Jämförelse av kraftfältsimplementationer

Detta är en tabell över anmärkningsvärda datorprogram som implementerar molekylär mekanik kraftfält .

Program	OPLS	BÄRNSTEN	CHARMM	GAFFEL	MMFF	QVBMM	UFF	Kommentarer
Havsöra	UA	94, 96, 99SB, 03, GS, ii, Automatisk FF-generator	Nej	Nej	Nej	Nej	UFF- Dreiding- liknande fält	För proteiner , DNA , ligander
BÄRNSTEN	Ja	Ja	Via kammarverktyg sedan v11	Ja	Nej	Nej	Nej
Ascalaph Designer	UA	94, 99SB, 03	Nej	Nej	Nej	Nej	Nej
Avogadro	Nej	Nej	Nej	Ja	94, 94s	Nej	Ja
Ballong	Nej	Nej	Nej	Nej	94	Nej	Nej	MMFF94-liknande
CHEF	Ja	Nej	Nej	Nej	Nej	Nej	Nej
CHARMM	Ja*	Ja*	Ja*	Via CHARMM-GUI	Fullständig MMFF94, men koden ryktas inte underhållen	Nej	Nej	* i standarddistribution
Gabedit	Nej	Ja	Nej	Ja	Ja	Nej	Nej
Gaussisk mm verktyg	Nej	Ja	Nej	Nej	Nej	Nej	Ja	Dreiding fält tillgängligt
GROMACS	Ja	Ja*	Ja*	Ja	Nej	Nej	Nej	* i standarddistribution sedan v4.5.0
MOE	AA	89, 94, 99, även med Extended Hückel Theory	22, 27	Nej	94(s)	Nej	Nej
NAMD	Ja	Ja	Ja	Ja	Nej	Nej	Nej
F	Ja	Ja	Ja	Nej	Nej	Nej	Nej	För biopolymerer
Knåpa	UA, AA, AA/L	94, 96, 98, 99	19, 27	Nej	94	Nej	Nej	För proteiner , organiska molekyler
Towhee	UA, AA	86	19, 22, 27	Nej	94	Nej	Ja	Monte Carlo
Yasara	Nej	94, 96, 99, 03	Nej	Nej	Nej	Nej	Nej	Plus anpassade fält för hyrförfining

Se även