RABEP1

RABEP1
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, RAB5EP, RABPT5, rabaptin, RAB GTPas-bindande effektorprotein 1
Externa ID:n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Rab GTPase-bindande effektorprotein 1 är ett enzym som hos människor kodas av RABEP1 -genen . Det tillhör rabaptinproteinfamiljen .

Interaktioner

RABEP1 har visat sig interagera med:

• AP1G1 ,
• GGA1 ,
• GGA2 ,
• RAB4A och
• RAB5A .

Vidare läsning

•   Xiao GH, Shoarinejad F, Jin F, Golemis EA, Yeung RS (mars 1997). "Genprodukten tuberös skleros 2, tuberin, fungerar som ett Rab5 GTPase-aktiverande protein (GAP) vid modulering av endocytos" . Journal of Biological Chemistry . 272 (10): 6097–100. doi : 10.1074/jbc.272.10.6097 . PMID 9045618 .
•    Vitale G, Rybin V, Christoforidis S, Thornqvist P, McCaffrey M, Stenmark H, Zerial M (apr 1998). "Distinkta Rab-bindande domäner förmedlar interaktionen av Rabaptin-5 med GTP-bundet Rab4 och Rab5" . EMBO Journal . 17 (7): 1941–51. doi : 10.1093/emboj/17.7.1941 . PMC 1170540 . PMID 9524117 .
•    Neve RL, Coopersmith R, McPhie DL, Santeufemio C, Pratt KG, Murphy CJ, Lynn SD (okt 1998). "Det neuronala tillväxtassocierade proteinet GAP-43 interagerar med rabaptin-5 och deltar i endocytos. " Journal of Neuroscience . 18 (19): 7757–67. doi : 10.1523/JNEUROSCI.18-19-07757.1998 . PMC 6793001 . PMID 9742146 .
•   Swanton E, Bishop N, Woodman P (dec 1999). "Humant rabaptin-5 klyvs selektivt av kaspas-3 under apoptos" . Journal of Biological Chemistry . 274 (53): 37583–90. doi : 10.1074/jbc.274.53.37583 . PMID 10608812 .
•    Nagelkerken B, Van Anken E, Van Raak M, Gerez L, Mohrmann K, Van Uden N, Holthuizen J, Pelkmans L, Van Der Sluijs P (Mar 2000). "Rabaptin4, en ny effektor av det lilla GTPaset rab4a, rekryteras till perinukleära återvinningsvesiklar" . The Biochemical Journal . 346 (3): 593–601. doi : 10.1042/0264-6021:3460593 . PMC 1220890 . PMID 10698684 .
•    Hirst J, Lui WW, Bright NA, Totty N, Seaman MN, Robinson MS (april 2000). "En familj av proteiner med gamma-adaptin och VHS-domäner som underlättar trafik mellan trans-Golgi-nätverket och vakuolen/lysosomen" . Journal of Cell Biology . 149 (1): 67–80. doi : 10.1083/jcb.149.1.67 . PMC 2175106 . PMID 10747088 .
•    Korobko IV, Korobko EV, Kiselev SL (november 2000). "MAK-V-proteinkinaset reglerar endocytos hos mus". Molekylär och allmän genetik . 264 (4): 411–8. doi : 10.1007/s004380000293 . PMID 11129044 . S2CID 21231710 .
•    Zhu Y, Doray B, Poussu A, Lehto VP, Kornfeld S (juni 2001). "Bindning av GGA2 till det lysosomala enzymsorteringsmotivet av mannos 6-fosfatreceptorn". Vetenskap . 292 (5522): 1716–8. Bibcode : 2001Sci...292.1716Z . doi : 10.1126/science.1060896 . PMID 11387476 . S2CID 9453730 .
•    Valsdottir R, Hashimoto H, Ashman K, Koda T, Storrie B, Nilsson T (november 2001). "Identifiering av rabaptin-5, rabex-5 och GM130 som förmodade effektorer av rab33b, en regulator av retrograd trafik mellan Golgi-apparaten och ER". FEBS Bokstäver . 508 (2): 201–9. doi : 10.1016/S0014-5793(01)02993-3 . PMID 11718716 . S2CID 21545088 .
•    de Renzis S, Sönnichsen B, Zerial M (feb 2002). "Divalenta Rab-effektorer reglerar den subkompartmentella organisationen och sorteringen av tidiga endosomer". Naturens cellbiologi . 4 (2): 124–33. doi : 10.1038/ncb744 . PMID 11788822 . S2CID 6596498 .
•    Mattera R, Arighi CN, Lodge R, Zerial M, Bonifacino JS (Jan 2003). "Divalent interaktion av GGA med Rabaptin-5-Rabex-5-komplexet" . EMBO Journal . 22 (1): 78–88. doi : 10.1093/emboj/cdg015 . PMC 140067 . PMID 12505986 .
•   Mattera R, Puertollano R, Smith WJ, Bonifacino JS (juli 2004). "Den triheliska buntsubdomänen av GGA-proteinerna interagerar med flera partners genom överlappande men distinkta platser" . Journal of Biological Chemistry . 279 (30): 31409–18. doi : 10.1074/jbc.M402183200 . PMID 15143060 .
•   Jin J, Smith FD, Stark C, Wells CD, Fawcett JP, Kulkarni S, Metalnikov P, O'Donnell P, Taylor P, Taylor L, Zougman A, Woodgett JR, Langeberg LK, Scott JD, Pawson T (aug 2004) . "Proteomisk, funktionell och domänbaserad analys av in vivo 14-3-3-bindande proteiner involverade i cytoskelettreglering och cellulär organisation" . Aktuell biologi . 14 (16): 1436–50. doi : 10.1016/j.cub.2004.07.051 . PMID 15324660 .
•    Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, Yamamoto J, Sekine M, Tsuritani K, Wakaguri H, Ishii S, Sugiyama T, Saito K, Isono Y, Irie R, Kushida N, Yoneyama T , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (januari 2006 ). "Diversifiering av transkriptionsmodulering: storskalig identifiering och karakterisering av förmodade alternativa promotorer av mänskliga gener" . Genomforskning . 16 (1): 55–65. doi : 10.1101/gr.4039406 . PMC 1356129 . PMID 16344560 .
•    Ewing RM, Chu P, Elisma F, Li H, Taylor P, Climie S, McBroom-Cerajewski L, Robinson MD, O'Connor L, Li M, Taylor R, Dharsee M, Ho Y, Heilbut A, Moore L, Zhang S, Ornatsky O, Bukhman YV, Ethier M, Sheng Y, Vasilescu J, Abu-Farha M, Lambert JP, Duewel HS, Stewart II, Kuehl B, Hogue K, Colwill K, Gladwish K, Muskat B, Kinach R, Adams SL, Moran MF, Morin GB, Topaloglou T, Figeys D (2007). "Storskalig kartläggning av interaktioner mellan humant protein och protein genom masspektrometri" . Molekylär systembiologi . 3 (1): 89. doi : 10.1038/msb4100134 . PMC 1847948 . PMID 17353931 .