GRIA3

GRIA3
Tillgängliga strukturer
PDB	Ortologisk sökning:
Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, GLUR-C, GLUR-K3, GLUR3, GLURC, GluA3, MRX94, glutamatjonotrop receptor AMPA-typ subenhet 3, MRXSW
Externa IDs
Genplacering ( Human )
Chr.
Slutet
Genplacering ( Mus )
Chr.
Slutet
RNA uttrycksmönster
	; ;
Genontologi
Molekylär funktion
Cellkomponent
Biologisk process
	Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer
	Wikidata
Visa/redigera människa	Visa/redigera mus

Glutamatreceptor 3 är ett protein som hos människor kodas av GRIA3 -genen .

Fungera

Glutamatreceptorer är de dominerande excitatoriska neurotransmittorreceptorerna i däggdjurshjärnan och aktiveras i en mängd normala neurofysiologiska processer. Dessa receptorer är heteromera proteinkomplex med flera subenheter, som var och en har transmembranregioner, och alla arrangerade för att bilda en ligandstyrd jonkanal. Klassificeringen av glutamatreceptorer baseras på deras aktivering av olika farmakologiska agonister. Denna gen tillhör en familj av alfa-amino-3-hydroxi-5-metyl-4-isoxazolpropionat (AMPA)-receptorer. Alternativ skarvning vid detta ställe resulterar i flera olika isoformer som kan variera i sina signaltransduktionsegenskaper.

Genomstudier har avslöjat ett preliminärt samband mellan defekta GRIA3-varianter och en mycket förhöjd risk för schizofreni .

Interaktioner

GRIA3 har visats interagera med GRIP1 och PICK1 .

RNA-redigering

Flera jonkanaler och neurotransmittorer receptorer pre- mRNA som substrat för ADAR . Detta inkluderar 5 subenheter av glutamatreceptorn: jonotropa AMPA glutamatreceptorsubenheter ( Glur2 , Glur3 , Glur4 ) och kainatreceptorsubenheter ( Glur5 , Glur6 ). Glutamatstyrda jonkanaler är uppbyggda av fyra subenheter per kanal med varje subenhet som bidrar till porslingans struktur. Porslingans struktur är relaterad till den som finns i K ⁺ -kanaler (t.ex. mänsklig K _v 1.1 -kanal). Det humana K _v 1.1-kanalens pre-mRNA är också föremål för A till I RNA-redigering. Glutamatreceptorernas funktion är att förmedla snabb neurotransmission till hjärnan. Mångfalden av subenheterna bestäms, såväl som rna-splitsning genom RNA-redigeringshändelser för de individuella subenheterna. Detta ger upphov till den med nödvändighet höga mångfalden av dessa receptorer. GluR3 är en genprodukt av GRIA3-genen och dess pre-mRNA är föremål för RNA-redigering.

Typ

A till I RNA-redigering katalyseras av en familj av adenosindeaminaser som verkar på RNA (ADAR) som specifikt känner igen adenosiner inom dubbelsträngade regioner av pre-mRNA och deaminerar dem till inosin . Inosiner känns igen som guanosin av cellens translationsmaskineri. Det finns tre medlemmar av ADAR-familjen ADARs 1-3, där ADAR1 och ADAR2 är de enda enzymatiskt aktiva medlemmarna. ADAR3 tros ha en reglerande roll i hjärnan. ADAR1 och ADAR2 är allmänt uttryckta i vävnader medan ADAR3 är begränsad till hjärnan. De dubbelsträngade regionerna av RNA bildas genom basparning mellan rester i den närmaste regionen av redigeringsstället med rester vanligtvis i ett angränsande intron men kan vara en exonisk sekvens. Regionen som basparar ihop med redigeringsregionen är känd som en redigeringskomplementär sekvens (ECS)

Plats

Pre-mRNA för denna subenhet redigeras vid en position. R/G-redigeringsplatsen är belägen i exon 13 mellan M3- och M4-regionerna. Redigering resulterar i en kodonförändring från ett arginin (AGA) till ett glycin (GGA). Platsen för redigering motsvarar en bipartit ligandinteraktionsdomän hos receptorn. R/G-stället återfinns vid aminosyra 769 omedelbart före de 38-aminosyror långa flip and flop-modulerna införda genom alternativ splitsning. Flip- och Flop-former finns i både redigerade och oredigerade versioner av detta protein. Den editerande komplementära sekvensen (ECS) finns i en intronsekvens nära exonet. Den introniska sekvensen inkluderar ett 5'-splitsningsställe. Den förutsagda dubbelsträngade regionen är 30 baspar lång. Adenosinresten är felmatchad i genomiskt kodat transkript, men detta är inte fallet efter redigering. Trots liknande sekvenser som Q/R-stället för GluR-B, sker inte redigering på denna plats i GluR-3-pre-mRNA. Redigering resulterar i det riktade adenosinet, som är felmatchat före redigering i den dubbelsträngade RNA-strukturen för att bli matchat efter redigering. Den involverade intronsekvensen innehåller ett 5'-donatorsplitsningsställe.

Bevarande

Redigering förekommer även hos råtta.

förordning

Redigering av GluR-3 regleras i råtthjärnan från låga nivåer i embryonalstadiet till en stor ökning av redigeringsnivåer vid födseln. Hos människor redigeras 80-90 % av GRIA3-transkripten. Frånvaron av Q/R-ställeredigering i denna glutamatreceptorsubenhet beror på frånvaron av nödvändig intronsekvens som krävs för att bilda en duplex.

Konsekvenser

Strukturera

Redigering resulterar i en kodonändring från (AGA) till (GGA), en R till en G-ändring på redigeringsplatsen.

Fungera

Redigering på R/G-plats möjliggör snabbare återhämtning från desensibilisering. Oredigerad Glu-R på den här webbplatsen har långsammare återhämtningshastigheter. Redigering tillåter därför ihållande svar på snabba stimuli. En överhörning mellan redigering och skarvning kommer sannolikt att inträffa här. Redigering sker före skarvning. Alla AMPA-receptorer förekommer i flip och flop alternativt splitsade varianter. AMPA-receptorer som förekommer i Flop-formen desenstiseras snabbare än flip-formen. Redigering tros också påverka skarvningen på den här webbplatsen.

Se även

AMPA-receptor

Vidare läsning

Hollmann M, Hartley M, Heinemann S (1991). "Ca2+ permeabilitet för KA-AMPA-gated glutamatreceptorkanaler beror på subenhetssammansättning". Vetenskap . 252 (5007): 851–3. Bibcode : 1991Sci...252..851H . doi : 10.1126/science.1709304 . PMID 1709304 . S2CID 27103108 .
Rampersad V, Elliott CE, Nutt SL, et al. (1994). "Human glutamatreceptor hGluR3 flip and flop isoformer: kloning och sekvensering av cDNA och primär struktur av proteinerna". Biochim. Biophys. Acta . 1219 (2): 563–6. doi : 10.1016/0167-4781(94)90090-6 . PMID 7918660 .
Rogers SW, Andrews PI, Gahring LC, et al. (1994). "Autoantikroppar mot glutamatreceptorn GluR3 vid Rasmussens encefalit". Vetenskap . 265 (5172): 648–51. Bibcode : 1994Sci...265..648R . doi : 10.1126/science.8036512 . PMID 8036512 .
Tomiyama M, Rodriguez-Puertas R, Cortés R, et al. (1997). "Differentiell regional distribution av AMPA-receptorsubenhetsbudbärar-RNA i den mänskliga ryggmärgen som visualiseras av in situ hybridisering". Neurovetenskap . 75 (3): 901–15. doi : 10.1016/0306-4522(96)00321-1 . hdl : 10261/112658 . PMID 8951883 . S2CID 20271430 .
Osten P, Srivastava S, Inman GJ, et al. (1998). "AMPA-receptorn GluR2 C-terminalen kan förmedla en reversibel, ATP-beroende interaktion med NSF och alfa- och beta-SNAPs. " Neuron . 21 (1): 99–110. doi : 10.1016/S0896-6273(00)80518-8 . PMID 9697855 .
Srivastava S, Osten P, Vilim FS, et al. (1998). "Ny förankring av GluR2/3 till den postsynaptiska densiteten genom det AMPA-receptorbindande proteinet ABP" . Neuron . 21 (3): 581–91. doi : 10.1016/S0896-6273(00)80568-1 . PMID 9768844 .
Hayashi T, Umemori H, Mishina M, Yamamoto T (1999). "AMPA-receptorn interagerar med och signalerar genom proteinet tyrosinkinas Lyn". Naturen . 397 (6714): 72–6. Bibcode : 1999Natur.397...72H . doi : 10.1038/16269 . PMID 9892356 . S2CID 4327273 .
Amir R, Dahle EJ, Toriolo D, Zoghbi HY (2000). "Kandidatgenanalys i Retts syndrom och identifieringen av 21 SNPs i Xq". Am. J. Med. Genet . 90 (1): 69–71. doi : 10.1002/(SICI)1096-8628(20000103)90:1<69::AID-AJMG12>3.0.CO;2-W . PMID 10602120 .
Aruscavage PJ, Bass BL (2000). "En fylogenetisk analys avslöjar en ovanlig sekvenskonservering inom introner involverade i RNA-redigering" . RNA . 6 (2): 257–69. doi : 10.1017/S1355838200991921 . PMC 1369911 . PMID 10688364 .
Gahring L, Carlson NG, Meyer EL, Rogers SW (2001). "Granzyme B-proteolys av en neuronal glutamatreceptor genererar ett autoantigen och moduleras av glykosylering" . J. Immunol . 166 (3): 1433–8. doi : 10.4049/jimmunol.166.3.1433 . PMID 11160179 .
Liu QJ, Gong YQ, Chen BX, et al. (2001). "[Länkanalys och mutationsdetektering av GRIA3 i Smith--Fineman--Myers syndrom]". Yi Chuan Xue Bao . 28 (11): 985–90. PMID 11725645 .
Hirbec H, Perestenko O, Nishimune A, et al. (2002). "PDZ-proteinerna PICK1, GRIP och syntenin binder flera glutamatreceptorsubtyper. Analys av PDZ-bindande motiv" . J. Biol. Chem . 277 (18): 15221–4. doi : 10.1074/jbc.C200112200 . PMID 11891216 .
Wyszynski M, Kim E, Dunah AW, et al. (2002). "Interaktion mellan GRIP och liprin-alfa/SYD2 krävs för AMPA-receptorinriktning" . Neuron . 34 (1): 39–52. doi : 10.1016/S0896-6273(02)00640-2 . PMID 11931740 .
Tomiyama M, Rodríguez-Puertas R, Cortés R, et al. (2002). "Flip och flop skarvvarianter av AMPA-receptorsubenheter i ryggmärgen av amyotrofisk lateralskleros". Synaps . 45 (4): 245–9. CiteSeerX 10.1.1.575.9300 . doi : 10.1002/syn.10098 . PMID 12125045 . S2CID 28604714 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds human- och mus-cDNA-sekvenser" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Ganor Y, Besser M, Ben-Zakay N, et al. (2003). "Humana T-celler uttrycker en funktionell jonotrop glutamatreceptor GluR3, och glutamat triggar i sig integrinmedierad adhesion till laminin och fibronektin och kemotaktisk migration" . J. Immunol . 170 (8): 4362–72. doi : 10.4049/jimmunol.170.8.4362 . PMID 12682273 .
Flajolet M, Rakhilin S, Wang H, et al. (2004). "Proteinfosfatas 2C binder selektivt till och defosforylerar metabotropisk glutamatreceptor 3" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 100 (26): 16006–11. Bibcode : 2003PNAS..10016006F . doi : 10.1073/pnas.2136600100 . PMC 307683 . PMID 14663150 .
Kolleker A, Zhu JJ, Schupp BJ, et al. (2004). "Glutamatergisk plasticitet genom synaptisk leverans av GluR-B(lång)-innehållande AMPA-receptorer" . Neuron . 40 (6): 1199–212. doi : 10.1016/S0896-6273(03)00722-0 . PMID 14687553 .

externa länkar

GRIA3+protein,+human vid US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)
"FÖRJAT" .
http://darned.ucc.ie
Översikt över all strukturell information tillgänglig i PDB för UniProt : Q9Z2W9 (Glutamatreceptor 3) i PDBe-KB .

Denna artikel innehåller text från United States National Library of Medicine, som är allmän egendom .