NiCoT-familjen

Proteiner som för närvarande är kända för att tillhöra familjen Ni ²⁺ -Co ²⁺ transportörer (NiCoT) ( TC# 2.A.52 ) kan hittas i organismer som sträcker sig från gramnegativa och grampositiva bakterier till archaea och vissa eukaryoter . Medlemmar av denna familj katalyserar upptaget av Ni ²⁺ och/eller Co ²⁺ i en protondrivkraftsberoende process.

Strukturera

Dessa proteiner varierar i storlek från cirka 300 till 400 aminoacylrester och har 6, 7 eller 8 transmembransegment (TMS), som tros vara resultatet av en intragen 4 TMS-duplicering, följt av en deletion av en eller två TMS:er i fall av de 7 eller 6 TMS-proteinerna. Topologiska analyser med HoxN Ni ²⁺ transportören av Ralstonia eutropha ( Alcaligenes eutrophus ) tyder på att den har 8 TMS med sina N- och C-terminaler i cytoplasman. Co2 ⁺ (Ni2 ⁺ )-transportören av Rhodococcus rhodochrous , NhlF, uppvisar åtta förmodade TMS:er och åtta uppenbara TMS:er avslöjas genom hydropatianalyser av multipla anpassningar av familjeproteinsekvenser. Ett HX ⁴ DH-motiv i helix 2 av HoxN-proteinet har varit inblandat i Ni ²⁺ -bindning, och både helix 1 och helix 2, som interagerar rumsligt, bildar selektivitetsfiltret. I Helicobacter pylori NixA-homologen har flera konserverade motiv visat sig vara viktiga för Ni ²⁺ -bindning och transport.

Åtminstone en kristallstruktur är känd, bestämd av Yu et al., tillgänglig på .

Reaktion

Den övergripande reaktionen som katalyseras av proteinerna i NiCoT-familjen är:

[Ni2 ⁺ och/eller Co2 ⁺ ] (ut) → [Ni2 ⁺ och/eller Co2 ⁺ ] (in).

Proteiner

Flera karakteriserade proteiner tillhör Ni ²⁺ -Co ²⁺ Transporter (NiCoT) familjen (TC# 2.A.43). En komplett lista över dessa proteiner tillsammans med deras transportörklassificeringsidentifikationsnummer (TCID), domän, kungarike/fylum och några exempel finns i Transporter Classification Database .

Vidare läsning

•   Deng, X; Han, J; He, N (februari 2013). "Jämförande studie om Ni(2+)-affinitetstransport av nickel/koboltpermeaser (NiCoTs) och potentialen hos rekombinant Escherichia coli för Ni(2+) bioackumulering". Bioresur. Teknol . 130 : 69–74. doi : 10.1016/j.biortech.2012.11.133 . PMID 23306112 .
•    Rodionov, D; Hebbeln, P; Gelfand, M; Eitinger, T (januari 2006). "Jämförande och funktionell genomisk analys av prokaryota nickel- och koboltupptagstransportörer: bevis för en ny grupp av ATP-bindande kassetttransportörer" . J. Bacteriol . 188 (1): 317–327. doi : 10.1128/JB.188.1.317-327.2006 . PMC 1317602 . PMID 16352848 .