OLIGO Primer Analysis Software
Utvecklare | Molecular Biology Insights, Inc. |
---|---|
Stabil frisättning | 7,54 / 23 mars 2011 |
Operativ system | Windows, Macintosh |
Plattform | Mac, PC |
Typ | Bioinformatik |
Licens | kommersiell |
Hemsida | http://oligo.net/ |
OLIGO Primer Analysis Software var den första allmänt tillgängliga programvaran för design av DNA- primer. De första artiklarna som beskrev denna programvara publicerades 1989 och 1990, och på varandra följande uppgraderingar på 1990- och 2000-talen har alla citerats tillsammans över 600 gånger i vetenskapliga tidskrifter och över 500 gånger i patent (enligt Scopus ) . Programmet är ett omfattande realtids -PCR-primer- och sondsöknings- och analysverktyg, och gör även andra uppgifter som siRNA och molekylära beacon- sökningar, öppen läsram , restriktionsenzymanalys , etc. Det har skapats och underhållits av Wojciech Rychlik och Piotr Rychlik. OLIGO har granskats flera gånger i vetenskapliga tidskrifter, för första gången 1991 i en recension i Critical Reviews in Biochemistry and Molecular Biology, och för dess nästa uppgraderingar (med OLIGO 7 som den senaste 2011).
Oligo Primer Analysis Software har använts i olika vetenskapliga studier (som citeras av exempel på nyare publikationer), bland dem för: realtids-PCR, apoptosstudier, antigentypning, artidentifiering, studier av artutveckling, mätning av mRNA-expressionsnivåer, oligonukleotid- baserade arrayhybridiseringsstudier, degenererade primerstudier, mikrosatellitanalys, DNA-mikroarraydetektion, invers PCR, genomvandring, nukleotidpolymorfismerstudier, detektion av mikroorganismer eller virus, genotypning, kloning, vektor(gen)konstruktion, genomsekvensering, detektion av mutanter eller intraspecifika variabilitet, genetiska sjukdomsstudier, siRNA och gentystnad, FISH-analys (enkelcellsexpressionsstudie), skorpionsonder och utveckling av nya DNA-amplifieringsmetoder.
Annan Primer Design Software
- FastPCR
- Gendesigner
- Genialisk
- MacVector
- Netprimer
- Primer Premier
- UGENE
- Vektor NTI