BOSS (molekylär mekanik)
| Originalförfattare | William L. Jørgensen |
|---|---|
| Utvecklare | Jorgensen Research Group, Yale University |
| Initial release | 1987 |
| Stabil frisättning | 4.9 / Januari 2013
|
| Skrivet i | Fortran |
| Operativ system | Unix , Linux , Windows |
| Plattform | x86 , x86-64 |
| Tillgänglig i | engelsk |
| Typ | Molekylär modellering |
| Licens | Proprietär |
| Hemsida |
Biochemical and Organic Simulation System ( BOSS ) är ett allmänt molekylärt modelleringsprogram som utför molekylära mekaniska beräkningar, Metropolis Monte Carlo statistiska mekaniksimuleringar och semiempiriska Austin Model 1 (AM1), PM3 och PDDG/PM3 kvantmekanikberäkningar . De molekylära mekanikberäkningarna omfattar energiminimering, normallägesanalys och konformationssökning med kraftfälten Optimized Potentials for Liquid Simulations ( OPLS ). BOSS är utvecklad av prof. William L. Jorgensen vid Yale University och distribueras kommersiellt av Cemcomco, LLC och Schrödinger , Inc.
Nyckelfunktioner
- OPLS kraftfältsuppfinnare _
- Geometrioptimering
- Semiempirisk kvantkemi
- MC-simuleringar för rena vätskor, lösningar, kluster eller gasfassystem
- Fria energier beräknas utifrån statistisk störningsteori ( FEP )
- TIP3P, TIP4P och TIP5P vattenmodeller
Se även
- Molekylär modellering
- Molekylär grafik
- Molekylredaktör
- Programvara för molekylär design
- Lista över programvara för Monte Carlo molekylär modellering
- Lista över molekylära grafiska system
- Jämförelse av programvara för molekylär mekanik modellering
- Abalone (molekylär mekanik)
- BÄRNSTEN
- Ascalaph Designer
- CHARMM
- GROMACS
- MDynaMix
- NAMD
- Tinker (programvara)