MethBase
 | |
| Innehåll | |
|---|---|
| Beskrivning | DNA-metyleringsdata för enkel cytosinupplösning och associerade kommentarer . |
| Organismer |
Mänsklig schimpans Gorilla Rhesus Makakmus Arabidopsis |
| Kontakt | |
| Laboratorium | Andrew D. Smith |
| Primärt citat | Qiang Song et al. (2013) |
| Utgivningsdatum | 2013 |
| Tillgång | |
| Dataformat | Trackhub på UCSC Genome Browser |
| Hemsida | http://smithlabresearch.org/software/methbase/ |
MethBase är en databas med DNA-metyleringsdata som härrör från nästa generations sekvenseringsdata . MethBase tillhandahåller en visualisering av allmänt tillgänglig bisulfitsekvensering och reducerad representation av bisulfitsekvenseringsexperiment genom UCSC Genome Browser . MethBase-innehåll inkluderar metyleringsnivåer för enkel CpG-platsupplösning för varje CpG-ställe i genomet av intresse, annotering av regioner av hypometylering som ofta associeras med genpromotorer och annotering av allelspecifik metylering associerad med genomisk prägling .
Se även
- ^ a b Song, Qiang; Decato Benjamin E; Hong Elizabeth; Zhou Meng; Fang Fang; Qu Jianghan; Garvin Tyler; Kessler Michael; Zhou Jun; Smith Andrew D (dec 2013). "En referens Methylome-databas och analyspipeline för att underlätta integrerande och jämförande epigenomik" . PLOS ETT . 8 (12): e81148. Bibcode : 2013PLoSO...881148S . doi : 10.1371/journal.pone.0081148 . PMC 3855694 . PMID 24324667 .