Lista över sekvenserade algenom
Denna lista över sekvenserade alggenom innehåller algarter som är kända för att ha allmänt tillgängliga fullständiga genomsekvenser som har satts samman, kommenterat och publicerats. Osammansatta genom ingår inte, inte heller sekvenser som endast innehåller organell. För växtgenom se listan över sekvenserade växtgenom . För plastidsekvenser, se listan över sekvenserade plastomer . För alla kungariken, se listan över sekvenserade genom .
Dinoflagellater ( Alveolata )
Se även Lista över sekvenserade protistgenom .
Organism anstränga |
Typ | Relevans | Genomstorlek | siffra av gener förutspått |
Organisation | År av komplettering |
hopsättning status |
Länkar |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Breviolum minutum ( Symbiodinium minutum ; clade B1) | Dinoflagellat | Korall symbiont | 1,5 Gb | 47 014 | Okinawa Institute of Science and Technology | 2013 | Förslag | OIST Marine Genomics |
Cladocopium goreaui ( Symbiodinium goreaui ; clade C, typ C1) | Dinoflagellat | Korall symbiont | 1,19 Gb | 35,913 | Reef Future Genomics (ReFuGe) 2020 / University of Queensland | 2018 | Förslag | RefuGe 2020 |
Cladocopium C92 stam Y103 ( Symbiodinium sp. clade C; förmodad typ C92) | Dinoflagellat | Foraminiferan symbiont | Okänd (sammansättningsstorlek 0,70 Gb) | 65,832 | Okinawa Institute of Science and Technology | 2018 | Förslag | OIST Marine Genomics |
Fugacium kawagutii CS156=CCMP2468 ( Symbiodinium kawagutii ; clade F1) | Dinoflagellat | Korall symbiont? | 1,07 Gb | 26 609 | Reef Future Genomics (ReFuGe) 2020 / University of Queensland | 2018 | Förslag | RefuGe 2020 |
Fugacium kawagutii CCMP2468 ( Symbiodinium kawagutii ; kladd F1) | Dinoflagellat | Korall symbiont? | 1,18 Gb | 36 850 | University of Connecticut / Xiamen University | 2015 | Förslag | S. kawagutii genomprojekt |
Polarella glacialis CCMP1383 | Dinoflagellat | Psykrofil, Antarktis | 3,02 Gb (diploid), 1,48 Gbp (haploid) | 58,232 | University of Queensland | 2020 | Förslag | UQ eSpace |
Polarella glacialis CCMP2088 | Dinoflagellat | Psykrofil, Arktis | 2,65 Gb (diploid), 1,30 Gbp (haploid) | 51,713 | University of Queensland | 2020 | Förslag | UQ eSpace |
Symbiodinium microadriaticum (klad A) | Dinoflagellat | Korall symbiont | 1,1 Gb | 49,109 | King Abdullah University of Science and Technology | 2016 | Förslag | Reef Genomics |
Symbiodinium A3 stam Y106 ( Symbiodinium sp. clade A3) | Dinoflagellat | symbiont | Okänd (sammansättningsstorlek 0,77 Gb) | 69 018 | Okinawa Institute of Science and Technology | 2018 | Förslag | OIST Marine Genomics |
Cryptomonad
Organism anstränga |
Typ | Relevans | Genomstorlek | siffra av gener förutspått |
Organisation | År av komplettering |
hopsättning status |
Länkar |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Cryptophyceae sp. CCMP2293 | Nanoflagellat | Nukleomorf , Psykrofil | 534,5 Mb | 33 051 | Joint Genome Institute | 2016 | JGI Genome Portal | |
Guillardia theta | Eukaryot endosymbios | 87,2 Mb | 24, 840 | Dalhousie University | 2012 | Växthuset |
Glaukofyt
Organism anstränga |
Typ | Relevans | Genom storlek |
siffra av gener förutspått |
Organisation | År av komplettering |
hopsättning status |
Länkar |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Cyanophora | Modell Organism |
70,2 Mb | 3 900 | Rutgers University | 2012 | Utkast v1 | Växthuset Cyanophora Genome Project |
|
Cyanophora | Modell Organism |
99,94 Mb | 25,831 | Rutgers University | 2019 | Utkast v2 | Cyanophora Genome Project |
Grönalger
Organism anstränga |
Typ | Relevans | Genom storlek |
siffra av gener förutspått |
Organisation | År av komplettering |
hopsättning status |
Länkar |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Asterochloris sp. Cgr/DA1pho | Photobiont | 55,8 Mb | 10 025 | Duke University | 2011 | JGI Genome Portal | ||
Auxenochlorella prototekoider | Biobränslen | 22,9 Mb | 7 039 | Tsinghua-universitetet | 2014 | Växthuset | ||
Bathycoccus prasinos | Jämförande analys | 15,1 Mb | 7 900 | Joint Genome Institute | 2012 | JGI Genome Portal | ||
Chlamydomonas reinhardtii CC-503
cw92 mt+ |
Modell organism | 111,1 Mb | 17,741 | Joint Genome Institute | 2017 | Fytozom Växthuset |
||
Chlorella sorokiniana str. 1228 | Biobränslen | 61,4 Mb | Los Alamos National Lab | 2018 | Växthuset | |||
Chlorella sorokiniana UTEX 1230 | Biobränslen | 58,5 Mb | Los Alamos National Lab | 2018 | Växthuset | |||
Chlorella sorokiniana DOE1412 | Biobränslen | 57,8 Mb | Los Alamos National Lab | 2018 | Växthuset | |||
Chlorella variabilis NC64A | Biobränslen | 46,2 Mb | 9,791 | 2010 | Växthuset | |||
Chlorella vulgaris | Biobränslen | 37,3 Mb | Nationellt förnybart | 2015 | Växthuset | |||
Coccomyxa subellipsoidea
sp. C-169 |
Biobränslen | 48,8 Mb | 9839 | Joint Genome Institute | 2012 | Fytozom Växthuset |
||
Dunaliella salina
CCAP19/18 |
Halofil
Biobränslen |
343,7 Mb | 16 697 | Joint Genome Institute | 2017 | Fytozom | ||
Eudorina sp. | Flercelliga alger, modellorganism |
~180 Mb | Tokyos universitet | 2018 | ||||
Gonium pectorale | 148,81 Mb | Kansas State University | 2016 | |||||
Micromonas commoda NOUM17 (RCC288) | Marint växtplankton | 21,0 Mb | 10,262 | Monterey Bay Aquarium Research Institute | 2013 | JGI Genome Portal | ||
Micromonas
pusilla CCMP-1545 |
Marin | 21,9 Mb | 10,575 | Micromonas Genom Konsortium |
2009 | Fytozom Växthuset |
||
Micromonas
RCC299/NOUM17 |
Marin | 20,9 Mb | 10 056 | Gemensamt genom | 2009 | Fytozom De Växthus |
||
Monoraphidium | Biobränslen | 69,7 Mb | 16 755 | Bielefeld | 2013 | De Växthus |
||
Ostreokocker
CCE9901 |
Litet genom | 13,2 Mb | 7,603 | Joint Genome Institute | 2007 | Fytozom | ||
Ostreokocker
tauri OTH95 |
Litet genom | 12,9 Mb | 7 699 | CNRS | 2014 | Växthuset | ||
Ostreococcus sp.
RCC809 |
Litet genom | 13,3 Mb | 7,492 | Gemensamt genom | 2009 | JGI | ||
Picochlorum
soloecism DOE101 |
Biobränslen | 15,2 Mb | 7,844 | Los Alamos | 2017 | Växthuset | ||
Picochlorum
SENEW3 |
Biobränslen | 13,5 Mb | 7,367 | Rutgers University | 2014 | Växthuset | ||
Scenedesmus
obliquus DOE0152Z |
Biobränslen | 210,3 Mb | Brooklyn College | 2017 | Växthuset | |||
Symbiochloris reticulata (Metagenome) | Photobiont | 58,6 Mb | 12 720 | Joint Genome Institute | 2018 | JGI Genome Portal | ||
Tetraselmis sp. | Biobränslen | 228 Mb | Los Alamos | 2018 | Växthuset | |||
Volvox carteri | Flercelliga alger, modellorganism |
131,2 Mb | 14 247 | Gemensamt genom | 2010 | Fytozom De Växthus |
||
Yamagishiella unicocca | Flercelliga alger, modellorganism |
~140 Mb | Tokyos universitet | 2018 |
Haptofyt
Organism anstränga |
Typ | Relevans | Genom storlek |
siffra av gener förutspått |
Organisation | År av komplettering |
hopsättning status |
Länkar |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Chrysochromulina
parva |
Biobränslen | 65,8 Mb | Los Alamos National Laboratory | 2018 | Växthuset | |||
Chrysochromulina tobinii CCMP291 | Modellorganism, Biobränslen | 59,1 Mb | 16,765 | University of Washington | 2015 | Växthuset | ||
Emiliania huxleyi | Coccolithophore | Alkenonproduktion, algblomning | 167,7 Mb | 38,554 | Joint Genome Institute | 2013 | Växthuset | |
Pavlovales sp. CCMP2436 | Psykrofil | 165,4 Mb | 26 034 | Joint Genome Institute | 2016 | JGI Genome Portal |
Heterokonter / Stramenopiles
Organism anstränga |
Typ | Relevans | Genom storlek |
siffra av gener förutspått |
Organisation | År av komplettering |
hopsättning status |
Länkar |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Aureokocker | Skadlig alg Blomma |
50,1 Mb | 11 522 | Joint Genome Institute | 2011 | Växthuset | ||
Ectocarpus siliculosus | Brunalger | Modellorganism | 198,5 Mb | 16 269 | Genoskop | 2012 | Växthuset | |
Fragilariopsis cylindrus CCMP1102 | Psykrofil | 61,1 Mb | 21 066 | University of East Anglia , Joint Genome Institute | 2017 | JGI Genome Portal | ||
Nannokloropsis
gaditana |
Biobränslen | 28,5 Mb | 10,486 | Universitetet i Padua | 2014 | Växthuset | ||
Nannokloropsis
oceanica |
Biobränslen | 31,5 Mb | Chinese Academy of Sciences , Qingdao Institute of Bioenergy and Bioprocess Technology | 2016 | Växthuset | |||
Nannochloropsis Salina CCMP1766 | Biobränslen | 24,4 Mb | Chinese Academy of Sciences , Qingdao Institute of Bioenergy and Bioprocess Technology | 2016 | Växthuset | |||
Ochromonadaceae sp. CCMP2298 | Psykrofil | 61,1 Mb | 20 195 | Joint Genome Institute | 2016 | JGI Genome Portal | ||
Pelagophyceae sp. CCMP2097 | Psykrofil | 85,2 Mb | 19,402 | Joint Genome Institute | 2016 | JGI Genome Portal | ||
Phaeodactylum tricornutum | Modellorganism | 27,5 Mb | 10 408 | Diatom Consortium | 2008 | Växthuset | ||
Pseudo-nitzschia multiserie CLN-47 | 218,7 Mb | 19,703 | Joint Genome Institute | 2011 | JGI Genome Portal | |||
Saccharina japonica | Brunalger | Kommersiell gröda | 543,4 Mb | Chinese Academy of Sciences , Beijing Institutes of Life Science | 2015 | Växthuset | ||
Thalassiosira oceanica CCMP 1005 | Modellorganism | 92,2 Mb | 34,642 | Framtidens hav | 2012 | Växthuset | ||
Thalassiosira pseudonana | modellorganism | 32,4 Mb | 11,673 | Diatom Consortium | 2009 | Växthuset |
Röda alger (Rhodophyte)
Organism anstränga |
Typ | Relevans | Genom storlek |
siffra av gener förutspått |
Organisation | År av komplettering |
hopsättning status |
Länkar |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Chondrus crispus | Karragenanproduktion , modellorganism | 105 Mb | 9,606 | Genoskop | 2013 | Växthuset | ||
Cyanidioschyzon
merolae 10D |
Modell organism |
16,5 Mb | 4,775 |
National Institute
of Genetics , Japan |
2007 | Växthuset | ||
Galdieria sulphuraria | Extremofil | 12,1 Mb | University of York | 2016 | Växthuset | |||
Gracilariopsis chorda | Mesofil | 92,1 Mb | 10 806 | Sungkyunkwan University | 2018 | |||
Porphyridium purpureum | Mesofil | 19,7 Mb | 8 355 | Rutgers University | 2013 | |||
Porphyra umbilicalis | Marikultur | 87,6 Mb | 13 360 | University of Maine | 2017 | Fytozom | ||
Pyropia yezoensis | Marikultur | 43,5 Mb | 10 327 | National Research Institute of Fisheries Science | 2013 |
Rhizaria
Organism anstränga |
Typ | Relevans | Genom storlek |
siffra av gener förutspått |
Organisation | År av komplettering |
hopsättning status |
Länkar |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Bigelowiella natans | Modellorganism | 94. Mb | 21,708 | Dalhousie University | 2012 | Växthuset |