JMJD6

JMJD6
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, PSR, PTDSR, PTDSR1, arginindemetylas och lysinhydroxylas, jumonji-domän som innehåller 6, arginindemetylas och lysinhydroxylas
Externa ID:n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Bifunktionellt arginindemetylas och lysyl-hydroxylas JMJD6 är ett enzym som hos människor kodas av JMJD6 -genen .

Fungera

Denna gen kodar för ett nukleärt protein med en JmjC-domän. JmjC-domäninnehållande proteiner tillhör den alfa-ketoglutaratberoende hydroxylas- superfamiljen. De förutspås fungera som proteinhydroxylaser eller histondemetylaser . Detta protein identifierades först som en förmodad fosfatidylserinreceptor involverad i fagocytos av apoptotiska celler . Efterföljande studier tyder på att proteinet kan korsreagera med en monoklonal antikropp som känner igen fosfatidylserinreceptorn och inte direkt fungerar i clearance av apoptotiska celler. Flera transkriptvarianter som kodar för olika isoformer har hittats för denna gen. På en fysiologisk nivå har JMJD6 en roll i angiogenes, processen för kärlbildning, medan ytterligare roller för JMJD6 i patofysiologiska processer var inblandade, såsom brösttumörbildning. Här hittades förhöjda JMJD6-nivåer i bröstcancer i samband med aggressivitet och metastaser hos möss.

Vidare läsning

•    Boeckel JN, Guarani V, Koyanagi M, Roexe T, Lengeling A, Schermuly RT, Gellert P, Braun T, Zeiher A, Dimmeler S (februari 2011). "Jumonji-domäninnehållande protein 6 (Jmjd6) krävs för angiogen spiring och reglerar splitsning av VEGF-receptor 1" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 108 (8): 3276–81. Bibcode : 2011PNAS..108.3276B . doi : 10.1073/pnas.1008098108 . PMC 3044381 . PMID 21300889 .
•    Webby CJ, Wolf A, Gromak N, Dreger M, Kramer H, Kessler B, Nielsen ML, Schmitz C, Butler DS, Yates JR, Delahunty CM, Hahn P, Lengeling A, Mann M, Proudfoot NJ, Schofield CJ, Böttger A (juli 2009). "Jmjd6 katalyserar lysylhydroxylering av U2AF65, ett protein associerat med RNA-splitsning" (PDF) . Vetenskap . 325 (5936): 90–3. Bibcode : 2009Sci...325...90W . doi : 10.1126/science.1175865 . hdl : 10033/78493 . PMID 19574390 . S2CID 38938528 .
•    Zakharova L, Dadsetan S, Fomina AF (oktober 2009). "Endogen Jmjd6-genprodukt uttrycks på cellytan och reglerar fagocytos i omogna monocytliknande aktiverade THP-1-celler". Journal of Cellular Physiology . 221 (1): 84–91. doi : 10.1002/jcp.21829 . PMID 19492415 . S2CID 12228555 .
•    Hahn P, Böse J, Edler S, Lengeling A (2008). "Genomisk struktur och uttryck av Jmjd6 och evolutionär analys i samband med relaterade JmjC-domäninnehållande proteiner" . BMC Genomics . 9 : 293. doi : 10.1186/1471-2164-9-293 . PMC 2453528 . PMID 18564434 .
•   Chang B, Chen Y, Zhao Y, Bruick RK (oktober 2007). "JMJD6 är ett histonarginindemetylas" . Vetenskap . 318 (5849): 444–7. Bibcode : 2007Sci...318..444C . doi : 10.1126/science.1145801 . PMID 17947579 .
•    Klose RJ, Kallin EM, Zhang Y (september 2006). "JmjC-domäninnehållande proteiner och histondemetylering". Naturrecensioner Genetik . 7 (9): 715–27. doi : 10.1038/nrg1945 . PMID 16983801 . S2CID 30005607 .
•    Williamson P, Schlegel RA (2005). "Gurmma: fosfatidylserinreceptorns hemliga identitet" . Journal of Biology . 3 (4): 14. doi : 10.1186/jbiol14 . PMC 549716 . PMID 15453906 .
•    Böse J, Gruber AD, Helming L, Schiebe S, Wegener I, Hafner M, Beales M, Köntgen F, Lengeling A (2005). "Fosfatidylserinreceptorn har väsentliga funktioner under embryogenes men inte vid avlägsnande av apoptotisk cell. " Journal of Biology . 3 (4): 15. doi : 10.1186/jbiol10 . PMC 549712 . PMID 15345036 .
•   Nagase T, Ishikawa K, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (februari 1998). "Förutsägelse av de kodande sekvenserna för oidentifierade mänskliga gener. IX. De kompletta sekvenserna av 100 nya cDNA-kloner från hjärnan som kan koda för stora proteiner in vitro" . DNA-forskning . 5 (1): 31–9. doi : 10.1093/dnares/5.1.31 . PMID 9628581 .
•    Fadok VA, Bratton DL, Rose DM, Pearson A, Ezekewitz RA, Henson PM (maj 2000). "En receptor för fosfatidylserin-specifik clearance av apoptotiska celler". Naturen . 405 (6782): 85–90. Bibcode : 2000Natur.405...85F . doi : 10.1038/35011084 . PMID 10811223 . S2CID 205006217 .
•    Ajmone-Cat MA, De Simone R, Nicolini A, Minghetti L (januari 2003). "Effekter av fosfatidylserin på p38 mitogenaktiverat proteinkinas, cykliskt AMP-svarande elementbindande protein och nukleär faktor-kappaB-aktivering i vilande och aktiverade mikrogliaceller" . Journal of Neurochemistry . 84 (2): 413–6. doi : 10.1046/j.1471-4159.2003.01562.x . PMID 12559004 . S2CID 29957905 .
•    Chan A, Seguin R, Magnus T, Papadimitriou C, Toyka KV, Antel JP, Gold R (september 2003). "Fagocytos av apoptotiska inflammatoriska celler av mikroglia och dess terapeutiska implikationer: uppsägning av CNS autoimmun inflammation och modulering av interferon-beta" . Glia . 43 (3): 231–42. doi : 10.1002/glia.10258 . PMID 12898702 . S2CID 9085775 .
•    Wang X, Wu YC, Fadok VA, Lee MC, Gengyo-Ando K, Cheng LC, Ledwich D, Hsu PK, Chen JY, Chou BK, Henson P, Mitani S, Xue D (november 2003). "Engulfment av cellkroppar förmedlad av C. elegans fosfatidylserinreceptor genom CED-5 och CED-12" ( PDF) . Vetenskap . 302 (5650): 1563–6. Bibcode : 2003Sci...302.1563W . doi : 10.1126/science.1087641 . PMID 14645848 . S2CID 25672278 .
•   Cui P, Qin B, Liu N, Pan G, Pei D (februari 2004). "Nukleär lokalisering av fosfatidylserinreceptorproteinet via multipla nukleära lokaliseringssignaler". Experimentell cellforskning . 293 (1): 154–63. doi : 10.1016/j.yexcr.2003.09.023 . PMID 14729065 .
•   Cao WM, Murao K, Imachi H, Hiramine C, Abe H, Yu X, Dobashi H, Wong NC, Takahara J, Ishida T (april 2004). "Fosfatidylserinreceptorn samarbetar med högdensitetslipoproteinreceptorn för att känna igen apoptotiska celler av tymussköterskeceller" . Journal of Molecular Endocrinology . 32 (2): 497–505. doi : 10.1677/jme.0.0320497 . PMID 15072554 .
•    Cikala M, Alexandrova O, David CN, Pröschel M, Stiening B, Cramer P, Böttger A (juni 2004). "Fosfatidylserinreceptorn från Hydra är ett nukleärt protein med potentiell Fe(II)-beroende oxygenasaktivitet" . BMC cellbiologi . 5 : 26. doi : 10.1186/1471-2121-5-26 . PMC 442123 . PMID 15193161 .
•   Hong JR, Lin GH, Lin CJ, Wang WP, Lee CC, Lin TL, Wu JL (november 2004). "Fosfatidylserinreceptorn krävs för uppslukningen av döda apoptotiska celler och för normal embryonal utveckling hos zebrafisk" . Utveckling . 131 (21): 5417–27. doi : 10.1242/dev.01409 . PMID 15469976 .
•    Köninger J, Balaz P, Wagner M, Shi X, Cima I, Zimmermann A, di Sebastiano P, Büchler MW, Friess H (januari 2005). "Fosfatidylserinreceptor vid kronisk pankreatit: bevis för en makrofagoberoende roll" . Annals of Surgery . 241 (1): 144–51. doi : 10.1097/01.sla.0000149304.89456.5a . PMC 1356857 . PMID 15622002 .