Exosortas

Identifierare för
transmembran exosortas (Exosortase_EpsH).
Symbol	Exosortase_EpsH
Pfam	PF09721
Tillgängliga proteinstrukturer: Pfam   strukturer / ECOD   PDB RCSB PDB ; PDBe ; PDBj PDBsumma struktur sammanfattning

Exosortas hänvisar till en familj av integrala membranproteiner som förekommer i gramnegativa bakterier som känner igen och klyver den karboxylterminala sorteringssignalen PEP-CTERM. Namnet härstammar från en förutspådd roll som är analog med sortas , trots avsaknaden av någon detekterbar sekvenshomologi , och en stark association av exosortasgener med exopolysackarid eller extracellulära polymersubstansbiosyntesloci . Många arkéer har ett arkeosortas , homologt med exosortaser snarare än med sortaser. Arkeosortas A känner igen signalen PGF-CTERM, som finns vid C-terminalen av vissa arkeala S-lagerproteiner . Efter bearbetning av arkeosortas A är PGF-CTERM-regionen borta, och ett prenyl-härlett lipidankare finns i C-terminalen istället.

Exosortas har inte i sig karakteriserats biokemiskt. Emellertid stödjer platsriktat mutagenesarbete på arkeosortas A, en arkeal homolog av exosortaser, starkt uppfattningen om ett Cys- aktivt ställe och konvergent evolution med sortasfamiljens transpeptidaser . En nyligen genomförd studie på Zoogloea resiniphila, en bakterie som finns i reningsverk för aktivt slam, har visat att PEP-CTERM-proteiner (och därmed även exosortas) är avgörande för flockbildning i vissa system .