PLA2G6
| PLA2G6- | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| identifierare | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| , CaI-PLA2, GVI, INAD1, IPLA2-VIA, NBIA2, NBIA2A, NBIA2B, PARK14, PLA2, PNPLA9, iPLA2, iPLA2beta, fosfolipas A2 grupp VI Externa ID: | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| n | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikidata | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
85 kDa kalciumoberoende fosfolipas A2 , även känd som 85/88 kDa kalciumoberoende fosfolipas A2 , grupp VI fosfolipas A2 , intracellulärt membran -associerat kalciumoberoende fosfolipas A2 beta , eller Patatin-liknande fosfolipas-innehållande proteindomän- 9 som hos människor kodas av PLA2G6 -genen .
Strukturera
PLA2G6 - genen är belägen på p-armen av kromosom 22 vid position 13.1 och den spänner över 80 605 baspar. PLA2G6 - genen producerar ett protein på 18,6 kDa som består av 166 aminosyror . Det resulterande proteinets struktur har visat sig innehålla ett lipasmotiv och 8 ankyrinrepetitioner . Till skillnad från gnagare PLA2G6, som är känd för att dela 90 % övergripande aminosyrasekvensidentitet med människors, innehåller det humana PLA2G6-proteinet en insättning av 54 rester som kodar för en prolinrik region. Denna insättning har visat sig störa den sista förmodade ankyrinupprepningen , samt fungera som en länkregion som segregerar den N-terminala proteinbindande domänen från den C-terminala katalytiska domänen.
Fungera
PLA2G6 - genen kodar för ett fosfolipas A2- enzym , som är en underklass av enzym som katalyserar frisättningen av fettsyror från fosfolipider . Denna typ av enzym är ansvarig för att bryta ner (metabolisera) fosfolipider . Fosfolipidmetabolism är avgörande för många kroppsprocesser, inklusive att hjälpa till att bibehålla cellmembranets integritet .
Specifikt hjälper A2-fosfolipas som produceras från PLA2G6- genen, ibland kallad PLA2-grupp VI, till att reglera nivåerna av en förening som kallas fosfatidylkolin , som är riklig i cellmembranet. Det kodade proteinet kan också spela en roll i fosfolipidombildning , arakidonsyrafrisättning , kväveoxidinducerad eller vasopressininducerad arakidonsyrafrisättning och i leukotrien- och prostaglandinsyntes , Fas-receptormedierad apoptos och transmembranjonflöde i B -stimulerad glukos celler .
Dessutom har den en roll i kardiolipin (CL) deacylering och krävs för både hastighet och riktning av monocyt MCP1/CCL2 -inducerad kemotaxi genom reglering av F- aktinpolymerisation vid pseudopoderna . Isoform ankyrin-iPLA2-1 och isoform ankyrin-iPLA2-2, som saknar den katalytiska domänen, är troligen involverade i den negativa regleringen av PLA2G6-aktivitet. Flera transkriptvarianter som kodar för flera isoformer har beskrivits, men fullängdskaraktären för endast två av dem har hittills bestämts.
Katalytisk aktivitet
Fosfatidylkolin + H2O = 1-acylglycerofosfokolin + ett karboxylat.
Modellorganismer
Modellorganismer har använts i studien av PLA2G6-funktion. En villkorlig knockout-muslinje kallad Pla2g6 tm1a(EUCOMM)Wtsi genererades vid Wellcome Trust Sanger Institute . Han- och hondjur genomgick en standardiserad fenotypisk screening för att bestämma effekterna av deletion. Ytterligare undersökningar utförda: - Djupgående immunologisk fenotypning.
| Karakteristisk | Fenotyp |
|---|---|
| All data tillgänglig på. | |
| Homozygot viabilitet vid P14 | Vanligt |
| Homozygot fertilitet | Onormal |
| Kroppsvikt | Vanligt |
| Neurologisk bedömning | Vanligt |
| Greppstyrka | Vanligt |
| Dysmorfologi | Vanligt |
| Indirekt kalorimetri | Vanligt |
| Glukostoleranstest | Vanligt |
| Auditiv hjärnstammsrespons | Vanligt |
| DEXA | Vanligt |
| Radiografi | Vanligt |
| Ögonmorfologi | Vanligt |
| Klinisk kemi | Vanligt |
| Hematologi 16 veckor | Vanligt |
| Leukocyter från perifert blod 16 veckor | Vanligt |
| Cytotoxisk T-cellsfunktion | Vanligt |
| Immunfenotypning av mjälte | Vanligt |
| Mesenterisk lymfkörtelimmunfenotypning | Vanligt |
| Benmärgsimmunfenotypning | Vanligt |
| Epidermal immunkomposition | Vanligt |
| Trichuris utmaning | Vanligt |
Klinisk signifikans
Mutationer i PLA2G6 har visat sig resultera i mitokondriella brister och associerade störningar, inklusive PLA2G6-associerad neurodegeneration (PLAN), som har flera undertyper och är även känd som Neurodegeneration med hjärnansamling av järn typ 2 (NBIA2), andra former av sjukdomar är också kallas Parkinsons sjukdom 14 (PARK14) och ärftlig spastisk paraplegi .
PLA2G6-associerad neurodegeneration (PLAN)
PLA2G6-associerad neurodegeneration (PLAN) är en neurodegenerativ störning associerad med järnansamling i hjärnan, främst i de basala ganglierna . Det kännetecknas av progressiv extrapyramidal dysfunktion som leder till stelhet, dystoni , dysartri och sensorimotorisk funktionsnedsättning.
Infantil neuroaxonal dystrofi (INAD)
Den allvarligaste formen kallas infantil neuroaxonal dystrofi (INAD), även neurodegeneration med hjärnansamling av järn typ 2A (NBIA2A), och kännetecknas av patologisk axonal svullnad och sfäroida kroppar i det centrala nervsystemet . Debut är inom de första 2 åren av livet med döden ofta vid 10 års ålder.
Atypisk neuroaxonal dystrofi (atypisk NAD)
En senare debut i barndomen och långsammare progressiv form kallas atypisk neuraxonal dystrofi (atypisk NAD), även Neurodegeneration med hjärnansamling av järn typ 2B (NBIA2B).
En vuxensjukdom som kallas PLA2G6-relaterad dystoni-parkinsonism utvecklar dystoni och parkinsonism efter tidigare normal utveckling, och orsakas också av bialleliska mutationer till PLA2G6 .
Parkinsons sjukdom 14 (PARK14)
Parkinsons sjukdom 14 (PARK14) är en progressiv neurodegenerativ störning hos vuxna som kännetecknas av parkinsonism, dystoni , allvarlig kognitiv försämring, cerebral och cerebellär atrofi och frånvarande järn i basalganglierna vid magnetisk resonanstomografi .
Ärftlig spastisk paraplegi
Ärftliga spastiska paraplegier är en mångsidig klass av ärftliga degenerativa ryggmärgssjukdomar som kännetecknas av en långsam, gradvis, progressiv svaghet och spasticitet (stelhet) i benen. De första symtomen kan vara svårigheter med balansen, svaghet och stelhet i benen, muskelspasmer och släpande tår när man går. I vissa former av sjukdomen blåssymptom (som inkontinens) uppträda, eller så kan svagheten och stelheten spridas till andra delar av kroppen. Progressionshastigheten och symtomens svårighetsgrad är ganska varierande.
En annan sjukdom associerad med mutationer i denna gen är infantil neuroaxonal dystrofi .
Interaktioner
PLA2G6 har visats ha protein-protein-interaktioner med följande.
Vidare läsning
- Schröder HC, Perovic S, Kavsan V, Ushijima H, Müller WE (1998). "Mekanismer för prionSc- och HIV-1 gp120 inducerade neuronal celldöd". Neurotoxikologi . 19 (4–5): 683–688. PMID 9745929 .
- Leslie CC (februari 2004). "Reglering av arakidonsyratillgänglighet för eikosanoidproduktion". Biokemi och cellbiologi . 82 (1): 1–17. doi : 10.1139/o03-080 . PMID 15052324 .
- Turk J, Ramanadham S (oktober 2004). "Uttrycket och funktionen av en grupp VIA kalciumoberoende fosfolipas A2 (iPLA2beta) i betaceller". Canadian Journal of Physiology and Pharmacology . 82 (10): 824–832. doi : 10.1139/y04-064 . PMID 15573142 .
- Law MH, Cotton RG, Berger GE (juni 2006). "Rollen av fosfolipaser A2 i schizofreni" . Molekylär psykiatri . 11 (6): 547–556. doi : 10.1038/sj.mp.4001819 . PMID 16585943 .
- Tang J, Kriz RW, Wolfman N, Shaffer M, Seehra J, Jones SS (mars 1997). "Ett nytt cytosoliskt kalciumoberoende fosfolipas A2 innehåller åtta ankyrinmotiv" . Journal of Biological Chemistry . 272 (13): 8567–8575. doi : 10.1074/jbc.272.13.8567 . PMID 9079687 .
- Mavoungou E, Georges-Courbot MC, Poaty-Mavoungou V, Nguyen HT, Yaba P, Delicat A, et al. (september 1997). "HIV- och SIV-höljesglykoproteiner inducerar fosfolipas A2-aktivering i humana och makaklymfocyter". Journal of Acquired Immune Deficiency Syndromes and Human Retrovirology . 16 (1): 1–9. doi : 10.1097/00042560-199709010-00001 . PMID 9377118 .
- Larsson Forsell PK, Kennedy BP, Claesson HE (juni 1999). "Den mänskliga kalciumoberoende fosfolipas A2-genen flera enzymer med distinkta egenskaper från en enda gen" . European Journal of Biochemistry . 262 (2): 575–585. doi : 10.1046/j.1432-1327.1999.00418.x . PMID 10336645 .
- Dunham I, Shimizu N, Roe BA, Chissoe S, Hunt AR, Collins JE, et al. (december 1999). "DNA-sekvensen av human kromosom 22" . Naturen . 402 (6761): 489–495. Bibcode : 1999Natur.402..489D . doi : 10.1038/990031 . PMID 10591208 .
- Kim SJ, Gershov D, Ma X, Brot N, Elkon KB (september 2002). "I-PLA(2)-aktivering under apoptos främjar exponeringen av membranlysofosfatidylkolin som leder till bindning av naturliga immunglobulin M-antikroppar och komplementaktivering" . Journal of Experimental Medicine . 196 (5): 655–665. doi : 10.1084/jem.20020542 . PMC 2194002 . PMID 12208880 .
- Hichami A, Joshi B, Simonin AM, Khan NA (november 2002). "Roll av tre isoformer av fosfolipas A2 i kapacitativt kalciuminflöde i mänskliga T-celler". European Journal of Biochemistry . 269 (22): 5557–5563. doi : 10.1046/j.1432-1033.2002.03261.x . PMID 12423354 .
- Cummings BS, McHowat J, Schnellmann RG (mars 2004). "Roll av en endoplasmatisk retikulum Ca2+-oberoende fosfolipas A2 i cisplatininducerad njurcellsapoptos". Journal of Pharmacology and Experimental Therapeutics . 308 (3): 921–928. doi : 10.1124/jpet.103.060541 . PMID 14634037 . S2CID 1036850 .
- Bao S, Jin C, Zhang S, Turk J, Ma Z, Ramanadham S (februari 2004). "Beta-cells kalciumoberoende grupp VIA fosfolipas A(2) (iPLA(2)beta): spåra iPLA(2)beta-rörelser som svar på stimulering med insulinsekretagoger i INS-1-celler" . Diabetes . 53 (90001, Suppl 1): S186–S189. doi : 10.2337/diabetes.53.2007.S186 . PMC 3761941 . PMID 14749286 .
- Tay HK, Melendez AJ (maj 2004). "Fcgamma RI-utlöst generering av arakidonsyra och eikosanoider kräver iPLA2 men inte cPLA2 i mänskliga monocytiska celler" . Journal of Biological Chemistry . 279 (21): 22505–22513. doi : 10.1074/jbc.M308788200 . PMID 15007079 .
- Tanaka H, Minakami R, Kanaya H, Sumimoto H (augusti 2004). "Katalytiska rester av grupp VIB kalciumoberoende fosfolipas A2 (iPLA2gamma)". Biokemisk och biofysisk forskningskommunikation . 320 (4): 1284–1290. doi : 10.1016/j.bbrc.2004.05.225 . PMID 15249229 .