Haloferacales

Haloferacales
Vetenskaplig klassificering
Domän:	Archaea
Provins:	Euryarchaeota
Klass:	Halobakterier
Beställa:	Haloferacales ; Gupta et al. 2015
Familj
	Haloferacaceae; Halorubraceae;

Haloferacales är en ordning av halofila , kemoorganotrofa eller heterotrofa arkéer inom klassen Haloarchaea . Typsläktet av denna ordning är Haloferax .

Namnet Haloferacales kommer från den latinska termen Haloferax, som syftar på ordningens typsläkte och suffixet "-ales", en ändelse som används för att beteckna en beställning. Tillsammans Haloferacales till en ordning vars nomenklaturtyp är släktet Haloferax .

Biokemiska egenskaper och molekylära signaturer

Medlemmar är halofiler och kan vara kemoorganotrofer eller heterotrofer och är isolerade från högsaltmiljöer som marina solsaltare och Döda havet . Vissa medlemmar är rörliga och innehåller gasvesiklar. Morfologi är variabel, inklusive stav, coccus eller platta kvadratiska former. Medlemmar av denna ordning växer optimalt i neutralt pH. DNA G+C-innehållet för denna ordning varierar mellan 55-66 mol%.

Denna ordning kan på ett tillförlitligt sätt särskiljas från andra halobakterier genom närvaron av fem konserverade signaturproteiner (CSPs) och fyra konserverade signaturindelar (CSIs) närvarande i följande proteiner: DNA-gyras B, prolyl-t-RNA-syntetas, acyl-CoA-syntetas och aspartyl /glutamyl-tRNA amido-transferas subenhet B.

Historisk systematik och aktuell taxonomi

Från och med 2021 innehåller Haloferacales två familjer, Haloferacaceae och Halorubraceae . Medlemmar av denna ordning var avgränsade från klassen Halobacteria , tidigare en stor fylogenetiskt obesläktad grupp av arter med distinkta biokemiska egenskaper och olika ekologiska nischer. Det mångsidiga utbudet av morfologiska och fysiologiska egenskaper gjorde det svårt att klargöra det evolutionära förhållandet inom klassen bortom en släktnivå.

År 2015, Gupta et al. föreslog uppdelningen av klassen Halobacteria i ordningarna Halobacteriales , Haloferacales och Natrialbales baserat på jämförande genomiska analyser och förgreningsmönstret för olika fylogenetiska träd konstruerade från flera olika datauppsättningar av konserverade proteiner och 16S rRNA-sekvenser. Molekylära markörer, specifikt konserverade signaturindels, specifika för denna ordning identifierades också som bevis som stöder uppdelningen oberoende av fylogenetiska träd. Varje ordning kan på ett tillförlitligt sätt särskiljas från varandra och andra arter baserat på närvaron av dessa CSI.

Se även

Lista över släkten Archaea

^ Sayers; et al. "Haloferacales" . National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomidatabas . Hämtad 2022-06-05 .
^ JP Euzéby. "Haloferacales" . Lista över prokaryota namn med Standing in Nomenclature ( LPSN) . Hämtad 2021-11-17 .
^ ^a ^b ^c ^d Gupta, Radhey S.; Naushad, Sohail; Baker, Sheridan (2015-03-01). "Fylogenomiska analyser och molekylära signaturer för klassen Halobacteria och dess två huvudklader: ett förslag till uppdelning av klassen Halobacteria i en ändrad ordning Halobacteriales och två nya ordnar, Haloferacales ord. nov. och Natrialbales ord. nov., innehållande de nya familjerna Haloferacaceae fam. nov. och Natrialbaceae fam. nov" . International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 65 (Pt_3): 1050–1069. doi : 10.1099/ijs.0.070136-0 . ISSN 1466-5026 .
^ ^a ^b "Beställ: Haloferacales" . lpsn.dsmz.de . Hämtad 2021-06-27 .
^ Grant, William D.; Kamekura, Masahiro; McGenity, Terry J.; Ventosa, Antonio (2015-09-14). "Halobakterieklass. nov" . Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria : 1–1. doi : 10.1002/9781118960608.cbm00026 .
^ Oren, Aharon (2012-02-01). "Taxonomi av familjen Halobacteriaceae: ett paradigm för att förändra begrepp i prokaryot systematik" . International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 62 (2): 263–271. doi : 10.1099/ijs.0.038653-0 . ISSN 1466-5026 .

[NCBI-1] Sayers; et al. "Haloferacales" . National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomidatabas . Hämtad 2022-06-05 .

[2] JP Euzéby. "Haloferacales" . Lista över prokaryota namn med Standing in Nomenclature ( LPSN) . Hämtad 2021-11-17 .

[:0-3] Gupta, Radhey S.; Naushad, Sohail; Baker, Sheridan (2015-03-01). "Fylogenomiska analyser och molekylära signaturer för klassen Halobacteria och dess två huvudklader: ett förslag till uppdelning av klassen Halobacteria i en ändrad ordning Halobacteriales och två nya ordnar, Haloferacales ord. nov. och Natrialbales ord. nov., innehållande de nya familjerna Haloferacaceae fam. nov. och Natrialbaceae fam. nov" . International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 65 (Pt_3): 1050–1069. doi : 10.1099/ijs.0.070136-0 . ISSN 1466-5026 .

[:1-4] "Beställ: Haloferacales" . lpsn.dsmz.de . Hämtad 2021-06-27 .

[5] Grant, William D.; Kamekura, Masahiro; McGenity, Terry J.; Ventosa, Antonio (2015-09-14). "Halobakterieklass. nov" . Bergey's Manual of Systematics of Archaea and Bacteria : 1–1. doi : 10.1002/9781118960608.cbm00026 .

[6] Oren, Aharon (2012-02-01). "Taxonomi av familjen Halobacteriaceae: ett paradigm för att förändra begrepp i prokaryot systematik" . International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 62 (2): 263–271. doi : 10.1099/ijs.0.038653-0 . ISSN 1466-5026 .