Proteinkodande gen i arten Homo sapiens
GGA1
Tillgängliga strukturer
PDB
Ortologisk sökning:
Identifierare
, golgiassocierade, gamma adaptin ear innehållande, ARF-bindande protein 1
Externa ID:n
Wikidata
ADP-ribosyleringsfaktorbindande protein GGA1 är ett protein som hos människor kodas av GGA1 -genen .
Denna gen kodar för en medlem av den Golgi-lokaliserade, gamma-adaptin-öroninnehållande, ARF-bindande (GGA) proteinfamiljen. Medlemmar av denna familj är allestädes närvarande pälsproteiner som reglerar handeln med proteiner mellan trans-Golgi- nätverket och lysosomen . Dessa proteiner delar en aminoterminal VHS-domän som förmedlar sortering av mannos-6-fosfatreceptorerna vid trans-Golgi-nätverket. De innehåller också en karboxiterminal region med homologi med örondomänen av gamma-adaptiner. Flera alternativt splitsade transkriptvarianter som kodar för olika isoformer har hittats för denna gen.
Interaktioner
GGA1 har visats interagera med Sortilin 1 , BACE2 , RABEP1 och ARF3 .
Vidare läsning
Maruyama K, Sugano S (1994). "Oligo-capping: en enkel metod för att ersätta lockstrukturen för eukaryota mRNA med oligoribonukleotider". Gene . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). "Konstruktion och karakterisering av ett fullängdsanrikat och ett 5'-ändsanrikat cDNA-bibliotek". Gene . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
Dunham I, Shimizu N, Roe BA, et al. (1999). "DNA-sekvensen av human kromosom 22" . Naturen . 402 (6761): 489–95. Bibcode : 1999Natur.402..489D . doi : 10.1038/990031 . PMID 10591208 .
Boman AL, Zhang C, Zhu X, Kahn RA (2000). "En familj av ADP-ribosyleringsfaktoreffektorer som kan förändra membrantransport genom trans-Golgi" . Mol. Biol. Cell . 11 (4): 1241–55. doi : 10.1091/mbc.11.4.1241 . PMC 14844 . PMID 10749927 .
Takatsu H, Yoshino K, Nakayama K (2000). "Adaptor gamma öron homologi domän konserverad i gamma-adaptin och GGA proteiner som interagerar med gamma-synergin". Biochem. Biophys. Res. Commun . 271 (3): 719–25. doi : 10.1006/bbrc.2000.2700 . PMID 10814529 .
Zhdankina O, Strand NL, Redmond JM, Boman AL (2001). "Jäst GGA-proteiner interagerar med GTP-bunden Arf och underlättar transport genom Golgi". Jäst . 18 (1): 1–18. doi : 10.1002/1097-0061(200101)18:1<1::AID-YEA644>3.0.CO;2-5 . PMID 11124697 . S2CID 10348751 .
Puertollano R, Randazzo PA, Presley JF, et al. (2001). "GGAs främjar ARF-beroende rekrytering av clathrin till TGN" . Cell . 105 (1): 93–102. doi : 10.1016/S0092-8674(01)00299-9 . PMID 11301005 .
Puertollano R, Aguilar RC, Gorshkova I, et al. (2001). "Sortering av mannos 6-fosfatreceptorer förmedlade av GGA". Vetenskap . 292 (5522): 1712–6. Bibcode : 2001Sci...292.1712P . doi : 10.1126/science.1060750 . PMID 11387475 . S2CID 30836125 .
Takatsu H, Katoh Y, Shiba Y, Nakayama K (2001). "Golgi-lokaliserande, gamma-adaptin öronhomologidomän, ADP-ribosyleringsfaktorbindande (GGA) proteiner interagerar med sura dileucinsekvenser inom de cytoplasmatiska domänerna av sorteringsreceptorer genom deras Vps27p/Hrs/STAM (VHS) domäner" . J. Biol. Chem . 276 (30): 28541–5. doi : 10.1074/jbc.C100218200 . PMID 11390366 .
Jacobsen L, Madsen P, Nielsen MS, et al. (2002). "Den sorLA cytoplasmatiska domänen interagerar med GGA1 och -2 och definierar minimikrav för GGA-bindning". FEBS Lett . 511 (1–3): 155–8. doi : 10.1016/S0014-5793(01)03299-9 . PMID 11821067 . S2CID 21977507 .
Shiba T, Takatsu H, Nogi T, et al. (2002). "Strukturell grund för igenkänning av sur-kluster-dileucinsekvens av GGA1". Naturen . 415 (6874): 937–41. Bibcode : 2002Natur.415..937S . doi : 10.1038/415937a . PMID 11859376 . S2CID 4395774 .
Takatsu H, Yoshino K, Toda K, Nakayama K (2002). "GGA-proteiner associerar med Golgi-membran genom interaktion mellan deras GGAH-domäner och ADP-ribosyleringsfaktorer" . Biochem. J . 365 (Pt 2): 369–78. doi : 10.1042/BJ20020428 . PMC 1222692 . PMID 11950392 .
Doray B, Bruns K, Ghosh P, Kornfeld SA (2002). "Autoinhibering av ligandbindningsstället för GGA1/3 VHS-domäner av ett internt surt kluster-dileucin-motiv" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (12): 8072–7. Bibcode : 2002PNAS...99.8072D . doi : 10.1073/pnas.082235699 . PMC 123022 . PMID 12060753 .
He X, Chang WP, Koelsch G, Tang J (2002). "Memapsin 2 (beta-sekretas) cytosolisk domän binder till VHS-domänerna av GGA1 och GGA2: implikationer på endocytosmekanismen för memapsin 2" . FEBS Lett . 524 (1–3): 183–7. doi : 10.1016/S0014-5793(02)03052-1 . PMID 12135764 .
Boman AL, Salo PD, Hauglund MJ, et al. (2003). "ADP-ribosyleringsfaktor (ARF) interaktion är inte tillräcklig för jäst GGA-proteinfunktion eller lokalisering" . Mol. Biol. Cell . 13 (9): 3078–95. doi : 10.1091/mbc.E02-02-0078 . PMC 124144 . PMID 12221117 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). "Generering och initial analys av mer än 15 000 fullängds human- och mus-cDNA-sekvenser" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
Mattera R, Arighi CN, Lodge R, et al. (2003). "Divalent interaktion av GGA med Rabaptin-5-Rabex-5-komplexet" . EMBO J . 22 (1): 78–88. doi : 10.1093/emboj/cdg015 . PMC 140067 . PMID 12505986 .
Mills IG, Praefcke GJ, Vallis Y, et al. (2003). "EpsinR: ett AP1/clathrin-interagerande protein involverat i vesikelhandel" . J. Cell Biol . 160 (2): 213–22. doi : 10.1083/jcb.200208023 . PMC 2172650 . PMID 12538641 .
PDB galleri
1j2j : Kristallstruktur av GGA1 GAT N-terminal region i komplex med ARF1 GTP-form
1jwf : Kristallstruktur av human GGA1 VHS-domän.
1jwg : VHS-domän av human GGA1 komplexbunden med katjonoberoende M6PR C-terminal peptid
1na8 : Kristallstruktur av ADP-ribosyleringsfaktorbindande protein GGA1
1naf : kristallstruktur av den mänskliga GGA1 GAT-domänen
1nwm : GAT-domän för mänsklig GGA1
1o3x : Kristallstruktur av human GGA1 GAT-domän
1om9 : Struktur av GGA1-bihanget i komplex med den p56-bindande peptiden
1oxz : Kristallstruktur för den mänskliga GGA1 GAT-domänen
1py1 : Komplex av GGA1-VHS-domän och beta-sekretas C-terminal fosfopeptid
1ujj : VHS-domän av human GGA1 komplexbunden med C-terminal peptid från BACE
1ujk : VHS-domän av human GGA1 komplexbunden med C-terminal fosfopeptid från BACE
1x79 : Kristallstruktur av human GGA1 GAT-domän komplexbunden med den GAT-bindande domänen av Rabaptin5
2dwx : Samkristallstrukturanalys av GGA1-GAE med WNSF-motivet
2dwy : Kristallstrukturanalys av GGA1-GAE