Lista över sekvenserade algenom

Denna lista över sekvenserade alggenom innehåller algarter som är kända för att ha allmänt tillgängliga fullständiga genomsekvenser som har satts samman, kommenterat och publicerats. Osammansatta genom ingår inte, inte heller sekvenser som endast innehåller organell. För växtgenom se listan över sekvenserade växtgenom . För plastidsekvenser, se listan över sekvenserade plastomer . För alla kungariken, se listan över sekvenserade genom .

Dinoflagellater ( Alveolata )

Se även Lista över sekvenserade protistgenom .

Organism

anstränga

Typ Relevans Genomstorlek siffra

av gener

förutspått

Organisation År av

komplettering

hopsättning

status

Länkar
Breviolum minutum ( Symbiodinium minutum ; clade B1) Dinoflagellat Korall symbiont 1,5 Gb 47 014 Okinawa Institute of Science and Technology 2013 Förslag OIST Marine Genomics
Cladocopium goreaui ( Symbiodinium goreaui ; clade C, typ C1) Dinoflagellat Korall symbiont 1,19 Gb 35,913 Reef Future Genomics (ReFuGe) 2020 / University of Queensland 2018 Förslag RefuGe 2020
Cladocopium C92 stam Y103 ( Symbiodinium sp. clade C; förmodad typ C92) Dinoflagellat Foraminiferan symbiont Okänd (sammansättningsstorlek 0,70 Gb) 65,832 Okinawa Institute of Science and Technology 2018 Förslag OIST Marine Genomics
Fugacium kawagutii CS156=CCMP2468 ( Symbiodinium kawagutii ; clade F1) Dinoflagellat Korall symbiont? 1,07 Gb 26 609 Reef Future Genomics (ReFuGe) 2020 / University of Queensland 2018 Förslag RefuGe 2020
Fugacium kawagutii CCMP2468 ( Symbiodinium kawagutii ; kladd F1) Dinoflagellat Korall symbiont? 1,18 Gb 36 850 University of Connecticut / Xiamen University 2015 Förslag S. kawagutii genomprojekt
Polarella glacialis CCMP1383 Dinoflagellat Psykrofil, Antarktis 3,02 Gb (diploid), 1,48 Gbp (haploid) 58,232 University of Queensland 2020 Förslag UQ eSpace
Polarella glacialis CCMP2088 Dinoflagellat Psykrofil, Arktis 2,65 Gb (diploid), 1,30 Gbp (haploid) 51,713 University of Queensland 2020 Förslag UQ eSpace
Symbiodinium microadriaticum (klad A) Dinoflagellat Korall symbiont 1,1 Gb 49,109 King Abdullah University of Science and Technology 2016 Förslag Reef Genomics
Symbiodinium A3 stam Y106 ( Symbiodinium sp. clade A3) Dinoflagellat symbiont Okänd (sammansättningsstorlek 0,77 Gb) 69 018 Okinawa Institute of Science and Technology 2018 Förslag OIST Marine Genomics

Cryptomonad

Organism

anstränga

Typ Relevans Genomstorlek siffra

av gener

förutspått

Organisation År av

komplettering

hopsättning

status

Länkar
Cryptophyceae sp. CCMP2293 Nanoflagellat Nukleomorf , Psykrofil 534,5 Mb 33 051 Joint Genome Institute 2016 JGI Genome Portal
Guillardia theta Eukaryot endosymbios 87,2 Mb 24, 840 Dalhousie University 2012 Växthuset

Glaukofyt

Organism

anstränga

Typ Relevans Genom

storlek

siffra

av gener

förutspått

Organisation År av

komplettering

hopsättning

status

Länkar
Cyanophora

paradoxa

Modell

Organism

70,2 Mb 3 900 Rutgers University 2012 Utkast v1 Växthuset

Cyanophora Genome Project

Cyanophora

paradoxa

Modell

Organism

99,94 Mb 25,831 Rutgers University 2019 Utkast v2 Cyanophora Genome Project

Grönalger

Organism

anstränga

Typ Relevans Genom

storlek

siffra

av gener

förutspått

Organisation År av

komplettering

hopsättning

status

Länkar
Asterochloris sp. Cgr/DA1pho Photobiont 55,8 Mb 10 025 Duke University 2011 JGI Genome Portal
Auxenochlorella prototekoider Biobränslen 22,9 Mb 7 039 Tsinghua-universitetet 2014 Växthuset
Bathycoccus prasinos Jämförande analys 15,1 Mb 7 900 Joint Genome Institute 2012 JGI Genome Portal
Chlamydomonas reinhardtii CC-503

cw92 mt+

Modell organism 111,1 Mb 17,741 Joint Genome Institute 2017 Fytozom

Växthuset

Chlorella sorokiniana str. 1228 Biobränslen 61,4 Mb Los Alamos National Lab 2018 Växthuset
Chlorella sorokiniana UTEX 1230 Biobränslen 58,5 Mb Los Alamos National Lab 2018 Växthuset
Chlorella sorokiniana DOE1412 Biobränslen 57,8 Mb Los Alamos National Lab 2018 Växthuset
Chlorella variabilis NC64A Biobränslen 46,2 Mb 9,791 2010 Växthuset
Chlorella vulgaris Biobränslen 37,3 Mb Nationellt förnybart

Energilaboratoriet

2015 Växthuset
Coccomyxa subellipsoidea

sp. C-169

Biobränslen 48,8 Mb 9839 Joint Genome Institute 2012 Fytozom

Växthuset

Dunaliella salina

CCAP19/18

Halofil

Biobränslen

Betakaroten och glycerolproduktion _

343,7 Mb 16 697 Joint Genome Institute 2017 Fytozom
Eudorina sp. Flercelliga alger,

modellorganism

~180 Mb Tokyos universitet 2018
Gonium pectorale 148,81 Mb Kansas State University 2016
Micromonas commoda NOUM17 (RCC288) Marint växtplankton 21,0 Mb 10,262 Monterey Bay Aquarium Research Institute 2013 JGI Genome Portal
Micromonas

pusilla CCMP-1545

Marin

växtplankton

21,9 Mb 10,575 Micromonas

Genom

Konsortium

2009 Fytozom

Växthuset

Micromonas

pusilla

RCC299/NOUM17

Marin

växtplankton

20,9 Mb 10 056 Gemensamt genom

Inleda

2009 Fytozom

De

Växthus

Monoraphidium

neglectum

Biobränslen 69,7 Mb 16 755 Bielefeld

universitet

2013 De

Växthus

Ostreokocker

lucimarinus

CCE9901

Litet genom 13,2 Mb 7,603 Joint Genome Institute 2007 Fytozom
Ostreokocker

tauri OTH95

Litet genom 12,9 Mb 7 699 CNRS 2014 Växthuset
Ostreococcus sp.

RCC809

Litet genom 13,3 Mb 7,492 Gemensamt genom

Inleda

2009 JGI
Picochlorum

soloecism

DOE101

Biobränslen 15,2 Mb 7,844 Los Alamos

National Lab

2017 Växthuset
Picochlorum

SENEW3

Biobränslen 13,5 Mb 7,367 Rutgers University 2014 Växthuset
Scenedesmus

obliquus DOE0152Z

Biobränslen 210,3 Mb Brooklyn College 2017 Växthuset
Symbiochloris reticulata (Metagenome) Photobiont 58,6 Mb 12 720 Joint Genome Institute 2018 JGI Genome Portal
Tetraselmis sp. Biobränslen 228 Mb Los Alamos

National Lab

2018 Växthuset
Volvox carteri Flercelliga alger,

modellorganism

131,2 Mb 14 247 Gemensamt genom

Inleda

2010 Fytozom

De

Växthus

Yamagishiella unicocca Flercelliga alger,

modellorganism

~140 Mb Tokyos universitet 2018


Haptofyt

Organism

anstränga

Typ Relevans Genom

storlek

siffra

av gener

förutspått

Organisation År av

komplettering

hopsättning

status

Länkar
Chrysochromulina

parva

Biobränslen 65,8 Mb Los Alamos National Laboratory 2018 Växthuset
Chrysochromulina tobinii CCMP291 Modellorganism, Biobränslen 59,1 Mb 16,765 University of Washington 2015 Växthuset
Emiliania huxleyi Coccolithophore Alkenonproduktion, algblomning 167,7 Mb 38,554 Joint Genome Institute 2013 Växthuset
Pavlovales sp. CCMP2436 Psykrofil 165,4 Mb 26 034 Joint Genome Institute 2016 JGI Genome Portal

Heterokonter / Stramenopiles

Organism

anstränga

Typ Relevans Genom

storlek

siffra

av gener

förutspått

Organisation År av

komplettering

hopsättning

status

Länkar
Aureokocker

anophagefferens

Skadlig alg

Blomma

50,1 Mb 11 522 Joint Genome Institute 2011 Växthuset
Ectocarpus siliculosus Brunalger Modellorganism 198,5 Mb 16 269 Genoskop 2012 Växthuset
Fragilariopsis cylindrus CCMP1102 Psykrofil 61,1 Mb 21 066 University of East Anglia , Joint Genome Institute 2017 JGI Genome Portal
Nannokloropsis

gaditana

Biobränslen 28,5 Mb 10,486 Universitetet i Padua 2014 Växthuset
Nannokloropsis

oceanica

Biobränslen 31,5 Mb Chinese Academy of Sciences , Qingdao Institute of Bioenergy and Bioprocess Technology 2016 Växthuset
Nannochloropsis Salina CCMP1766 Biobränslen 24,4 Mb Chinese Academy of Sciences , Qingdao Institute of Bioenergy and Bioprocess Technology 2016 Växthuset
Ochromonadaceae sp. CCMP2298 Psykrofil 61,1 Mb 20 195 Joint Genome Institute 2016 JGI Genome Portal
Pelagophyceae sp. CCMP2097 Psykrofil 85,2 Mb 19,402 Joint Genome Institute 2016 JGI Genome Portal
Phaeodactylum tricornutum Modellorganism 27,5 Mb 10 408 Diatom Consortium 2008 Växthuset
Pseudo-nitzschia multiserie CLN-47 218,7 Mb 19,703 Joint Genome Institute 2011 JGI Genome Portal
Saccharina japonica Brunalger Kommersiell gröda 543,4 Mb Chinese Academy of Sciences , Beijing Institutes of Life Science 2015 Växthuset
Thalassiosira oceanica CCMP 1005 Modellorganism 92,2 Mb 34,642 Framtidens hav 2012 Växthuset
Thalassiosira pseudonana modellorganism 32,4 Mb 11,673 Diatom Consortium 2009 Växthuset

Röda alger (Rhodophyte)

Organism

anstränga

Typ Relevans Genom

storlek

siffra

av gener

förutspått

Organisation År av

komplettering

hopsättning

status

Länkar
Chondrus crispus Karragenanproduktion , modellorganism 105 Mb 9,606 Genoskop 2013 Växthuset
Cyanidioschyzon

merolae 10D

Modell

organism

16,5 Mb 4,775 National Institute

of Genetics , Japan

2007 Växthuset
Galdieria sulphuraria Extremofil 12,1 Mb University of York 2016 Växthuset
Gracilariopsis chorda Mesofil 92,1 Mb 10 806 Sungkyunkwan University 2018
Porphyridium purpureum Mesofil 19,7 Mb 8 355 Rutgers University 2013
Porphyra umbilicalis Marikultur 87,6 Mb 13 360 University of Maine 2017 Fytozom
Pyropia yezoensis Marikultur 43,5 Mb 10 327 National Research Institute of Fisheries Science 2013

Rhizaria

Organism

anstränga

Typ Relevans Genom

storlek

siffra

av gener

förutspått

Organisation År av

komplettering

hopsättning

status

Länkar
Bigelowiella natans Modellorganism 94. Mb 21,708 Dalhousie University 2012 Växthuset