Protein
NCL
Tillgängliga strukturer
PDB
Ortologisk sökning:
Identifierare
, C23, nukleolin, Nsr1
Externa ID
Wikidata
Nukleolin är ett protein som hos människor kodas av NCL -genen .
Gen
Den humana NCL-genen är belägen på kromosom 2 och består av 14 exoner med 13 introner och sträcker sig över cirka 11 kb. Intron 11 i NCL-genen kodar för ett litet nukleolärt RNA, benämnt U20.
Fungera
Nukleolin är det huvudsakliga nukleolära proteinet i växande eukaryota celler. Det finns associerat med intranukleolärt kromatin och pre-ribosomala partiklar. Det inducerar kromatindekondensation genom att binda till histon H1. Det tros spela en roll i pre-rRNA-transkription och ribosomsammansättning. Kan spela en roll i processen för transkriptionell förlängning. Binder RNA-oligonukleotider med 5'-UUAGGG-3'-repeteringar tätare än det telomera enkelsträngade DNA-5'-TTAGGG-3'-repetitionen.
Nukleolin kan också fungera som en transkriptionskoaktivator med Chicken Ovalbumin Upstream Promoter Transcription Factor II ( COUP-TFII) .
Klinisk signifikans
Midkine och pleiotrofin binder till nukleolin på cellytan som en lågaffinitetsreceptor. Denna bindning kan hämma HIV-infektion.
Nukleolin vid cellytan är receptorn för fusionsproteinet Respiratory Syncytial Virus ( RSV). Interferens med nukleolin-RSV-fusionsproteininteraktionen har visat sig vara terapeutisk mot RSV-infektion i cellkulturer och djurmodeller.
Interaktioner
Nukleolin har visat sig interagera med:
MTDH ,
CSNK2A2 ,
Centaurin, alfa 1 ,
HuR ,
NPM1 ,
P53 ,
PPP1CB ,
S100A11 ,
Sjögrens syndrom antigen B ,
TOP1 , och
Telomeras omvänt transkriptas .
Vidare läsning
Tuteja R, Tuteja N (1999). "Nukleolin: ett multifunktionellt huvudnukleolärt fosfoprotein". Kritiska recensioner i biokemi och molekylärbiologi . 33 (6): 407–36. doi : 10.1080/10409239891204260 . PMID 9918513 .
Pasternack MS, Bleier KJ, McInerney TN (aug 1991). "Granzym A binder till målcellsproteiner. Granzym A binder till och klyver nukleolin in vitro" . Journal of Biological Chemistry . 266 (22): 14703–8. doi : 10.1016/S0021-9258(18)98743-0 . PMID 1860869 .
Belenguer P, Caizergues-Ferrer M, Labbé JC, Dorée M, Amalric F (juli 1990). "Mitosspecifik fosforylering av nukleolin med p34cdc2-proteinkinas" . Molekylär och cellulär biologi . 10 (7): 3607–18. doi : 10.1128/MCB.10.7.3607 . PMC 360797 . PMID 2192260 .
Srivastava M, Fleming PJ, Pollard HB, Burns AL (juni 1989). "Kloning och sekvensering av humant nukleolin-cDNA" . FEBS Bokstäver . 250 (1): 99–105. doi : 10.1016/0014-5793(89)80692-1 . PMID 2737305 . S2CID 8690886 .
Tuteja N, Huang NW, Skopac D, Tuteja R, Hrvatic S, Zhang J, Pongor S, Joseph G, Faucher C, Amalric F (juli 1995). "Humant DNA-helikas IV är nukleolin, ett RNA-helikas som moduleras av fosforylering". Gene . 160 (2): 143–8. doi : 10.1016/0378-1119(95)00207-M . PMID 7642087 .
Jordan P, Heid H, Kinzel V, Kübler D (dec 1994). "Större cellytlokaliserade proteinsubstrat av ett ektoproteinkinas är homologer av kända kärnproteiner". Biokemi . 33 (49): 14696–706. doi : 10.1021/bi00253a007 . PMID 7993898 .
Nicoloso M, Caizergues-Ferrer M, Michot B, Azum MC, Bachellerie JP (sep 1994). "U20, ett nytt litet nukleolärt RNA, kodas i ett intron av nukleolingenen hos däggdjur" . Molekylär och cellulär biologi . 14 (9): 5766–76. doi : 10.1128/mcb.14.9.5766 . PMC 359102 . PMID 8065311 .
Ishikawa F, Matunis MJ, Dreyfuss G, Cech TR (juli 1993). "Nukleära proteiner som binder pre-mRNA 3'-splitsningsställesekvensen r(UUAG/G) och den humana telomera DNA-sekvensen d(TTAGGG)n" . Molekylär och cellulär biologi . 13 (7): 4301–10. doi : 10.1128/MCB.13.7.4301 . PMC 359985 . PMID 8321232 .
Eggert M, Möws CC, Tripier D, Arnold R, Michel J, Nickel J, Schmidt S, Beato M, Renkawitz R (dec 1995). "En fraktion berikad i ett nytt glukokortikoidreceptorinteragerande protein stimulerar receptorberoende transkription in vitro" . Journal of Biological Chemistry . 270 (51): 30755–9. doi : 10.1074/jbc.270.51.30755 . PMID 8530516 . S2CID 25642912 .
Bharti AK, Olson MO, Kufe DW, Rubin EH (januari 1996). "Identifiering av ett nukleolinbindningsställe i humant topoisomeras I" . Journal of Biological Chemistry . 271 (4): 1993–7. doi : 10.1074/jbc.271.4.1993 . PMID 8567649 . S2CID 25059254 .
Li YP, Busch RK, Valdez BC, Busch H (april 1996). "C23 interagerar med B23, ett förmodat nukleolär-lokalisering-signalbindande protein" . European Journal of Biochemistry . 237 (1): 153–8. doi : 10.1111/j.1432-1033.1996.0153n.x . PMID 8620867 .
Li D, Dobrowolska G, Krebs EG (juni 1996). "Den fysiska associationen av kaseinkinas 2 med nukleolin" . Journal of Biological Chemistry . 271 (26): 15662–8. doi : 10.1074/jbc.271.26.15662 . PMID 8663258 . S2CID 10750338 .
Zhou G, Seibenhener ML, Wooten MW (dec 1997). "Nukleolin är ett proteinkinas C-zeta-substrat. Koppling mellan cellytesignalering och kärna i PC12-celler" . Journal of Biological Chemistry . 272 (49): 31130–7. doi : 10.1074/jbc.272.49.31130 . PMID 9388266 .
Haluska P, Saleem A, Edwards TK, Rubin EH (april 1998). "Interaktion mellan N-terminalen av humant topoisomeras I och SV40 stort T-antigen" . Nukleinsyraforskning . 26 (7): 1841–7. doi : 10.1093/nar/26.7.1841 . PMC 147454 . PMID 9512561 .
Borggrefe T, Wabl M, Akhmedov AT, Jessberger R (juli 1998). "Ett B-cellsspecifikt DNA-rekombinationskomplex" . Journal of Biological Chemistry . 273 (27): 17025–35. doi : 10.1074/jbc.273.27.17025 . PMID 9642267 . S2CID 24347735 .
Larrucea S, González-Rubio C, Cambronero R, Ballou B, Bonay P, López-Granados E, Bouvet P, Fontán G, Fresno M, López-Trascasa M (november 1998). "Cellulär adhesion medierad av faktor J, en komplementhämmare. Bevis för nukleolininblandning" . Journal of Biological Chemistry . 273 (48): 31718–25. doi : 10.1074/jbc.273.48.31718 . PMID 9822633 . S2CID 8004314 .
Parada CA, Roeder RG (juli 1999). "Ett nytt RNA-polymeras II-innehållande komplex potentierar Tat-förstärkt HIV-1-transkription" . EMBO Journal . 18 (13): 3688–701. doi : 10.1093/emboj/18.13.3688 . PMC 1171446 . PMID 10393184 .
PDB galleri
2fc8 : Lösningsstruktur för RRM_1-domänen av NCL-protein
2fc9 : Lösningsstruktur för RRM_1-domänen av NCL-protein