men hydrolyserar inte bara en peptidbindning. Istället överförs den större, N-terminala delen av den kluvna polypeptiden till en annan molekyl, såsom en prekursor för peptidoglykancellväggen i grampositiva bakterier .

Termen sortas är korrekt reserverad för uppsättningen av cysteinproteasenzymer sortas A , sortas B och medlemmar av ytterligare klasser , vilka alla delar homologi. Emellertid har ett växande antal ytterligare proteinsorteringssystem beskrivits i prokaryoter, som involverar sorteringsenzymer som saknar homologi med sortas och som verkar ha uppstått separat genom konvergent evolution . Även om sortaserna är de bäst beskrivna medlemmarna av de proteinsorterande transpeptidaserna, har arbetet med de analoga enzymerna archaeosortase , rhombosortase och PorU-enzymet i typ IX- sekretionssystem (T9SS) ackumulerats.

sorteringsenzym	mekanism	besläktad sorteringssignal
sortase A	cysteinproteas	LPXTG
sortase B	cysteinproteas	NPQTN
arkeosortas A	cysteinproteas	PGF-CTERM
exosortas A	cysteinproteas	PEP-CTERM
rombosortas	serinproteas	GlyGly-CTERM
PorU som i Porphyromonas gingivalis	serinproteas	T9SS C-terminal beta-sandwich-domän