Faderskapsindex

I faderskapstestning är faderskapsindex (PI ) ett beräknat värde som genereras för en enskild genetisk markör eller lokus (kromosomalt läge eller ställe för DNA -sekvens av intresse) och är associerat med den statistiska styrkan eller vikten av det lokuset till förmån för eller mot föräldraskap givet de testade deltagarnas fenotyper och arvsscenariot. Fenotyp hänvisar vanligtvis till fysiska egenskaper såsom kroppsplan, färg, beteende, etc. hos organismer. Men termen som används inom området för DNA-faderskapstestning syftar på vad som observeras direkt i laboratoriet. Laboratorier involverade i föräldratestning och andra områden av mänsklig identitet använder genetiska testpaneler som innehåller ett batteri av loci (plural för locus) som var och en väljs på grund av omfattande alleliska variationer inom och mellan populationer. Dessa genetiska variationer antas inte ge fysiska och/eller beteendemässiga attribut till personen som bär det eller de alleliska arrangemangen och är därför inte föremål för selektivt tryck och följer Hardy Weinbergs arvsmönster.

Produkten av de individuella PI:erna är CPI (Combined Paternity Index) som i slutändan används för att beräkna sannolikheten för faderskap som ses på faderskapstestrapporter. Kraven på minsta sannolikhet för faderskapsvärde för delstatsfall skiljer sig åt mellan staterna men AABB kräver i sina standarder för relationstestlaboratorier (för närvarande i den 9:e upplagan) att minst 99,0 % ska rapporteras där den testade mannen "inte exkluderas" som biologisk fader av barnet i fråga. US Department of State kräver en minsta sannolikhet för faderskap på 99,5 % för alla immigrationsfall.

PI-beräkningar använder allelfrekvenser genererade från etablerade populationsdatabaser som oftast använder Short Tandem Repeats .

Eftersom allelfrekvenser antingen kan genereras internt eller publiceras, kan PI:er skilja sig åt mellan företag. Detta är ett förstått fenomen och berättigat bland medlemmar av testgemenskapen. ^{[ citat behövs ]}

Beräkningar

PI är ett sannolikhetsförhållande som genereras genom att jämföra två sannolikheter där PI = X/Y :

Täljare (“X”) – Sannolikheten att vi observerar fenotyperna hos de testade deltagarna i arvsscenariot givet att den testade mannen är den sanna biologiska fadern. Enklare, sannolikheten att någon händelse kommer att inträffa givet en viss uppsättning omständigheter eller förhållanden. Denna beräkning förutsätter att de testade individerna är en "sann trio/duo" (vilket förklaras två stycken nedåt) eller med andra ord, den eller de förälder som testas är de sanna biologiska föräldrarna.
Nämnare (“Y”) – Sannolikheten att vi observerar fenotyperna hos de testade deltagarna i arvsscenariot givet att en slumpmässig man är den sanna biologiska fadern. Enklare, sannolikheten att någon händelse inträffar givet en annan uppsättning omständigheter eller förhållanden. Denna beräkning förutsätter att de testade individerna är en "falsk trio/duo" eller med andra ord, föräldern/föräldrarna som testas inte är de sanna biologiska föräldrarna.

I allmänhet kan X/Y översättas som: Det är X/Y gånger mer sannolikt att se de observerade fenotyperna om den testade mannen är den sanna biologiska fadern än om en oprövad, obesläktad slumpmässigt utvald man från samma raspopulation var den sanna biologisk far.

Det finns 14 möjliga trio-faderskapskombinationer och 5 möjliga duo-faderskapskombinationer.

Se även

Vidare läsning

Budowle, B; Monson, KL; Chakraborty, R (1996). "Uppskattning av lägsta allelfrekvenser för DNA-profilfrekvensuppskattningar för PCR-baserade loci". International Journal of Legal Medicine . 108 (4): 173–6. doi : 10.1007/BF01369786 . PMID 8652419 . S2CID 11097755 .
Budowle, B; Sprecher, CJ (2001). "Konkordansstudie på populationsdatabasprover med PowerPlex 16-kit och AmpFlSTR Profiler Plus-kit och AmpFlSTR COfiler-kit". Journal of Forensic Sciences . 46 (3): 637–41. doi : 10.1520/JFS15016J . PMID 11373002 .
Budowle, Bruce; Collins, Patrick J.; Dimsoski, Pero; Ganong, Constance K.; Hennessy, Lori K.; Leibelt, Craig S.; Rao-Coticone, Sulekha; Shadravan, Farideh; Reeder, Dennis J. (2001). "Befolkningsdata på STR Loci D2S1338 och D19S433" . Forensic Science Communications . 3 (3).
Levadokou, EN; Freeman, DA; Budzynski, MJ; Tidigt, BE; McElfresh, KC; Schumm, JW; Amin, AS; Kim, YK; et al. (2001). "Allelfrekvenser för fjorton STR-loci i PowerPlex 1.1- och 2.1-multiplexsystemen och Penta D-lokus i kaukasier, afroamerikaner, latinamerikaner och andra befolkningar i USA och Brasilien". Journal of Forensic Sciences . 46 (3): 736–61. PMID 11373021 .
Butler, JM; Decker, AE; Vallone, PM; Kline, MC (2006). "Allelfrekvenser för 27 Y-STR loci med amerikanska kaukasiska, afroamerikanska och latinamerikanska prover" . Forensic Science International . 156 (2–3): 250–60. doi : 10.1016/j.forsciint.2005.02.011 . PMID 16410169 .
Butler, JM; Schoske, R; Vallone, PM; Redman, JW; Kline, MC (2003). "Allelfrekvenser för 15 autosomala STR-loci på amerikanska kaukasiska, afroamerikanska och latinamerikanska populationer". Journal of Forensic Sciences . 48 (4): 908–11. doi : 10.1520/JFS2003045 . PMID 12877323 .
Vallone, PM; Decker, AE; Butler, JM (2005). "Allelfrekvenser för 70 autosomala SNP-loci med amerikanska kaukasiska, afroamerikanska och latinamerikanska prover" . Forensic Science International . 149 (2–3): 279–86. doi : 10.1016/j.forsciint.2004.07.014 . PMID 15749374 .
Brenner CH (1999) Släktskapsanalys genom DNA när det finns många möjligheter, Progress in Forensic Genetics 8, Eds G Sensabaugh et al. ISBN 978-0-444-50303-9 ^{[ sida behövs ]}
Que, TZ; Yan, PH; Lin, Y; Liu, Y; Li, L (2009). "Utvärderingen av Identifiler-systemet vid faderskapstestning". Fa Yi Xue Za Zhi . 25 (3): 184–6. PMID 19697775 .
Thomson, JA; Pilotti, V; Stevens, P; Ayres, KL; Debenham, PG (1999). "Validering av kort tandemupprepningsanalys för utredning av fall av omtvistat faderskap". Forensic Science International . 100 (1–2): 1–16. doi : 10.1016/S0379-0738(98)00199-6 . PMID 10356771 .

externa länkar