GvpA
| gvpA-gasvesikelsyntesprotein GvpA- | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| identifierare | |||||||
| Organism | |||||||
| Symbol | gvpA | ||||||
| Entrez | 1446785 | ||||||
| RefSeq (Prot) | NP_045970.1 | ||||||
| UniProt | P08958 | ||||||
| Övriga uppgifter | |||||||
| Kromosom | Genom: 0,02 - 0,02 Mb | ||||||
| |||||||
| GvpA- | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| identifierare | |||||||||
| Symbol | GvpA | ||||||||
| Pfam | PF00741 | ||||||||
| InterPro | IPR000638 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00207 | ||||||||
| |||||||||
GvpA är ett gasvesikelstrukturprotein som finns i olika phyla av bakterier och archaea till exempel i Halobacterium salinarum eller Haloferax mediterranei . Gasvesiklar är små, ihåliga, gasfyllda proteinstrukturer som finns i flera cyanobakteriella och arkebakteriella mikroorganismer. De tillåter placering av bakterierna på ett gynnsamt djup för tillväxt .
GvpA associerar med GvpC för att bygga upp gasvesiklar, ihåliga proteinstrukturer som används av planktoniska organismer för att utföra vertikal migration. GvpA utgör det mesta av strukturen, som så kallade "ribbor", stela β-sheets , medan GvpC stabiliserar vesikeln mot kollaps genom tvärbindning som α-helixar .
Sekvens
Sekvensen av GVPa är extremt välbevarad . GvpJ och gvpM, två proteiner som kodas i klustret av gener som krävs för gasvesikelsyntes i archaebacteria Halobacterium salinarium och Halobacterium mediterranei (Haloferax mediterranei), har visat sig vara evolutionärt relaterade till GVPa. Den exakta funktionen av dessa två proteiner är inte känd, även om de kan vara viktiga för att bestämma gasvesiklar för formbestämning . Den N-terminala domänen av Aphanizomenon flos-aquae protein gvpA/J är också relaterad till GVPa.
Strukturera
GvpA av Halobacterium salinarum är en 76 aminosyror lång 8 kDa hydrofob monomer.
Gasvesiklar är ihåliga cylindriska rör, stängda av en ihålig, konisk lock i varje ände. Både de koniska ändlocken och den centrala cylindern är uppbyggda av 4-5 nm breda ribbor som löper i rät vinkel mot strukturens långa axel. Gasvesiklar verkar bestå av två olika proteinkomponenter, GVPa och GVPc . GVPa, ett litet protein med cirka 70 aminosyrarester , är huvudbeståndsdelen i gasvesiklar och utgör den väsentliga kärnan i strukturen .