Halorubrum lacusprofundi
| Halorubrum lacusprofundi | |
|---|---|
| Vetenskaplig klassificering | |
| Domän: | |
| Rike: | |
| Provins: | |
| Klass: | |
| Beställa: | |
| Familj: | |
| Släkte: | |
| Arter: |
H. lacusprofundi
Franzmann et al. 1989
|
| Binomialnamn | |
|
Halorubrum lacusprofundi |
|
| Synonymer | |
|
|
Halorubrum lacusprofundi är en stavformad, halofil arkeon i familjen Halorubraceae . Den isolerades först från Deep Lake i Antarktis på 1980-talet.
Genom
Flera stammar av H. lacusprofundi har upptäckts. Genomsekvenseringen av stammen ACAM 32 slutfördes 2008. Organismens genom består av två cirkulära kromosomer och en enda cirkulär plasmid . Kromosom I innehåller 2 735 295 baspar som kodar för 2 801 gener och kromosom II innehåller 525 943 baspar som kodar för 522 gener. Den enda plasmiden innehåller 431 338 baspar som kodar för 402 gener. Minst en stam av H. lacusprofundi (R1S1) innehåller en plasmid (pR1SE) som möjliggör horisontell genöverföring, vilket sker via en mekanism som använder vesikelinneslutna virusliknande partiklar.
Forskning
Dess β-galaktosidasenzym har studerats omfattande för att förstå hur proteiner fungerar i lågtemperaturmiljöer med hög salthalt.