Morpheein

Ej att förväxla med morfin .
Proteiner som fungerar som morfeiner illustreras med en tärningsanalogi där en tärning kan förvandlas till två olika former, kubisk och tetraedrisk. De illustrerade sammansättningarna tillämpar en regel att tärningsytan med en punkt måste kontakta tärningsytan med fyra fläckar. För att uppfylla regeln för varje tärning i en sammansättning kan den kubiska tärningen bara bilda en tetramer och de tetraedriska tärningarna kan bara sättas ihop till en pentamer. Detta är analogt med två olika konformationer (morfeinformer) av en proteinsubenhet som var och en dikterar sammansättning till en annan oligomer. Alla tärningar i en sammansättning måste ha samma form innan montering. Således måste till exempel tetrameren gå isär, och dess komponenttärningar måste ändra form till en pyramid innan de kan delta i monteringen till en pentamer.

Morfeiner är proteiner som kan bilda två eller flera olika homo- oligomerer (morfeinformer), men som måste gå isär och ändra form för att omvandlas mellan former. Den alternativa formen kan återmonteras till en annan oligomer. Formen på underenheten bestämmer vilken oligomer som bildas. Varje oligomer har ett ändligt antal subenheter ( stökiometri) . Morfeiner kan interkonvertera mellan former under fysiologiska förhållanden och kan existera som en jämvikt av olika oligomerer. Dessa oligomerer är fysiologiskt relevanta och är inte felveckat protein; detta skiljer morfeiner från prioner och amyloid . De olika oligomererna har distinkt funktionalitet. Interkonvertering av morfeinformer kan vara en strukturell grund för allosterisk reglering , en idé som noterades för många år sedan och som senare återupplivades. En mutation som ändrar den normala jämvikten hos morfeinformer kan tjäna som grund för en konformationssjukdom. Funktioner hos morfein kan utnyttjas för att upptäcka läkemedel . Tärningsbilden (fig 1) representerar en morfein-jämvikt som innehåller två olika monomera former som dikterar montering av en tetramer eller en pentamer. Det enda proteinet som är etablerat för att fungera som ett morfein är porfobilinogensyntas, även om det finns förslag i hela litteraturen att andra proteiner kan fungera som morfein (för mer information se "Tabell över förmodade morfeiner" nedan).

Konsekvenser för upptäckt av läkemedel

Konformationsskillnader mellan subenheter av olika oligomerer och relaterade funktionella skillnader hos ett morfein ger en startpunkt för läkemedelsupptäckt. Proteinfunktionen är beroende av den oligomera formen; därför kan proteinets funktion regleras genom att skifta formernas jämvikt. En liten molekylförening kan förskjuta jämvikten antingen genom att blockera eller gynna bildningen av en av oligomererna. Jämvikten kan skiftas med hjälp av en liten molekyl som har en föredragen bindningsaffinitet för endast en av de alternativa morfeinformerna. En hämmare av porfobilinogensyntas med denna verkningsmekanism har dokumenterats.


Implikationer för allosterisk reglering

Morfeinmodellen för allosterisk reglering har likheter med och skillnader från andra modeller. Den samordnade modellen (Monod, Wyman och Changeux (MWC)-modellen) av allosterisk reglering kräver att alla underenheter är i samma konformation eller tillstånd inom en oligomer som morfeinmodellen. Varken denna modell eller den sekventiella modellen (Koshland-, Nemethy- och Filmer-modellen) tar dock hänsyn till att proteinet kan dissociera för att interkonvertera mellan oligomerer. Icke desto mindre, kort efter att dessa teorier beskrevs, föreslog två grupper av arbetare vad som nu kallas morfeinmodellen och visade att den stod för det reglerande beteendet hos glutamatdehydrogenas . Kurganov och Friedrich diskuterade modeller av detta slag utförligt i sina böcker.

Implikationer för undervisning om proteinstruktur-funktionssamband

Det lärs allmänt ut [ citat behövs ] att en given aminosyrasekvens endast kommer att ha en fysiologiskt relevant (nativ) kvartär struktur ; morpheins utmanar detta koncept. Morfeinmodellen kräver inga stora förändringar i det grundläggande proteinvecket. Konformationsskillnaderna som åtföljer omvandling mellan oligomerer kan likna de proteinrörelser som är nödvändiga för funktionen hos vissa proteiner. Morpheein-modellen belyser vikten av konformationell flexibilitet för proteinfunktionalitet och erbjuder en potentiell förklaring till proteiner som visar icke- Michaelis-Menten kinetik , hysteres och/eller proteinkoncentrationsberoende specifik aktivitet .

Implikationer för att förstå den strukturella grunden för sjukdom

Termen "konformationssjukdom" omfattar generellt mutationer som resulterar i felveckade proteiner som aggregerar, såsom Alzheimers och Creutzfeldt-Jakobs sjukdomar. I ljuset av upptäckten av morfeiner kan denna definition emellertid utökas till att inkludera mutationer som förändrar en jämvikt av alternativa oligomera former av ett protein. Ett exempel på en sådan konformationssjukdom är ALAD- porfyri , som är ett resultat av en mutation av porfobilinogensyntas som orsakar en förändring i dess morfeeinjämvikt.

Tabell över proteiner vars publicerade beteende överensstämmer med det hos ett morfein

Protein Exempel art EG-nummer CAS-nummer Alternativa oligomerer Bevis
Acetyl-CoA-karboxylas -1 Gallus domesticus EC 6.4.1.2 9023-93-2 inaktiv dimer, aktiv dimer, större Effektormolekyler påverkar multimerisering, multipla/ protein månskensfunktioner
a-acetylgalaktosaminidas Bos taurus EC 4.3.2.2 9027-81-0 inaktiv monomer, aktiv tetramer Substratbindning/omsättning påverkar multimerisering, Proteinkoncentrationsberoende specifik aktivitet, Olika sammansättningar har olika aktiviteter, Konformationellt distinkta oligomera former.
Adenylosuccinatlyas Bacillus subtilis EC 4.3.2.2 9027-81-0 monomer, dimer, trimer, tetramer Mutationer förskjuter oligomerernas jämvikt, oligomerberoende kinetiska parametrar, proteinkoncentrationsberoende molekylvikt
Aristolochensyntas Penicillium roqueforti EC 4.2.3.9 94185-89-4 monomer, högre ordning Proteinkoncentrationsberoende specifik aktivitet
L - Asparaginas Leptosphaeria michotii EC 3.5.1.1 9015-68-3 dimer, tetramer, inaktiv oktamer Substratbindning/omsättning påverkar multimerisering
Aspartokinas Escherichia coli EC 2.7.2.4 & EC 1.1.1.3 9012-50-4 monomer, dimer, tetramer Flera/ protein månskensfunktioner , konformationsmässigt distinkta oligomera former
ATPas för ABCA1-transportören Homo sapiens dimer, tetramer Substratbindning/omsättning påverkar multimerisering
Biotin—(acetyl-CoA-karboxylas) ligas holoenzymsyntetas Escherichia coli EC 6.3.4.15 37340-95-7 monomer, dimer Flera/ protein månskensfunktioner , Olika sammansättningar har olika aktiviteter
Chorismat mutas Escherichia coli EC 5.4.99.5 9068-30-8 dimer, trimer, hexamer Konformationsmässigt distinkta oligomera former
Citratsyntas Escherichia coli EC 2.3.3.1 9027-96-7 monomer, dimer, trimer, tetramer, pentamer, hexamer, dodecamer Substratbindning/omsättning påverkar multimerisering, Karakteriserad jämvikt av oligomerer, Proteinkoncentrationsberoende specifik aktivitet, pH-beroende oligomer jämvikt
Cyanovirin-N Nostoc ellipsosporum 918555-82-5 monomer och domänbytta dimer Karakteriserad jämvikt av oligomerer, konformationsmässigt distinkta oligomera former
3-oxosyra CoA-transferas Sus scrofa domestica EC 2.8.3.5 9027-43-4 dimer, tetramer Kromatografiskt separerbara oligomerer, Substrat kan företrädesvis stabilisera en form
Cystationin β-syntas Homo sapiens EC 4.2.1.22 9023-99-8 multipel - sträcker sig från dimer till 16-mer Effektormolekyler påverkar multimerisering, Mutationer förskjuter oligomerernas jämvikt, Olika sammansättningar har olika aktiviteter, sjukdomsframkallande mutationer på platser långt från det aktiva stället
D -aminosyraoxidas EC 1.4.3.3 9000-88-8 monomerer, dimerer, oligomerer av högre ordning Oligomerberoende kinetiska parametrar
Dihydrolipoamiddehydrogenas Sus scrofa domestica EC 1.8.1.4 9001-18-7 monomer, två olika dimerformer, tetramer Flera/ protein månskensfunktioner , Olika sammansättningar har olika aktiviteter, pH-beroende oligomer jämvikt, konformationsmässigt distinkta oligomera former
Dopamin β-monooxygenas Bos taurus EC 1.14.17.1 9013-38-1 dimerer, tetramerer Effektormolekyler påverkar multimerisering, Karakteriserad jämvikt av oligomerer, Oligomerberoende kinetiska parametrar
Geranylgeranylpyrofosfatsyntas / Farnesyltransferas Homo sapiens EC 2.5.1.29 9032-58-0 hexamer, oktamer Effektormolekyler påverkar multimerisering
GDP-mannos 6-dehydrogenas Pseudomonas aeruginosa EC 1.1.1.132 37250-63-8 trimer, 2 tetramerer och hexamer Proteinkoncentrationsberoende specifik aktivitet, Kinetisk hysteres
Glutamatdehydrogenas Bos taurus EC 1.4.1.2 9001-46-1 aktiva och inaktiva hexamerer, högre ordning Effektormolekyler påverkar multimerisering, Karakteriserad jämvikt av oligomerer
Glutamat racemase Mycobacterium tuberculosis, Escherichia coli, Bacillus subtilis, Aquifex pyrophilus EC 5.1.1.3 9024-08-02 monomer, 2 dimerer, tetramer Multipel/ protein månskensfunktioner , Karakteriserad jämvikt av oligomerer, Konformationsmässigt distinkta oligomera former
Glyceraldehyd-3-fosfatdehydrogenas Oryctolagus cuniculas, Sus scrofa domestica EC 1.2.1.12 1.2.1.12 9001-50-7 monomer, dimer, tetramer Karakteriserad jämvikt av oligomerer, Olika sammansättningar har olika aktiviteter
Glycerolkinas Escherichia coli EC 2.7.1.30 9030-66-4 monomer och 2 tetramerer Karakteriserad jämvikt av oligomerer, konformationsmässigt distinkta oligomera former, effektorfunktioner genom att förhindra domänrörelse
HIV- Integras Humant immunbristvirus-1 EC 2.7.7.- monomer, dimer, tetramer, högre ordning Effektormolekyler påverkar multimerisering, Flera/ protein månskensfunktioner , Olika sammansättningar har olika aktiviteter
HPr-Kinas/fosfatas Bacillus subtilis, Lactobacillus casei, Mycoplasma pneumoniae, Staphylococcus xylosus EC 2.7.1.- / EC 3.1.3.- 9026-43-1 monomerer, dimerer, trimerer, hexamerer Effektormolekyler påverkar multimerisering, Multipel/ protein månskensfunktioner , Olika sammansättningar har olika aktiviteter, pH-beroende oligomer jämvikt
Laktatdehydrogenas Bacillus stearothermophilus EC 1.1.1.27 9001-60-9 2 dimerer, tetramer Effektormolekyler påverkar multimerisering, Karakteriserad jämvikt av oligomerer, Proteinkoncentrationsberoende specifik aktivitet, Mutationer förskjuter oligomerernas jämvikt, Oligomerberoende kinetiska parametrar, Konformationsmässigt distinkta oligomera former
Lon proteas Escherichia coli, Mycobacterium smegmatis EC 3.4.21.53 79818-35-2 monomer, dimer, trimer, tetramer Effektormolekyler påverkar multimerisering, Substratbindning/omsättning påverkar multimerisering, Proteinkoncentrationsberoende specifik aktivitet, Kinetisk hysteres
Mitokondriell NAD(P) + Äppelsyraenzym / [[malatdehydrogenas (oxaloacetat-dekarboxylerande) (NADP + )]] Homo sapiens EC 1.1.1.40 9028-47-1 monomer, 2 dimerer, tetramer Effektormolekyler påverkar multimerisering, mutationer förskjuter oligomerernas jämvikt, kinetisk hysteres,
Peroxiredoxiner Salmonella typhimurium EM 1.6.4.- & EM 1.11.1.15 207137-51-7 2 dimerer, decamer Konformationsmässigt distinkta oligomera former, olika sammansättningar har olika aktiviteter
Fenylalaninhydroxylas Homo sapiens EC 1.14.16.1 9029-73-6 högaktivitetstetramer, lågaktivitetstetramer Substratbindning/omsättning påverkar multimerisering, konformationsmässigt distinkta oligomera former
Fosfoenolpyruvatkarboxylas Escherichia coli, Zea mays EC [1] 9067-77-0 inaktiv dimer, aktiv tetramer Effektormolekyler påverkar multimerisering, Karakteriserad jämvikt av oligomerer, Kinetisk hysteres, Konformationellt distinkta oligomera former
Fosfofruktokinas Bacillus stearothermophilus, Thermus thermophilus EC 2.7.1.11 9001-80-3 inaktiv dimer, aktiv tetramer Effektormolekyler påverkar multimerisering, Karakteriserad jämvikt av oligomerer
Polyfenoloxidas Agaricus bisporus, Malus domestica, Lactuca sativa L. EC 1.10.3.1 9002-10-2 monomer, trimer, tetramer, oktamer, dodecamer Flera/ proteinmånljusfunktioner , Substratbindning/omsättning påverkar multimerisering, Olika sammansättningar har olika aktiviteter, Kinetisk hysteres
Porfobilinogensyntas Drosophila melanogaster, Danio rerio EC 4.2.1.24 9036-37-7 dimer, hexamer, oktamer PBGS är prototypen morfein.
Pyruvatkinas Homo sapiens EC 2.7.1.40 9001-59-6 aktiva och inaktiva dimerer, aktiv tetramer, monomer, trimer, pentamer Konformationsmässigt distinkta oligomera former
Ribonukleas A Bos taurus EC 3.1.27.5 3.1.27.5 9901-99-4 monomer, dimer, trimer, tetramer, hexamer, pentamer, högre ordning Flera/ protein månskensfunktioner , Olika sammansättningar har olika aktiviteter, Konformationsmässigt distinkta oligomera former
Ribonukleotidreduktas Mus musculus EC 1.17.4.1 9047-64-7 tetramer, hexamer Effektormolekyler påverkar multimerisering
S- adenosyl- L -homocysteinhydrolas Dictyostelium discoideum EC 3.3.1.1 9025-54-1 tetramer och andra Effektormolekyler påverkar multimerisering
Biologiskt nedbrytande treonindehydratas / treonin ammoniak-lyas Escherichia coli EC 4.3.1.19 4.3.1.19 774231-81-1 2 monomerer, 2 tetramerer Effektormolekyler påverkar multimerisering, Karakteriserad jämvikt av oligomerer, Olika sammansättningar har olika aktiviteter
β- Tryptas Homo sapiens EC 3.4.21.59 97501-93-4 aktiva och inaktiva monomerer, aktiva och inaktiva tetramerer Proteinkoncentrationsberoende specifik aktivitet, Karakteriserad jämvikt av oligomerer
Tumörnekrosfaktor-α Homo sapiens 94948-61-5 monomer, dimer, trimer Olika församlingar har olika aktiviteter
Uracil fosforibosyltransferas Escherichia coli EC 2.4.2.9 9030-24-4 trimer, pentamer Effektormolekyler påverkar multimerisering, Substratbindning/omsättning påverkar multimerisering, Olika sammansättningar har olika aktiviteter
  1. ^ a b c d e   Jaffe, Eileen K. (2005). "Morpheeins - ett nytt strukturellt paradigm för allosterisk reglering". Trender inom biokemiska vetenskaper . 30 (9): 490–7. doi : 10.1016/j.tibs.2005.07.003 . PMID 16023348 .
  2. ^ a b c    Breinig, Sabine; Kervinen, Jukka; Stith, Linda; Wasson, Andrew S; Fairman, Robert; Wlodawer, Alexander; Zdanov, Alexander; Jaffe, Eileen K (2003). "Kontroll av tetrapyrrolbiosyntes genom alternativa kvartära former av porfobilinogensyntas". Naturens strukturbiologi . 10 (9): 757–63. doi : 10.1038/nsb963 . PMID 12897770 . S2CID 24188785 .
  3. ^ a b   Frieden, C (1967). "Behandling av enzymkinetiska data. II. Multisite-fallet: jämförelse av allosteriska modeller och en möjlig ny mekanism" . J. Biol. Chem . 242 (18): 4045–4052. doi : 10.1016/S0021-9258(18)95776-5 . PMID 6061697 .
  4. ^ a b   Nichol, LW; Jackson, WJH; Winzor, DJ (1967). "En teoretisk studie av bindningen av små molekyler till ett polymeriserande proteinsystem: en modell för allosteriska effekter". Biokemi . 6 (8): 2449–2456. doi : 10.1021/bi00860a022 . PMID 6049469 .
  5. ^ a b c    Lawrence, Sarah H.; Ramirez, Ursula D.; Tang, Lei; Fazliyez, Farit; Kundrat, Lenka; Markham, George D.; Jaffe, Eileen K. (2008). "Formskiftning leder till upptäckt av småmolekylära allosteriska läkemedel" . Kemi & biologi . 15 (6): 586–96. doi : 10.1016/j.chembiol.2008.04.012 . PMC 2703447 . PMID 18559269 .
  6. ^ a b c    Selwood, Trevor; Jaffe, Eileen K. (2012). "Dynamiskt dissocierande homo-oligomerer och kontroll av proteinfunktion" . Arkiv för biokemi och biofysik . 519 (2): 131–43. doi : 10.1016/j.abb.2011.11.020 . PMC 3298769 . PMID 22182754 .
  7. ^ a b    Jaffe, Eileen K.; Stith, Linda (2007). "ALAD-porfyri är en konformationssjukdom" . American Journal of Human Genetics . 80 (2): 329–37. doi : 10.1086/511444 . PMC 1785348 . PMID 17236137 .
  8. ^    Jaffe, Eileen K. (2010). "Morpheeins – en ny väg för upptäckt av allosteriska droger" . The Open Conference Proceedings Journal . 1 :1–6. doi : 10.2174/2210289201001010001 . PMC 3107518 . PMID 21643557 .
  9. ^   Tang, L.; Stith, L; Jaffe, EK (2005). "Substrat-inducerad interkonversion av protein kvartära strukturisoformer" . Journal of Biological Chemistry . 280 (16): 15786–93. doi : 10.1074/jbc.M500218200 . PMID 15710608 .
  10. ^    Jaffe, Eileen K.; Lawrence, Sarah H. (2012). "Allosteri och den dynamiska oligomeriseringen av porfobilinogensyntas" . Arkiv för biokemi och biofysik . 519 (2): 144–53. doi : 10.1016/j.abb.2011.10.010 . PMC 3291741 . PMID 22037356 .
  11. ^ a b    Lawrence, Sarah H.; Jaffe, Eileen K. (2008). "Utöka begreppen i proteinstruktur-funktionsförhållanden och enzymkinetik: Undervisning med hjälp av morfeiner" . Biokemi och molekylärbiologiutbildning . 36 (4): 274–283. doi : 10.1002/bmb.20211 . PMC 2575429 . PMID 19578473 .
  12. ^ a b   Monod, Jacques; Changeux, Jean-Pierre; Jacob, François (1963). "Allosteriska proteiner och cellulära kontrollsystem". Journal of Molecular Biology . 6 (4): 306–29. doi : 10.1016/S0022-2836(63)80091-1 . PMID 13936070 .
  13. ^ a b   Monod, Jacques; Wyman, Jeffries; Changeux, Jean-Pierre (1965). "Om allosteriska övergångars natur: En rimlig modell". Journal of Molecular Biology . 12 : 88–118. doi : 10.1016/S0022-2836(65)80285-6 . PMID 14343300 .
  14. ^   Koshland, DE (1970). "7 Den molekylära grunden för enzymreglering" . Enzymen volym 1 . Enzymerna. Vol. 1. s. 341–396. doi : 10.1016/S1874-6047(08)60170-5 . ISBN 978-0-12-122701-2 .
  15. ^   Koshland, DE; Nemethy, G.; Filmer, D. (1966). "Jämförelse av experimentella bindningsdata och teoretiska modeller i proteiner som innehåller underenheter". Biokemi . 5 (1): 365–85. doi : 10.1021/bi00865a047 . PMID 5938952 .
  16. ^ Frieden, C; Colman, RF (1967). "Glutamatdehydrogenaskoncentration som en determinant i effekten av purinnukleotider på enzymaktiviteten" . J. Biol. Chem . 242 : 1705–1715. doi : 10.1016/S0021-9258(18)96059-X .
  17. ^   Kurganov, BI (1982). Allosteriska enzymer: Kinetiskt beteende . Chichester: Wiley–Interscience. s. 151–248. ISBN 978-0471101956 .
  18. ^   Friedrich, P (1984). Supramolecular Enzyme Organization: Quarterary Structure and Beyond . Oxford: Pergamon Press. s. 66–71. ISBN 0-08-026376-3 .
  19. ^   Gerstein, Mark; Echols, Nathaniel (2004). "Utforska utbudet av proteinflexibilitet, ur ett strukturellt proteomikperspektiv". Aktuell åsikt i kemisk biologi . 8 (1): 14–9. doi : 10.1016/j.cbpa.2003.12.006 . PMID 15036151 .
  20. ^    Carrell Robin W; Lomas, David A (1997). "Konformationssjukdom". The Lancet . 350 (9071): 134–8. doi : 10.1016/S0140-6736(97)02073-4 . PMID 9228977 . S2CID 39124185 .
  21. ^ a b   Boone, AN; Brownsey, RW; Elliott, JE; Kulpa, JE; Lee, WM (2006). "Reglering av acetyl-CoA-karboxylas". Transaktioner i det biokemiska samhället . 34 (2): 223–7. doi : 10.1042/BST20060223 . PMID 16545081 .
  22. ^   Shen, Yang; Volrath, Sandra L.; Weatherly, Stephanie C.; Elich, Tedd D.; Tong, Liang (2004). "En mekanism för den potentiella hämningen av eukaryot acetyl-koenzym a karboxylas av Soraphen A, en makrocyklisk polyketidnaturprodukt" . Molekylär cell . 16 (6): 881–91. doi : 10.1016/j.molcel.2004.11.034 . PMID 15610732 .
  23. ^ a b c   Weissmann, Bernard; Wang, Ching-Te (1971). "Association-dissociation och onormal kinetik för bovint a-acetylgalaktosaminidas". Biokemi . 10 (6): 1067–72. doi : 10.1021/bi00782a021 . PMID 5550813 .
  24. ^ a b c   Weissmann, Bernard; Hinrichsen, Dorotea F. (1969). "A-acetylgalaktosaminidas från däggdjur. Förekomst, partiell rening och verkan på kopplingar i submaxillära muciner". Biokemi . 8 (5): 2034–43. doi : 10.1021/bi00833a038 . PMID 5785223 .
  25. ^   De Zoysa Ariyananda, Lushanti; Colman, Roberta F. (2008). "Utvärdering av typer av interaktioner i Subunit Association i Bacillus subtilis Adenylosuccinate Lyase". Biokemi . 47 (9): 2923–34. doi : 10.1021/bi701400c . PMID 18237141 .
  26. ^ a b c   Palenchar, Jennifer Brosius; Colman, Roberta F. (2003). "Karakterisering av en mutant Bacillus subtilis adenylosuccinatlyas ekvivalent med ett mutant enzym som finns i human adenylosuccinatlyasbrist: asparagin 276 spelar en viktig strukturell roll". Biokemi . 42 (7): 1831–41. doi : 10.1021/bi020640+ . PMID 12590570 .
  27. ^   Hohn, Thomas M.; Plattner, Ronald D. (1989). "Rening och karakterisering av sesquiterpene cyclase aristolochene syntas från Penicillium roqueforti". Arkiv för biokemi och biofysik . 272 (1): 137–43. doi : 10.1016/0003-9861(89)90204-X . PMID 2544140 .
  28. ^   Caruthers, JM; Kang, I; Rynkiewicz, MJ; Cane, DE; Christianson, DW (2000). "Kristallstrukturbestämning av aristolochensyntas från blåmögelostformen, Penicillium roqueforti" . Journal of Biological Chemistry . 275 (33): 25533–9. doi : 10.1074/jbc.M000433200 . PMID 10825154 .
  29. ^ Jerebzoff-Quintin, Simonne; Jerebzoff, Stephan (1985). "L-asparaginasaktivitet i Leptosphaeria michotii. Isolering och egenskaper hos två former av enzymet". Physiologia Plantarum . 64 : 74–80. doi : 10.1111/j.1399-3054.1985.tb01215.x .
  30. ^    Yun, Mi-Kyung; Nurse, Amanda; White, Stephen W.; Rock, Charles O.; Heath, Richard J. (2007). "Kristallstruktur och allosterisk reglering av det cytoplasmatiska Escherichia coli l-Asparaginas I" . Journal of Molecular Biology . 369 (3): 794–811. doi : 10.1016/j.jmb.2007.03.061 . PMC 1991333 . PMID 17451745 .
  31. ^     Garel, J.-R. (1980). "Sekventiell vikning av ett bifunktionellt allosteriskt protein" . Proceedings of the National Academy of Sciences . 77 (6): 3379–3383. Bibcode : 1980PNAS...77.3379G . doi : 10.1073/pnas.77.6.3379 . JSTOR 8892 . PMC 349619 . PMID 6774337 .
  32. ^ a b   Kotaka, M.; Ren, J.; Lockyer, M.; Hawkins, AR; Stammers, DK (2006). "Strukturer av R- och T-tillstånd Escherichia coli Aspartokinase III: MEKANISMER FÖR DEN ALLOSTERISKA ÖVERGÅNGEN OCH HÄMNING AV LYSIN" . Journal of Biological Chemistry . 281 (42): 31544–52. doi : 10.1074/jbc.M605886200 . PMID 16905770 .
  33. ^   Ogilvie, JW; Vickers, LP; Clark, RB; Jones, MM (1975). "Aspartokinas I-homoserindehydrogenas I från Escherichia coli K12 (lambda). Aktivering av monovalenta katjoner och en analys av effekten av adenosintrifosfat-magnesiumjonkomplexet på denna aktiveringsprocess" . Journal of Biological Chemistry . 250 (4): 1242–50. doi : 10.1016/S0021-9258(19)41805-X . PMID 163250 .
  34. ^ a b   Trompier, D.; Alibert, M; Davanture, S; Hamon, Y; Pierres, M; Chimini, G (2006). "Övergång från dimerer till högre oligomera former sker under ABCA1-transportörens ATPas-cykel" . Journal of Biological Chemistry . 281 (29): 20283–90. doi : 10.1074/jbc.M601072200 . PMID 16709568 .
  35. ^ a b   Eisenstein, Edward; Beckett, Dorothy (1999). "Dimerisering av EscherichiacoliBiotin Repressor: Corepressor Funktion i Protein Assembly". Biokemi . 38 (40): 13077–84. doi : 10.1021/bi991241q . PMID 10529178 .
  36. ^   Streaker, Emily D.; Beckett, Dorothy (1998). "Koppling av platsspecifik DNA-bindning till proteindimerisering vid montering av biotinrepressor-biotinoperatorkomplexet". Biokemi . 37 (9): 3210–9. doi : 10.1021/bi9715019 . PMID 9485476 .
  37. ^    Vamvaca, Katherina; Butz, Maren; Walter, Kai U.; Taylor, Sean V.; Hilvert, Donald (2005). "Samtidig optimering av enzymaktivitet och kvartär struktur genom riktad evolution" . Proteinvetenskap . 14 (8): 2103–14. doi : 10.1110/ps.051431605 . PMC 2279322 . PMID 15987889 .
  38. ^ a b c d e   Tong, EK; Duckworth, Harry W. (1975). "Kvaternär struktur av citratsyntas från Escherichia coli K 12". Biokemi . 14 (2): 235–41. doi : 10.1021/bi00673a007 . PMID 1091285 .
  39. ^    Bewley, Carole A.; Gustafson, Kirk R.; Boyd, Michael R.; Covell, David G.; Bax, Ad; Clore, G. Marius; Gronenborn, Angela M. (1998). "Lösningsstruktur av cyanovirin-N, ett potent HIV-inaktiverande protein". Naturens strukturbiologi . 5 (7): 571–8. doi : 10.1038/828 . PMID 9665171 . S2CID 11367037 .
  40. ^    Yang, fan; Bewley, Carole A; Louis, John M; Gustafson, Kirk R; Boyd, Michael R; Gronenborn, Angela M; Clore, G. Marius; Wlodawer, Alexander (1999). "Kristallstruktur av cyanovirin-N, ett potent HIV-inaktiverande protein, visar oväntat domänbyte" . Journal of Molecular Biology . 288 (3): 403–12. doi : 10.1006/jmbi.1999.2693 . PMID 10329150 . S2CID 308708 .
  41. ^ a b   Barrientos, LG; Gronenborn, AM (2005). "Det mycket specifika kolhydratbindande proteinet cyanovirin-N: Struktur, anti-HIV/Ebola-aktivitet och möjligheter för terapi". Minirecensioner i medicinsk kemi . 5 (1): 21–31. doi : 10.2174/1389557053402783 . PMID 15638789 .
  42. ^ a b   Barrientos, LG; Louis, JM; Botos, I; Mori, T; Han, Z; O'Keefe, BR; Boyd, MR; Wlodawer, A; et al. (2002). "Den domänbytta dimeren av cyanovirin-N är i ett metastabilt veckat tillstånd: Avstämning av röntgen- och NMR-strukturer" . Struktur . 10 (5): 673–86. doi : 10.1016/S0969-2126(02)00758-X . PMID 12015150 .
  43. ^ a b c   Rochet, Jean-Christophe; Brownie, Edward R.; Oikawa, Kim; Hicks, Leslie D.; Fraser, Marie E.; James, Michael NG; Kay, Cyril M.; Bridger, William A.; et al. (2000). "Pig Heart CoA Transferase existerar som två oligomera former åtskilda av en stor kinetisk barriär". Biokemi . 39 (37): 11291–302. doi : 10.1021/bi0003184 . PMID 10985774 .
  44. ^   Frank, Nina; Kery, Vladimir; MacLean, Kenneth N.; Kraus, Jan P. (2006). "Lösningsmedel-tillgängliga cysteiner i humant cystationin-β-syntas: avgörande roll för cystein 431 i S-adenosyl-l-metioninbindning". Biokemi . 45 (36): 11021–9. doi : 10.1021/bi060737m . PMID 16953589 .
  45. ^ a b    Sen, Suvajit; Banerjee, Ruma (2007). "En patogen länkad mutation i den katalytiska kärnan av humant cystationin β-syntas stör allosterisk reglering och tillåter kinetisk karakterisering av en fullängdsdimer" . Biokemi . 46 (13): 4110–6. doi : 10.1021/bi602617f . PMC 3204387 . PMID 17352495 .
  46. ^   Kery, Vladimir; Poneleit, Loelle; Kraus, Jan P. (1998). "Trypsin-klyvning av mänskligt cystationin-β-syntas till en evolutionärt konserverad aktiv kärna: strukturella och funktionella konsekvenser". Arkiv för biokemi och biofysik . 355 (2): 222–32. doi : 10.1006/abbi.1998.0723 . PMID 9675031 .
  47. ^    Shan, Xiaoyin; Kruger, Warren D. (1998). "Korrigering av sjukdomsorsakande CBS-mutationer i jäst". Naturgenetik . 19 (1): 91–3. doi : 10.1038/ng0598-91 . PMID 9590298 . S2CID 47102642 .
  48. ^ a b   Antonini, E; Brunori, M; Bruzzesi, R; Chiancone, E; Massey, V (1966). "Associations-dissociationsfenomen av D-aminosyraoxidas" . Journal of Biological Chemistry . 241 (10): 2358–66. doi : 10.1016/S0021-9258(18)96629-9 . PMID 4380380 .
  49. ^ a b   Massey, V; Curti, B; Ganther, H (1966). "En temperaturberoende konformationsförändring i D-aminosyraoxidas och dess effekt på katalys" . Journal of Biological Chemistry . 241 (10): 2347–57. doi : 10.1016/S0021-9258(18)96628-7 . PMID 5911617 .
  50. ^ a b c d    Babady, NE; Pang, Y.-P.; Elpeleg, O.; Isaya, G. (2007). "Kryptisk proteolytisk aktivitet av dihydrolipoamiddehydrogenas" . Proceedings of the National Academy of Sciences . 104 (15): 6158–63. Bibcode : 2007PNAS..104.6158B . doi : 10.1073/pnas.0610618104 . PMC 1851069 . PMID 17404228 .
  51. ^   Muiswinkel-Voetberg, H.; Visser, Jaap; Veeger, Cornelis (1973). "Konformationsstudier på Lipoamiddehydrogenas från Pig Heart. 1. Interkonvertering av dissocierbara och icke-dissocierbara former" . European Journal of Biochemistry . 33 (2): 265–70. doi : 10.1111/j.1432-1033.1973.tb02679.x . PMID 4348439 .
  52. ^   Klyachko, NL; Shchedrina, VA; Efimov, AV; Kazakov, SV; Gazaryan, IG; Kristal, BS; Brown, AM (2005). "PH-beroende substratpreferens av lipoamiddehydrogenas från grishjärta varierar med oligomeriskt tillstånd: SVAR PÅ MITOKONDRIELL MATRIX FÖRSURNING" . Journal of Biological Chemistry . 280 (16): 16106–14. doi : 10.1074/jbc.M414285200 . PMID 15710613 .
  53. ^   Muiswinkel-Voetberg, H.; Veeger, Cornelis (1973). "Konformationsstudier på Lipoamiddehydrogenas från grishjärta. 2. Spektroskopiska studier på apoenzymet och de monomera och dimera formerna" . European Journal of Biochemistry . 33 (2): 271–8. doi : 10.1111/j.1432-1033.1973.tb02680.x . PMID 4348440 .
  54. ^ a b c d   Saxena, Ashima; Hensley, Preston; Osborne, James C.; Fleming, Patrick J. (1985). "Den pH-beroende subenhetsdissociationen och den katalytiska aktiviteten av bovint dopamin β-hydroxylas" . Journal of Biological Chemistry . 260 (6): 3386–92. doi : 10.1016/S0021-9258(19)83633-5 . PMID 3972830 .
  55. ^ a b c d   Dhawan, S; Hensley, P; Osborne Jr, JC; Fleming, PJ (1986). "Adenosin 5'-difosfatberoende subenhetsdissociation av bovint dopamin beta-hydroxylas" . Journal of Biological Chemistry . 261 (17): 7680–4. doi : 10.1016/S0021-9258(19)57453-1 . PMID 3711102 .
  56. ^ a b c d   Stewart, LC; Klinman, JP (1988). "Dopamin Beta-Hydroxylas of Adrenal Chromaffin Granules: Struktur och funktion". Årlig översyn av biokemi . 57 : 551-92. doi : 10.1146/annurev.bi.57.070188.003003 . PMID 3052283 .
  57. ^   Kuzuguchi, T.; Morita, Y; Sagami, I; Sagami, H; Ogura, K (1999). "Human Geranylgeranyl Diphosphate Syntas. CDNA KLONNING OCH UTTRYCKNING" . Journal of Biological Chemistry . 274 (9): 5888–94. doi : 10.1074/jbc.274.9.5888 . PMID 10026212 .
  58. ^ a b   Kavanagh, KL; Dunford, JE; Bunkoczi, G; Russell, RG; Oppermann, U (2006). "Kristallstrukturen av mänskligt geranylgeranylpyrofosfatsyntas avslöjar ett nytt hexameriskt arrangemang och hämmande produktbindning" . Journal of Biological Chemistry . 281 (31): 22004–12. doi : 10.1074/jbc.M602603200 . PMID 16698791 .
  59. ^   Miyagi, Y.; Matsumura, Y.; Sagami, H. (2007). "Human Geranylgeranyl Diphosphate Synthase är en oktamer i lösning". Journal of Biochemistry . 142 (3): 377–81. doi : 10.1093/jb/mvm144 . PMID 17646172 .
  60. ^   Snook, Christopher F.; Tipton, Peter A.; Beamer, Lesa J. (2003). "Kristallstruktur av GDP-mannosdehydrogenas: ett nyckelenzym för alginatbiosyntes i P. Aeruginosa". Biokemi . 42 (16): 4658–68. doi : 10.1021/bi027328k . PMID 12705829 .
  61. ^   Roychoudhury, S; maj, TB; Gill, JF; Singh, SK; Feingold, DS; Chakrabarty, AM (1989). "Rening och karakterisering av guanosindifosfo-D-mannosdehydrogenas. Ett nyckelenzym i biosyntesen av alginat av Pseudomonas aeruginosa" . Journal of Biological Chemistry . 264 (16): 9380–5. doi : 10.1016/S0021-9258(18)60542-3 . PMID 2470755 .
  62. ^ a b   Inget, Laura E.; Gilbert, Sunny; Imhoff, Rebecca; Snook, Christopher; Beamer, Lesa; Tipton, Peter (2002). "Allosterism och kooperativitet i Pseudomonas aeruginosaGDP-mannosdehydrogenas". Biokemi . 41 (30): 9637–45. doi : 10.1021/bi025862m . PMID 12135385 .
  63. ^ a b    Fisher, Harvey F. (2006). "Glutamatdehydrogenas-ligandkomplex och deras relation till reaktionsmekanismen" . Framsteg inom enzymologi och relaterade områden inom molekylärbiologi . Framsteg inom enzymologi - och relaterade områden inom molekylärbiologi. Vol. 39. s. 369–417 . doi : 10.1002/9780470122846.ch6 . ISBN 978-0-470-12284-6 . PMID 4147773 .
  64. ^   Huang, CY; Frieden, C (1972). "Mekanismen för ligand-inducerade strukturella förändringar i glutamatdehydrogenas. Studier av hastigheten för depolymerisation och isomerisering som utförs av koenzymer och guanin nukleotider" . Journal of Biological Chemistry . 247 (11): 3638–46. doi : 10.1016/S0021-9258(19)45188-0 . PMID 4402280 .
  65. ^ a b    Kim, Sang Suk; Choi, I.-G.; Kim, Sung-Hou; Yu, YG (1999). "Molekylär kloning, uttryck och karakterisering av en termostabil glutamatracemas från en hypertermofil bakterie, Aquifex pyrophilus". Extremofiler . 3 (3): 175–83. doi : 10.1007/s007920050114 . PMID 10484173 . S2CID 709039 .
  66. ^ a b    Lundqvist, Tomas; Fisher, Stewart L.; Kern, Gunther; Folmer, Rutger HA; Xue, Yafeng; Newton, D. Trevor; Keating, Thomas A.; Alm, Richard A.; et al. (2007). "Exploatering av strukturell och regulatorisk mångfald i glutamatracemaser". Naturen . 447 (7146): 817–22. Bibcode : 2007Natur.447..817L . doi : 10.1038/nature05689 . PMID 17568739 . S2CID 4408683 .
  67. ^ a b    Maj, Melissa; Mehboob, Shahila; Mulhearn, Debbie C.; Wang, Zhiqiang; Yu, Huidong; Thatcher, Gregory RJ; Santarsiero, Bernard D.; Johnson, Michael E.; et al. (2007). "Strukturell och funktionell analys av två glutamatracemasisozymer från Bacillus anthracis och konsekvenser för inhibitordesign" . Journal of Molecular Biology . 371 (5): 1219–37. doi : 10.1016/j.jmb.2007.05.093 . PMC 2736553 . PMID 17610893 .
  68. ^ a b   Taal, Makie A.; Sedelnikova, Svetlana E.; Ruzheinikov, Sergey N.; Baker, Patrick J.; Rice, David W. (2004). "Expression, rening och preliminär röntgenanalys av kristaller av Bacillus subtilisglutamat racemase" . Acta Crystallographica Sektion D. 60 (11): 2031–4. doi : 10.1107/S09074444904021134 . PMID 15502318 .
  69. ^ a b   Kim, Kook-Han; Bong, Young-Jong; Park, Joon Kyu; Shin, Key-Jung; Hwang, Kwang Yeon; Kim, Eunice Eunkyeong (2007). "Strukturell grund för glutamatracemasinhibering". Journal of Molecular Biology . 372 (2): 434–43. doi : 10.1016/j.jmb.2007.05.003 . PMID 17658548 .
  70. ^   Ashiuchi, M.; Kuwana, E; Yamamoto, T; Komatsu, K; Soda, K; Misono, H (2002). "Glutamat Racemase är en endogen DNA-gyrasinhibitor" . Journal of Biological Chemistry . 277 (42): 39070–3. doi : 10.1074/jbc.C200253200 . PMID 12213801 .
  71. ^   Ashiuchi, M.; Tani, K.; Soda, K.; Misono, H. (1998). "Egenskaper hos glutamatracemas från Bacillus subtilis IFO 3336 som producerar poly- -glutamat". Journal of Biochemistry . 123 (6): 1156–63. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a022055 . PMID 9604005 .
  72. ^   Sengupta, S.; Ghosh, S.; Nagaraja, V. (2008). "Månskensfunktion hos glutamatracemas från Mycobacterium tuberculosis: Racemisering och DNA-gyrashämning är två oberoende aktiviteter av enzymet" . Mikrobiologi . 154 (9): 2796–803. doi : 10.1099/mic.0.2008/020933-0 . PMID 18757813 .
  73. ^   Sirover, Michael A (1999). "Nya insikter i ett gammalt protein: Den funktionella mångfalden av däggdjursglyceraldehyd-3-fosfatdehydrogenas". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteinstruktur och molekylär enzymologi . 1432 (2): 159–84. doi : 10.1016/S0167-4838(99)00119-3 . PMID 10407139 .
  74. ^   Constantinides, SM; Deal Jr, WC (1969). "Reversibel dissociation av tetramerisk kaninmuskelglyceraldehyd-3-fosfatdehydrogenas till dimerer eller monomerer av adenosintrifosfat" . Journal of Biological Chemistry . 244 (20): 5695–702. doi : 10.1016/S0021-9258(18)63615-4 . PMID 4312250 .
  75. ^   Kumagai, H; Sakai, H (1983). "Ett grishjärnprotein (35 K-protein) som buntar ihop mikrotubuli och dess identifiering som glyceraldehyd-3-fosfatdehydrogenas". Journal of Biochemistry . 93 (5): 1259–69. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a134260 . PMID 6885722 .
  76. ^ a b   De Riel, Jon K.; Paulus, Henry (1978). "Subenhetsdissociation i den allosteriska regleringen av glycerolkinas från Escherichia coli. 2. Fysiska bevis". Biokemi . 17 (24): 5141–6. doi : 10.1021/bi00617a011 . PMID 215195 .
  77. ^ a b   De Riel, Jon K.; Paulus, Henry (1978). "Subenhetsdissociation i den allosteriska regleringen av glycerolkinas från Escherichia coli. 1. Kinetiska bevis". Biokemi . 17 (24): 5134–40. doi : 10.1021/bi00617a010 . PMID 215194 .
  78. ^ a b   De Riel, Jon K.; Paulus, Henry (1978). "Subenhetsdissociation i den allosteriska regleringen av glycerolkinas från Escherichia coli. 3. Roll i desensibilisering". Biokemi . 17 (24): 5146–50. doi : 10.1021/bi00617a012 . PMID 31903 .
  79. ^ a b   Avgift, Michael D; Faber, H Rick; Byström, Cory E; Pettigrew, Donald W; Remington, S James (1998). "Glycerolkinas från Escherichia coli och en Ala65→Thr-mutant: Kristallstrukturerna avslöjar konformationsförändringar med implikationer för allosterisk reglering" . Struktur . 6 (11): 1407–18. doi : 10.1016/S0969-2126(98)00140-3 . PMID 9817843 .
  80. ^ a b   Byström, Cory E.; Pettigrew, Donald W.; Branchaud, Bruce P.; O'Brien, Patrick; Remington, S. James (1999). "Kristallstrukturer av Escherichia coliGlycerolkinasvariant S58→W i komplex med ickehydrolyserbara ATP-analoger avslöjar en förmodad aktiv konformation av enzymet som ett resultat av domänrörelse". Biokemi . 38 (12): 3508–18. doi : 10.1021/bi982460z . PMID 10090737 .
  81. ^ a b   Deprez, Eric; Tauc, Patrick; Leh, Hervé; Mouscadet, Jean-François; Auclair, Christian; Brochon, Jean-Claude (2000). "Oligomera tillstånd av HIV-1-integrasen mätt med tidsupplöst fluorescensanisotropi". Biokemi . 39 (31): 9275–84. doi : 10.1021/bi000397j . PMID 10924120 .
  82. ^ a b    Deprez, E.; Tauc, P.; Leh, H.; Mouscadet, J.-F.; Auclair, C.; Hawkins, ME; Brochon, J.-C. (2001). "DNA-bindning inducerar dissociation av den multimera formen av HIV-1-integras: En tidsupplöst fluorescensanisotropistudie" . Proceedings of the National Academy of Sciences . 98 (18): 10090–5. Bibcode : 2001PNAS...9810090D . doi : 10.1073/pnas.181024498 . PMC 56920 . PMID 11504911 .
  83. ^ a b c    Faure, A. l.; Calmels, C; Desjobert, C; Castroviejo, M; Caumont-Sarcos, A; Tarrago-Litvak, L; Litvak, S; Parissi, V (2005). "HIV-1 integras-tvärbundna oligomerer är aktiva in vitro" . Nukleinsyraforskning . 33 (3): 977–86. doi : 10.1093/nar/gki241 . PMC 549407 . PMID 15718297 .
  84. ^ a b   Guiot, E.; Carayon, K; Delelis, O; Simon, F; Tauc, P; Zubin, E; Gottikh, M; Mouscadet, JF; et al. (2006). "Släktskap mellan den oligomera statusen för HIV-1-integras på DNA och enzymaktivitet" . Journal of Biological Chemistry . 281 (32): 22707–19. doi : 10.1074/jbc.M602198200 . PMID 16774912 .
  85. ^    Fieulaine, S.; Morera, S; Poncet, S; Monedero, V; Gueguen-Chaignon, V; Galinier, A; Janin, J; Deutscher, J; et al. (2001). "Röntgenstruktur av HPr-kinas: Ett bakteriellt proteinkinas med en P-loop-nukleotidbindande domän" . EMBO Journal . 20 (15): 3917–27. doi : 10.1093/emboj/20.15.3917 . PMC 149164 . PMID 11483495 .
  86. ^     Márquez, José Antonio; Hasenbein, Sonja; Koch, Brigitte; Fieulaine, Sonia; Nessler, Sylvie; Russell, Robert B.; Hengstenberg, Wolfgang; Scheffzek, Klaus (2002). "Struktur av fullängds HPr-kinas/fosfatas från Staphylococcus xylosus vid 1,95 Å upplösning: Efterliknar produkten/substratet av fosfoöverföringsreaktionerna" . Proceedings of the National Academy of Sciences . 99 (6): 3458–63. Bibcode : 2002PNAS...99.3458M . doi : 10.1073/pnas.052461499 . JSTOR 3058148 . PMC 122545 . PMID 11904409 .
  87. ^   Allen, Gregory S.; Steinhauer, Katrin; Hillen, Wolfgang; Stülke, Jörg; Brennan, Richard G. (2003). "Kristallstruktur av HPr-kinas/fosfatas från Mycoplasma pneumoniae". Journal of Molecular Biology . 326 (4): 1203–17. doi : 10.1016/S0022-2836(02)01378-5 . PMID 12589763 .
  88. ^   Poncet, Sandrine; Mijakovic, Ivan; Nessler, Sylvie; Gueguen-Chaignon, Virginie; Chaptal, Vincent; Galinier, Anne; Boël, Grégory; Mazé, Alain; et al. (2004). "HPr-kinas/fosforylas, ett Walker-motiv A-innehållande bifunktionellt sensorenzym som kontrollerar katabolitrepression i grampositiva bakterier". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteiner och proteomik . 1697 (1–2): 123–35. doi : 10.1016/j.bbapap.2003.11.018 . PMID 15023355 .
  89. ^ a b c d e   Ramström, H.; Sanglier, S; Leize-Wagner, E; Philippe, C; Van Dorsselaer, A; Haiech, J (2002). "Egenskaper och reglering av det bifunktionella enzymet HPr-kinas/fosfatas i Bacillus subtilis" . Journal of Biological Chemistry . 278 (2): 1174–85. doi : 10.1074/jbc.M209052200 . PMID 12411438 .
  90. ^   Jault, J.-M.; Fieulaine, S; Nessler, S; Gonzalo, P; Di Pietro, A; Deutscher, J; Galinier, A (2000). "HPr-kinaset från Bacillus subtilis är ett homo-oligomert enzym som uppvisar stark positiv samverkan för nukleotid- och fruktos-1,6-bisfosfatbindning" . Journal of Biological Chemistry . 275 (3): 1773–80. doi : 10.1074/jbc.275.3.1773 . PMID 10636874 .
  91. ^   Clarke, Anthony R.; Waldman, Adam DB; Munro, Ian; Holbrook, J. John (1985). "Förändringar i tillståndet för subenhetsassociation av laktatdehydrogenas från Bacillus stearothermophilus". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteinstruktur och molekylär enzymologi . 828 (3): 375–9. doi : 10.1016/0167-4838(85)90319-X . PMID 3986214 .
  92. ^ a b c d e   Clarke, Anthony R.; Waldman, Adam DB; Hart, Keith W.; John Holbrook, J. (1985). "Hastigheterna av definierade förändringar i proteinstrukturen under den katalytiska cykeln av laktatdehydrogenas". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteinstruktur och molekylär enzymologi . 829 (3): 397–407. doi : 10.1016/0167-4838(85)90250-X . PMID 4005269 .
  93. ^   Clarke, Anthony R.; Wigley, Dale B.; Barstow, David A.; Chia, William N.; Atkinson, Tony; Holbrook, J. John (1987). "En enda aminosyrasubstitution avreglerar ett bakteriellt laktatdehydrogenas och stabiliserar dess tetramera struktur". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteinstruktur och molekylär enzymologi . 913 (1): 72–80. doi : 10.1016/0167-4838(87)90234-2 . PMID 3580377 .
  94. ^   Cameron, Alexander D.; Roper, David I.; Moreton, Kathleen M.; Muirhead, Hilary; Holbrook, J. John; Wigley, Dale B. (1994). "Allosterisk aktivering i Bacillus stearothermophilus laktatdehydrogenas undersökt genom en röntgenkristallografisk analys av en mutant utformad för att förhindra tetramerisering av enzymet". Journal of Molecular Biology . 238 (4): 615–25. doi : 10.1006/jmbi.1994.1318 . PMID 8176749 .
  95. ^ a b c   Roudiak, Stanislav G.; Shrader, Thomas E. (1998). "Funktionell roll för den N-terminala regionen av Lon-proteaset från Mycobacterium smegmatis". Biokemi . 37 (32): 11255–63. doi : 10.1021/bi980945h . PMID 9698372 .
  96. ^ a b c   Rudyak, Stanislav G.; Brenowitz, Michael; Shrader, Thomas E. (2001). "Mg2+-länkad oligomerisering modulerar den katalytiska aktiviteten hos Lon(La)-proteaset från Mycobacterium smegmatis". Biokemi . 40 (31): 9317–23. doi : 10.1021/bi0102508 . PMID 11478899 .
  97. ^ a b    Vingård, Diana; Patterson-Ward, Jessica; Lee, Irene (2006). "Kinetiska experiment med enkel omsättning bekräftar förekomsten av ATPas-platser med hög och låg affinitet i Escherichia coliLon-proteas" . Biokemi . 45 (14): 4602–10. doi : 10.1021/bi052377t . PMC 2515378 . PMID 16584195 .
  98. ^ a b   Yang, Zhiru; Lanks, Charles W.; Tong, Liang (2002). "Molekylär mekanism för reglering av mänsklig mitokondriell NAD(P)+-beroende malinenzym av ATP och fumarat" . Struktur . 10 (7): 951–60. doi : 10.1016/S0969-2126(02)00788-8 . PMID 12121650 .
  99. ^ a b   Gerald e, Edwards; Carlos s, Andreo (1992). "NADP-äppelenzym från växter". Fytokemi . 31 (6): 1845–57. doi : 10.1016/0031-9422(92)80322-6 . PMID 1368216 .
  100. ^    Hsieh, J.-Y.; Chen, S.-H.; Hung, H.-C. (2009). "Funktionella roller för Tetramer Organization of Malic Enzyme" . Journal of Biological Chemistry . 284 (27): 18096–105. doi : 10.1074/jbc.M109.005082 . PMC 2709377 . PMID 19416979 .
  101. ^   Poole, Leslie B. (2005). "Bakteriella försvar mot oxidanter: Mekanistiska egenskaper hos cysteinbaserade peroxidaser och deras flavoproteinreduktaser". Arkiv för biokemi och biofysik . 433 (1): 240–54. doi : 10.1016/j.abb.2004.09.006 . PMID 15581580 .
  102. ^    Aran, Martin; Ferrero, Diego S.; Pagano, Eduardo; Wolosiuk, Ricardo A. (2009). "Typiska 2-Cys peroxiredoxiner - modulering genom kovalenta transformationer och icke-kovalenta interaktioner". FEBS Journal . 276 (9): 2478–93. doi : 10.1111/j.1742-4658.2009.06984.x . hdl : 11336/20656 . PMID 19476489 . S2CID 1698327 .
  103. ^   Bjørgo, Elisa; De Carvalho, Raquel Margarida Negrão; Flatmark, Torgeir (2001). "En jämförelse av kinetiska och regulatoriska egenskaper hos de tetramera och dimera formerna av vildtyp och Thr427→Pro mutant humant fenylalaninhydroxylas". European Journal of Biochemistry . 268 (4): 997–1005. doi : 10.1046/j.1432-1327.2001.01958.x . PMID 11179966 .
  104. ^    Martinez, Aurora; Knappskog, Per M.; Olafsdottir, Sigridur; Døskeland, Anne P.; Eiken, Hans Geir; Svebak, Randi Myrseth; Bozzini, MeriLisa; Apold, Jaran; et al. (1995). "Uttryck av rekombinant humant fenylalaninhydroxylas som fusionsprotein i Escherichia coli kringgår proteolytisk nedbrytning av värdcellsproteaser. Isolering och karakterisering av vildtypsenzymet" . The Biochemical Journal . 306 (2): 589–97. doi : 10.1042/bj3060589 . PMC 1136558 . PMID 7887915 .
  105. ^   Knappskog, Per M.; Flatmark, Torgeir ; Aarden, Johanna M.; Haavik, Jan; Martinez, Aurora (1996). "Struktur/funktionsrelationer i humant fenylalaninhydroxylas. Effekt av terminala deletioner på oligomerisering, aktivering och kooperativitet av substratbindning till enzymet". European Journal of Biochemistry . 242 (3): 813–21. doi : 10.1111/j.1432-1033.1996.0813r.x . PMID 9022714 .
  106. ^   Phillips, Robert S.; Parniak, Michael A.; Kaufman, Seymour (1984). "Spektroskopisk undersökning av ligandinteraktion med hepatisk fenylalaninhydroxylas: bevis för en konformationsförändring associerad med aktivering". Biokemi . 23 (17): 3836–42. doi : 10.1021/bi00312a007 . PMID 6487579 .
  107. ^   Fusetti, F.; Erlandsen, H; Flatmark, T ; Stevens, RC (1998). "Struktur av tetrameriskt humant fenylalaninhydroxylas och dess konsekvenser för fenylketonuri" . Journal of Biological Chemistry . 273 (27): 16962–7. doi : 10.1074/jbc.273.27.16962 . PMID 9642259 .
  108. ^ a b c d e f   Wohl, RC; Markus, G (1972). "Fosfoenolpyruvatkarboxylas av Escherichia coli. Rening och vissa egenskaper" . Journal of Biological Chemistry . 247 (18): 5785–92. doi : 10.1016/S0021-9258(19)44827-8 . PMID 4560418 .
  109. ^   Kai, Yasushi; Matsumura, Hiroyoshi; Izui, Katsura (2003). "Fosfoenolpyruvatkarboxylas: Tredimensionell struktur och molekylära mekanismer". Arkiv för biokemi och biofysik . 414 (2): 170–9. doi : 10.1016/S0003-9861(03)00170-X . PMID 12781768 .
  110. ^ a b c   Xu, Jing; Oshima, Tairo; Yoshida, Masasuke (1990). "Tetramer-dimer-omvandling av fosfofruktokinas från Thermus thermophilus inducerad av dess allosteriska effektorer". Journal of Molecular Biology . 215 (4): 597–606. doi : 10.1016/S0022-2836(05)80171-8 . PMID 2146397 .
  111. ^   Jolley Jr, RL; Mason, HS (1965). "De multipla formerna av svamptyrosinas. Interconversion" . Journal of Biological Chemistry . 240 : PC1489–91. doi : 10.1016/S0021-9258(18)97603-9 . PMID 14284774 .
  112. ^   Jolley Jr, RL; Robb, DA; Mason, HS (1969). "De multipla formerna av svamptyrosinas. Association-dissociationsfenomen" . Journal of Biological Chemistry . 244 (6): 1593–9. doi : 10.1016/S0021-9258(18)91800-4 . PMID 4975157 .
  113. ^   Mallette, MF; Dawson, CR (1949). "Om karaktären hos högrenade svamptyrosinasberedningar". Arkiv för biokemi . 23 (1): 29–44. PMID 18135760 .
  114. ^ a b   Chazarra, Soledad; García-Carmona, Francisco; Cabanes, Juana (2001). "Hysteres och positiv kooperativitet av isbergssallat polyfenoloxidas". Biokemisk och biofysisk forskningskommunikation . 289 (3): 769–75. doi : 10.1006/bbrc.2001.6014 . PMID 11726215 .
  115. ^ Harel, E.; Mayer, AM (1968). "Interomvandling av underenheter av katekoloxidas från äppelkloroplaster". Fytokemi . 7 (2): 199–204. doi : 10.1016/S0031-9422(00)86315-3 .
  116. ^ a b    Jaffe EK, Lawrence SH (mars 2012). "Allosteri och den dynamiska oligomeriseringen av porfobilinogensyntas" . Båge. Biochem. Biofys . 519 (2): 144–53. doi : 10.1016/j.abb.2011.10.010 . PMC 3291741 . PMID 22037356 .
  117. ^    Breinig S, Kervinen J, Stith L, Wasson AS, Fairman R, Wlodawer A, Zdanov A, Jaffe EK (september 2003). "Kontroll av tetrapyrrolbiosyntes genom alternativa kvartära former av porfobilinogensyntas". Nat. Struktur. Biol . 10 (9): 757–63. doi : 10.1038/nsb963 . PMID 12897770 . S2CID 24188785 .
  118. ^ a b    Schulz, Ju¨Rgen; Sparmann, Gisela; Hofmann, Eberhard (1975). "Alanin-medierad reversibel inaktivering av tumörpyruvatkinas orsakad av en tetramer-dimer-övergång" . FEBS Bokstäver . 50 (3): 346–50. doi : 10.1016/0014-5793(75)90064-2 . PMID 1116605 . S2CID 5665440 .
  119. ^ a b   Ibsen, KH; Schiller, KW; Haas, TA (1971). "Interkonvertibla kinetiska och fysiska former av humant erytrocytpyruvatkinas" . Journal of Biological Chemistry . 246 (5): 1233–40. doi : 10.1016/S0021-9258(19)76963-4 . PMID 5545066 .
  120. ^    Liu, Yanshun; Gotte, Giovanni; Libonati, Massimo; Eisenberg, David (2009). "Strukturer av de två 3D-domänbytta RNase a-trimererna" . Proteinvetenskap . 11 (2): 371–80. doi : 10.1110/ps.36602 . PMC 2373430 . PMID 11790847 .
  121. ^ a b   Gotte, Giovanni; Bertoldi, Mariarita; Libonati, Massimo (1999). "Strukturell mångsidighet av bovint ribonukleas A. Distinkta konformeringar av trimera och tetramera aggregat av enzymet" . European Journal of Biochemistry . 265 (2): 680–7. doi : 10.1046/j.1432-1327.1999.00761.x . PMID 10504400 .
  122. ^   Gotte, Giovanni; Laurents, Douglas V.; Libonati, Massimo (2006). "Tredimensionella domänbytta oligomerer av ribonukleas A: Identifiering av en femte tetramer, pentamerer och hexamerer, och detektion av spår av heptameriska, oktamera och nonameriska arter". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteiner och proteomik . 1764 (1): 44–54. doi : 10.1016/j.bbapap.2005.10.011 . PMID 16310422 .
  123. ^ a b   Gotte, Giovanni; Libonati, Massimo (1998). "Två olika former av aggregerade dimerer av ribonukleas A". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteinstruktur och molekylär enzymologi . 1386 (1): 106–112. doi : 10.1016/S0167-4838(98)00087-9 . PMID 9675255 .
  124. ^ a b    Libonati, Massimo; Gotte, Giovanni (2004). "Oligomerisering av bovint ribonukleas A: strukturella och funktionella egenskaper hos dess multimerer" . Biokemisk tidskrift . 380 (2): 311–27. doi : 10.1042/BJ20031922 . PMC 1224197 . PMID 15104538 .
  125. ^ a b    Libonati, M. (2004). "Biologiska effekter av oligomererna av ribonukleas A". Cellulära och molekylära livsvetenskaper . 61 (19–20): 2431–6. doi : 10.1007/s00018-004-4302-x . PMID 15526151 . S2CID 8769502 .
  126. ^ a b    Libonati, M; Bertoldi, M; Sorrentino, S (1996). "Aktiviteten på dubbelsträngat RNA av aggregat av ribonukleas som är högre än dimerer ökar som en funktion av storleken på aggregaten" . The Biochemical Journal . 318 (1): 287–90. doi : 10.1042/bj3180287 . PMC 1217620 . PMID 8761484 .
  127. ^ a b   Libonati, M.; Gotte, G.; Vottariello, F. (2008). "En ny biologisk handling som förvärvats av ribonukleas genom oligomerisering". Aktuell farmaceutisk bioteknik . 9 (3): 200–9. doi : 10.2174/138920108784567308 . PMID 18673285 .
  128. ^   Kashlan, Ossama B.; Cooperman, Barry S. (2003). "Omfattande modell för allosterisk reglering av däggdjursribonukleotidreduktas: förfinningar och konsekvenser†". Biokemi . 42 (6): 1696–706. doi : 10.1021/bi020634d . PMID 12578384 .
  129. ^   Kashlan, Ossama B.; Scott, Charles P.; Lear, James D.; Cooperman, Barry S. (2002). "En omfattande modell för allosterisk reglering av däggdjursribonukleotidreduktas. Funktionella konsekvenser av ATP- och dATP-inducerad oligomerisering av den stora underenheten†". Biokemi . 41 (2): 462–74. doi : 10.1021/bi011653a . PMID 11781084 .
  130. ^   Eriksson, Mathias; Uhlin, Ulla; Ramaswamy, S; Ekberg, Monica; Regnström, Karin; Sjöberg, Britt-Marie; Eklund, Hans (1997). "Bindning av allosteriska effektorer till ribonukleotidreduktasprotein R1: Reduktion av cysteiner på det aktiva stället främjar substratbindning" . Struktur . 5 (8): 1077–92. doi : 10.1016/S0969-2126(97)00259-1 . PMID 9309223 .
  131. ^ a b    Fairman, James Wesley; Wijerathna, Sanath Ranjan; Ahmad, Md Faiz; Xu, Hai; Nakano, Ryo; Jha, Shalini; Prendergast, Jay; Welin, R Martin; et al. (2011). "Strukturell grund för allosterisk reglering av humant ribonukleotidreduktas genom nukleotidinducerad oligomerisering" . Naturens strukturella & molekylära biologi . 18 (3): 316–22. doi : 10.1038/nsmb.2007 . PMC 3101628 . PMID 21336276 .
  132. ^ a b   Hohman, RJ; Guitton, MC; Veron, M. (1984). "Rening av S-adenosyl-l-homocysteinhydrolas från Dictyostelium discoideum: Reversibel inaktivering av cAMP och 2'-deoxiadenosin". Arkiv för biokemi och biofysik . 233 (2): 785–95. doi : 10.1016/0003-9861(84)90507-1 . PMID 6091559 .
  133. ^   Guranowski, Andrzej; Pawelkiewicz, Jerzy (1977). "Adenosylhomocysteinas från gula lupinfrön. Rening och egenskaper". European Journal of Biochemistry . 80 (2): 517–23. doi : 10.1111/j.1432-1033.1977.tb11907.x . PMID 923592 .
  134. ^    Kajander, EO; Raina, AM (1981). "Affinitetskromatografisk rening av S-adenosyl-L-homocysteinhydrolas. Vissa egenskaper hos enzymet från råttlever" . The Biochemical Journal . 193 (2): 503–12. doi : 10.1042/bj1930503 . PMC 1162632 . PMID 7305945 .
  135. ^ a b c   Saeki, Y; Ito, S; Shizuta, Y; Hayaishi, O; Kagamiyama, H; Wada, H (1977). "Underenhetsstruktur av biologiskt nedbrytande treonindeaminas" . Journal of Biological Chemistry . 252 (7): 2206–8. doi : 10.1016/S0021-9258(17)40542-4 . PMID 321452 .
  136. ^ a b c Phillips, AT; Wood, WA (1964). "Bas för AMP-aktivering av "Bionedbrytande" treonindehydras från". Biokemisk och biofysisk forskningskommunikation . 15 (6): 530–535. doi : 10.1016/0006-291X(64)90499-1 .
  137. ^ a b c   Gerlt, JA; Rabinowitz, KW; Dunne, CP; Wood, WA (1973). "Verktionsmekanismen för 5'-adenylsyraaktiverat treonindehydras. V. Förhållandet mellan ligand-inducerad allosterisk aktivering och protomeroligomer interkonvertering" . Journal of Biological Chemistry . 248 (23): 8200–6. doi : 10.1016/S0021-9258(19)43214-6 . PMID 4584826 .
  138. ^   Addington, Adele K.; Johnson, David A. (1996). "Inaktivering av humant lungtryptas: bevis för en återaktiverbar tetramerisk mellanliggande och aktiva monomerer". Biokemi . 35 (42): 13511–8. doi : 10.1021/bi960042t . PMID 8885830 .
  139. ^    Fajardo, Ignacio; Pejler, Gunnar (2003). "Bildning av aktiva monomerer från tetramert humant β-tryptas" . Biokemisk tidskrift . 369 (3): 603–10. doi : 10.1042/BJ20021418 . PMC 1223112 . PMID 12387726 .
  140. ^   Fukuoka, Yoshihiro; Schwartz, Lawrence B. (2004). "Humant β-tryptas: Detektion och karakterisering av den aktiva monomeren och förhindrande av tetramerrekonstitution av proteashämmare". Biokemi . 43 (33): 10757–64. doi : 10.1021/bi049486c . PMID 15311937 .
  141. ^    Fukuoka, Y; Schwartz, LB (2006). "B12-anti-tryptas monoklonala antikroppen stör den tetramera strukturen av heparinstabiliserat beta-tryptas för att bilda monomerer som är inaktiva vid neutralt pH och aktiva vid surt pH. " Journal of Immunology . 176 (5): 3165–72. doi : 10.4049/jimmunol.176.5.3165 . PMC 1810230 . PMID 16493076 .
  142. ^    Fukuoka, Yoshihiro; Schwartz, Lawrence B. (2007). "Aktiva monomerer av humant β-tryptas har utökade substratspecificiteter" . Internationell immunfarmakologi . 7 (14): 1900–8. doi : 10.1016/j.intimp.2007.07.007 . PMC 2278033 . PMID 18039527 .
  143. ^   Hallgren, J.; Spillmann, D; Pejler, G (2001). "Strukturella krav och mekanismer för heparininducerad aktivering av ett rekombinant musmastcells-tryptas, musmastcellsproteas-6. BILDNING AV AKTIVA TRYPTASMONOMERER I NÄRVARO AV HEPARIN MED LÅGMOLEKYLVIKT" . Journal of Biological Chemistry . 276 (46): 42774–81. doi : 10.1074/jbc.M105531200 . PMID 11533057 .
  144. ^   Schechter, Norman M.; Choi, Eun-Jung; Selwood, Trevor; McCaslin, Darrell R. (2007). "Karakterisering av tre distinkta katalytiska former av mänskligt tryptas-β: deras inbördes samband och relevans". Biokemi . 46 (33): 9615–29. doi : 10.1021/bi7004625 . PMID 17655281 .
  145. ^   Schechter, Norman M.; Eng, Grace Y.; Selwood, Trevor; McCaslin, Darrell R. (1995). "Strukturella förändringar associerade med spontan inaktivering av serinproteinas humant tryptas". Biokemi . 34 (33): 10628–38. doi : 10.1021/bi00033a038 . PMID 7654717 .
  146. ^    Schwartz, Lawrence B. (1994). "[6] Tryptas: En mastcellserinproteas". Proteolytiska enzymer: serin- och cysteinpeptidaser . Metoder inom enzymologi. Vol. 244. s. 88–100 . doi : 10.1016/0076-6879(94)44008-5 . ISBN 978-0-12-182145-6 . PMID 7845247 .
  147. ^   Strik, Merel CM; Wolbink, Angela; Wouters, Dorine; Bladergroen, Bellinda A.; Verlaan, Angelique R.; van Houdt, Inge S.; Hijlkema, Sanne; Hack, C. Erik; et al. (2004). "Intracellulär serpin SERPINB6 (PI6) uttrycks rikligt av mänskliga mastceller och bildar komplex med β-tryptasmonomerer" . Blod . 103 (7): 2710–7. doi : 10.1182/blood-2003-08-2981 . PMID 14670919 .
  148. ^ a b   Kozik, Andrzej; Potempa, Jan; Travis, James (1998). "Spontan inaktivering av humant lungtryptas som undersökts genom storleksuteslutningskromatografi och kemisk tvärbindning: Dissociation av aktivt tetrameriskt enzym till inaktiva monomerer är den primära händelsen i hela processen". Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Proteinstruktur och molekylär enzymologi . 1385 (1): 139–48. doi : 10.1016/S0167-4838(98)00053-3 . PMID 9630576 .
  149. ^   Alzani, R.; Cozzi, E.; Corti, A.; Temponi, M.; Trizio, D.; Gigli, M.; Rizzo, V. (1995). "Mekanism för suramin-inducerad deoligomerisering av tumörnekrosfaktor alfa". Biokemi . 34 (19): 6344–50. doi : 10.1021/bi00019a012 . PMID 7756262 .
  150. ^    Corti, A; Fassina, G; Marcucci, F; Barbanti, E; Cassani, G (1992). "Oligomer tumörnekrosfaktor alfa omvandlas långsamt till inaktiva former på bioaktiva nivåer" . The Biochemical Journal . 284 (3): 905–10. doi : 10.1042/bj2840905 . PMC 1132625 . PMID 1622406 .
  151. ^   Hlodan, Roman; Pain, Roger H. (1995). "Viknings- och monteringsvägen för tumörnekrosfaktor TNFalpha, ett globulärt trimeriskt protein". European Journal of Biochemistry . 231 (2): 381–7. doi : 10.1111/j.1432-1033.1995.tb20710.x . PMID 7635149 .
  152. ^ a b c d   Jensen, Kaj Frank; Mygind, Bente (1996). "Olika oligomera tillstånd är involverade i det allosteriska beteendet hos uracilfosforibosyltransferas från Escherichia Coli". European Journal of Biochemistry . 240 (3): 637–45. doi : 10.1111/j.1432-1033.1996.0637h.x . PMID 8856065 .
Hämtad från " https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Morpheein&oldid=1139453436 "