Nextstrain

Nextstrain är ett samarbete mellan forskare i Seattle , USA och Basel , Schweiz, som tillhandahåller en samling verktyg med öppen källkod för att visualisera genetiken bakom spridningen av virusutbrott .

Dess syfte är att stödja folkhälsoåtgärder och övervakning genom att underlätta förståelsen av spridningen och utvecklingen av patogener . Nextstrain-plattformen startades 2015. Kod utvecklad av Nextstrain görs allmänt tillgänglig, via till exempel github.com och dess data är tillgänglig och synlig i tillgänglig form via sidorna på webbplatsen.

Ansökningar

Enligt deras hemsida upprätthåller Nextstrain-teamet en uppdaterad genomisk analys av var och en av följande patogener:

Covid-19 pandemi

Nextstrain och dess resultat har citerats flitigt under covid-19 -pandemin. ^{[ opålitlig källa? ]}

Tilldela

fick Nextstrain och Trevor Bedford (docent, Fred Hutchinson Cancer Research Center ) ett Webby Special Achievement Award för webbverktyget.

Se även

externa länkar

Officiell hemsida