Mycolicibacterium
| Mycolicibacterium | |
|---|---|
| Vetenskaplig klassificering | |
| Domän: | Bakterie |
| Provins: | Actinomycetota |
| Klass: | Actinomycetia |
| Beställa: | Mycobacteriales |
| Familj: | Mycobacteriaceae |
| Släkte: |
Mycolicibacterium Gupta et al. 2018 |
| Typ art | |
|
Mycolicibacterium fortuitum (da Costa Cruz 1938) Gupta et al. 2018
|
|
| Art | |
|
Se text. |
|
Mycolicibacterium är ett släkte av grampositiva stavformade bakterier i familjen Mycobacteriaceae från ordningen Mycobacteriales .
Medlemmar av Mycolicibacterium avgränsades från det större släktet Mycobacterium 2018 av Gupta et al. baserat på bevis från olika fylogenetiska träd konstruerade baserat på konserverade genomsekvenser, jämförande genomiska analyser och genomsnittliga aminosyraidentitetsvärden. Utöver detta släkte föreslog studien en uppdelning av Mycobacterium i totalt fem distinkta släkten, som möttes av visst motstånd av en del av det vetenskapliga samfundet. Resistensen grundade sig på att Mycobacterium innehåller några kliniskt relevanta arter och namnändringar kan orsaka förvirring bland läkare och andra forskare.
År 2020, Yamada et al. analyserade de grundläggande morfologiska egenskaperna hos de nya släktena, inklusive celldiameter, celllängd, cellomkrets, cellcirkularitet och bildförhållande, och fastställde att det fanns betydande skillnader mellan de fem släktena, vilket stödde den nya uppdelningen.
Namnet Mycolicibacterium kommer från det latinska substantivet acidum mycolicum (översätts till mykolsyra) och det latinska substantivet bakterie (översätts till liten stav). Tillsammans hänvisar namnet till ett släkte av mykolsyra som innehåller stavformade bakterier.
Biokemiska egenskaper och molekylära signaturer
Mycolicibacterium är ett släkte av snabbt växande bakterier, som tar mindre än sju dagar att bilda kolonier. Medlemmarna är också icke-kromogena (producerar inte pigment) och är positiva för 3-dagars arylsulfatasaktivitetstestet, nitratreduktas och järnupptag. De flesta arter är saprofytiska och kan bearbeta ruttnande organiskt material för näringsämnen. Även om medlemmar av detta släkte inte anses vara patogena, har vissa arter rapporterats orsaka infektioner och sjukdomar. Genomstorleken för Mycolicibacterium är mellan 3,95–8,0 Mbp och deras G+C-innehåll är mellan 65,4–70,3 mol%.
Fyra konserverade signaturindelar (CSI) identifierades genom genomiska analyser som unikt närvarande i detta släkte i följande proteiner: LacI-familjen transkriptionsregulator, cyklas , CDP-diacylglycerol-glycerol-3-fosfat-3-fosfatidyltransferas och CDP-diacylglycerol-serin O-serin fosfatidyltransferas . Dessa CSI fungerar som ett tillförlitligt molekylärt medel för att särskilja medlemmar av denna Mycolicibacterium från andra släkten i familjen Mycobacteriaceae och alla andra bakterier. Dessutom identifierades 10 unika konserverade signaturproteiner (CSPs) för detta släkte.
Arter
| Mycolicibacteriums fylogeni | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Anteckningar |
Mycolicibacterium omfattar följande arter:
- " M. acapulense " Gupta et al. 2018
- M. agri (Tsukamura 1981) Gupta et al. 2018
- M. aichiense (Tsukamura 1981) Gupta et al. 2018
- M. alvei (Ausina et al. 1992) Gupta et al. 2018
- M. anyangense (Kim et al. 2015) Gupta et al. 2018
- M. arabiense (Zhang et al. 2013) Gupta et al. 2018
- M. arcueilense (Konjek et al. 2016) Gupta et al. 2018
- M. aromaticivorans (Hennessee et al. 2009) Gupta et al. 2018
- M. aubagnense (Adékambi et al. 2006) Gupta et al. 2018
- M. aurum (Tsukamura 1966) Gupta et al. 2018
- M. austroafricanum (Tsukamura et al. 1983) Gupta et al. 2018
- M. bacteremicum (Brown-Elliott et al. 2012) Gupta et al. 2018
- M. baixiangningiae Cheng et al. 2021
- M. boenickei (Schinsky et al. 2004) Gupta et al. 2018
- M. brisbanense (Schinsky et al. 2004) Gupta et al. 2018
- M. brumae (Luquin et al. 1993) Gupta et al. 2018
- M. canariasense (Jiménez et al. 2004) Gupta et al. 2018
- M. celeriflavum (Shahraki et al. 2015) Gupta et al. 2018
- M. chitae (Tsukamura 1967) Gupta et al. 2018
- M. chlorophenolicum (Apajalahti et al. 1986) Gupta et al. 2018
- M. chubuense (Tsukamura 1981) Gupta et al. 2018
- M. conceptionense (Adékambi et al. 2006) Gupta et al. 2018
- M. confluentis (Kirschner et al. 1992) Gupta et al. 2018
- M. cosmeticum (Cooksey et al. 2004) Gupta et al. 2018
- M. crocinum (Hennessee et al. 2009) Gupta et al. 2018
- M. diernhoferi (Tsukamura et al. 1983) Gupta et al. 2018
- M. doricum (Tortoli et al. 2001) Gupta et al. 2018
- M. duvalii (Stanford och Gunthorpe 1971) Gupta et al. 2018
- M. elephantis (Shojaei et al. 2000) Gupta et al. 2018
- M. fallax (Lévy-Frébault et al. 1983) Gupta et al. 2018
- M. farcinogenes (Chamoiseau 1973) Gupta et al. 2018
- M. flavescens (Bojalil et al. 1962) Gupta et al. 2018
- M. fluoranthenivorans (Hormisch et al. 2006) Gupta et al. 2018
- M. fortuitum (da Costa Cruz 1938) Gupta et al. 2018
- M. frederiksbergense (Willumsen et al. 2001) Gupta et al. 2018
- M. gadium (Casal och Calero 1974) Gupta et al. 2018
- M. gilvum (Stanford och Gunthorpe 1971) Gupta et al. 2018
- " M. goodii " (Brown et al. 1999) Gupta et al. 2018
- " M. gossypii " Huang et al. 2021
- M. hassiacum (Schröder et al. 1997) Gupta et al. 2018
- M. helvum (Tran och Dahl 2016) Gupta et al. 2018
- M. hippocampi (Balcázar et al. 2014) Gupta et al. 2018
- M. hodleri (Kleespies et al. 1996) Gupta et al. 2018
- M. holsaticum (Richter et al. 2002) Gupta et al. 2018
- M. houstonense (Schinsky et al. 2004) Gupta et al. 2018
- M. insubricum (Tortoli et al. 2009) Gupta et al. 2018
- M. iranicum (Shojaei et al. 2013) Gupta et al. 2018
- " M. komanii " (Gcebe et al. 2018) Gupta et al. 2018
- M. komossense (Kazda och Müller 1979) Gupta et al. 2018
- M. litorale (Zhang et al. 2012) Gupta et al. 2018
- M. llatzerense (Gomila et al. 2008) Gupta et al. 2018
- M. lutetiense (Konjek et al. 2016) Gupta et al. 2018
- M. madagascariense (Kazda et al. 1992) Gupta et al. 2018
- M. mageritense (Domenech et al. 1997) Gupta et al. 2018
- M. malmesburyense (Gcebe et al. 2017) Gupta et al. 2018
- M. mengxianglii Cheng et al. 2021
- M. monacense (Reischl et al. 2006) Gupta et al. 2018
- " M. montmartrense " (Konjek et al. 2016) Gupta et al. 2018
- M. moriokaense (Tsukamura et al. 1986) Gupta et al. 2018
- M. mucogenicum (Springer et al. 1995) Gupta et al. 2018
- M. murale (Vuorio et al. 1999) Gupta et al. 2018
- M. neoaurum (Tsukamura 1972) Gupta et al. 2018
- M. neworleansense (Schinsky et al. 2004) Gupta et al. 2018
- M. nivoides Dahl et al. 2021
- M. novocastrense (Shojaei et al. 1997) Gupta et al. 2018
- M. obuense (Tsukamura och Mizuno 1981) Gupta et al. 2018
- M. oryzae (Ramaprasad et al. 2016) Gupta et al. 2018
- M. pallens (Hennessee et al. 2009) Gupta et al. 2018
- M. parafortuitum (Tsukamura 1966) Gupta et al. 2018
- M. peregrinum (Kusunoki och Ezaki 1992) Gupta et al. 2018
- M. phlei (Lehmann och Neumann 1899) Gupta et al. 2018
- M. phocaicum (Adékambi et al. 2006) Gupta et al. 2018
- M. porcinum (Tsukamura et al. 1983) Gupta et al. 2018
- M. poriferae (Padgitt och Moshier 1987) Gupta et al. 2018
- M. psychrotolerans (Trujillo et al. 2004) Gupta et al. 2018
- M. pulveris (Tsukamura et al. 1983) Gupta et al. 2018
- M. pyrennivorans (Derz et al. 2004) Gupta et al. 2018
- M. rhodesiae (Tsukamura 1981) Gupta et al. 2018
- M. rufum (Hennessee et al. 2009) Gupta et al. 2018
- M. rutilum (Hennessee et al. 2009) Gupta et al. 2018
- M. sarraceniae (Tran och Dahl 2016) Gupta et al. 2018
- M. sediminis (Zhang et al. 2013) Gupta et al. 2018
- M. senegalense (Chamoiseau 1973) Gupta et al. 2018
- M. septicum (Schinsky et al. 2000) Gupta et al. 2018
- M. setense (Lamy et al. 2008) Gupta et al. 2018
- M. smegmatis (Trevisan 1889) Gupta et al. 2018
- M. sphagni (Kazda 1980) Gupta et al. 2018
- M. stellerae Nouioui et al. 2019
- M. thermoresistibile (Tsukamura 1966) Gupta et al. 2018
- M. tokaiense (Tsukamura 1981) Gupta et al. 2018
- M. tusciae (Tortoli et al. 1999) Gupta et al. 2018
- M. vaccae (Bönicke och Juhasz 1964) Gupta et al. 2018
- " M. vinylchloridicum " Cortes-Albayay et al. 2021
- M. vulneris (van Ingen et al. 2009) Gupta et al. 2018
- M. wolinskyi (Brown et al. 1999) Gupta et al. 2018