International Cancer Genome Consortium

International Cancer Genome Consortium ( ICGC ) är en frivillig vetenskaplig organisation som tillhandahåller ett forum för samarbete mellan världens ledande cancer- och genomforskare . ICGC lanserades 2008 för att koordinera storskaliga cancergenomstudier i tumörer från 50 cancertyper och/eller undertyper som är av största vikt över hela världen.

Systematiska studier av mer än 25 000 cancergenom på genomisk , epigenomisk och transkriptomisk nivå kommer att avslöja repertoaren av onkogena mutationer, avslöja spår av mutagena influenser, definiera kliniskt relevanta subtyper för prognos och terapeutisk hantering och möjliggöra utvecklingen av nya cancerterapier.

ICGC innehåller data från The Cancer Genome Atlas (TCGA) och Sanger Cancer Genome Project.

Professor Andrew Biankin AO, Regius-professor och chef för Wolfson Wohl Cancer Research Centre vid University of Glasgow har varit verkställande direktör och ordförande från 2018.

Mål

ICGC är en av de mest ambitiösa biomedicinska forskningsinsatserna sedan Human Genome Project . Konsortiet kommer att hjälpa till att koordinera nuvarande och framtida storskaliga projekt för att förstå de genomiska förändringar som är involverade i cancer av global oro. Katalogen som produceras av ICGC-medlemmar kommer att göras snabbt och fritt tillgängliga för kvalificerade forskare, vilket kommer att göra det möjligt för forskare över hela världen att använda den nya informationen för att utveckla bättre sätt att diagnostisera, behandla och förebygga många typer av cancer.

Syftet med ICGC är att ge en omfattande beskrivning av de somatiska (icke ärftliga) genomiska abnormiteterna som finns i det breda spektrumet av mänskliga tumörer. Med tanke på vår nuvarande kunskap om heterogeniteten hos tumörtyper och subtyper, satte ICGC ett mål att koordinera cirka 50 projekt, som vart och ett kommer att generera genomiska analyser på cirka 500 cancerprover av varje klass. Det är dock välkänt att cancer är mycket heterogen och hundratals typer/subtyper kan definieras. Därför är det uttalade målet med 50 ICGC-projekt inte avsett att, och kan inte, uttömmande täcka hela spektrumet av cancertyper.

ICGC:s finansierings- och forskningsmedlemmar som föreslår ett projekt måste godkänna ICGC:s policyer, som inkluderar krav på snabb datafrigivning, för rigorösa kvalitetsstandarder och för skydd av studiedeltagare.

Struktur och finansiering

ICGC finansieras av deltagande nationer, som var och en fokuserar på en eller flera cancerformer, med målet att kartlägga genomen för minst 50 typer av cancer. Konsortiets sekretariat finns vid Ontario Institute for Cancer Research i Toronto , Kanada, som också kommer att driva datakoordinationscentret. Provinsregeringen i Ontario gav finansiering på $40 miljoner, och varje deltagande finansiär förväntas bidra med $20 miljoner till varje projekt. Under 2009 stödde den tyska cancerhjälpen ett ICGC-projekt med 7,9 miljoner euro. Detta var det högsta belopp en privat organisation gav. Pengarna skänks av tyskar.

ICGC-medlemskap är öppet för alla enheter som går med på att följa dess principer och riktlinjer. ICGC har fått åtaganden från finansieringsorganisationer i Asien, Australien, Europa och Nordamerika för 47 projektteam i 15 jurisdiktioner för att studera över 21 000 tumörgenom. Projekt som för närvarande finansieras är att undersöka tumörer som påverkar urinblåsan, blod, ben, hjärna, bröst, livmoderhals, tjocktarm, huvud och hals, njure, lever, lunga, munhåla, äggstockar, bukspottkörtel, prostata, ändtarm, hud, mjuka vävnader, mage, sköldkörtel och livmoder. Med tiden förväntas ytterligare nationer och organisationer gå med i ICGC. De genomiska analyserna av tumörer utförda av ICGC-medlemmar i Australien och Kanada (cancer i bukspottkörteln), Kina (magcancer), Frankrike (levercancer), Tyskland (hjärncancer), Japan (levercancer), Spanien (blodcancer), Storbritannien (blod-, bröst-, lung- och hudcancer) och USA (blod-, hjärn-, bröst-, kolon-, njur-, lung-, äggstockscancer, rektal-, mag- och livmodercancer) är nu tillgängliga via Data Coordination Center som finns på ICGC:s webbplats.

Medlemmar av verkställande utskottet


Representanter med observatörsstatus:

Pågående forskningsprojekt

Varje deltagande land har en särskild tumörtyp som sitt primära forskningsmål:

Framtida arbete

ICGCmed

Inom ramen för massiva internationella sekvenseringsinsatser, och i väntan på den nya eran av precisionsmedicin, kommer The International Cancer Genome Consortium for Medicine (ICGCmed) att koppla den mängd genomisk data som redan har samlats, såväl som ny genomisk data som genereras, till klinisk information och hälsoinformation, inklusive livsstil, patienthistoria, cancerdiagnostiska data och svar på och överlevnad efter behandlingar, över hela cancerspektrumet. Med hjälp av denna storskaliga integrerade data kommer forskare, vetenskapsmän, beslutsfattare och kliniker att kunna arbeta med patienter, vårdgivare och andra för att utveckla förebyggande strategier, markörer för tidig upptäckt av sjukdom, mer specifika kriterier och metoder för diagnoser och prognoser, och interventioner baserade på att matcha patientens sjukdomsmolekylära subtyp med de mest effektiva kombinationerna av terapier.

Detta kommer att leda till upptäckten av nya terapeutiska mål, mer exakta sjukdomsdefinitioner och förbättrade strategier för att förhindra läkemedelsresistens.

Se även

externa länkar