Kristallografi öppen databas

Kristallografi öppen databas (COD)
Innehåll
Beskrivning	Kristallstrukturer och plattform för världsomspännande samarbete
Kontakt
Forskningscenter	Vilnius universitet
Författare	Saulius Gražulis
Primärt citat	Gražulis och al. (2012)
Utgivningsdatum	2004
Tillgång
Dataformat	Kristallografisk informationsfil (.cif)
Hemsida	http://www.crystallography.net
Offentlig SQL- åtkomst	http://wiki.crystallography.net/howtoquerycod/

Crystallography Open Database ( COD ) är en databas med kristallstrukturer . Till skillnad från liknande kristallografidatabaser är databasen helt öppen, med registrerade användare som kan bidra med publicerade och opublicerade strukturer av små molekyler och små till medelstora enhetscellkristaller till databasen. I maj 2016 har databasen mer än 360 000 poster. Databasen har olika bidragsgivare och innehåller kristallografiska informationsfiler enligt definitionen av International Union of Crystallography ( IUCr). Det finns för närvarande fem webbplatser över hela världen som speglar denna databas. 3D-strukturerna hos föreningar kan konverteras till indatafiler för 3D-skrivare.

Se även

^ ^a ^b Gražulis, Saulius; Daškevič Adriana; Merkys Andrius; Chateigner Daniel; Lutterotti Luca; Quirós Miguel; Serebryanaya Nadezhda R; Moeck Peter; Downs Robert T; Le Bail Armel (januari 2012). "Crystallography Open Database (COD): en öppen åtkomstsamling av kristallstrukturer och plattform för världsomspännande samarbete" . Nucleic Acids Res . England. 40 (Databasproblem): D420-7. doi : 10.1093/nar/gkr900 . PMC 3245043 . PMID 22070882 .
^ Oxford Journal - Nucleic Acids Research Crystallography Open Database (COD): en öppen samling av kristallstrukturer och plattform för världsomspännande samarbete 5 oktober 2011
^ Scalfani, Vincent F.; Williams, Antony J.; Tkachenko, Valery; Karapetyan, Karen; Pshenichnov, Alexey; Hanson, Robert M.; Liddie, Jahred M.; Bara, Jason E. (23 november 2016). "Programmatisk konvertering av kristallstrukturer till 3D-utskrivbara filer med Jmol" . Journal of Cheminformatics . 8 (1): 66. doi : 10.1186/s13321-016-0181-z . PMC 5122160 . PMID 27933103 .

externa länkar

[pmid22070882-1] Gražulis, Saulius; Daškevič Adriana; Merkys Andrius; Chateigner Daniel; Lutterotti Luca; Quirós Miguel; Serebryanaya Nadezhda R; Moeck Peter; Downs Robert T; Le Bail Armel (januari 2012). "Crystallography Open Database (COD): en öppen åtkomstsamling av kristallstrukturer och plattform för världsomspännande samarbete" . Nucleic Acids Res . England. 40 (Databasproblem): D420-7. doi : 10.1093/nar/gkr900 . PMC 3245043 . PMID 22070882 .

[2] Oxford Journal - Nucleic Acids Research Crystallography Open Database (COD): en öppen samling av kristallstrukturer och plattform för världsomspännande samarbete 5 oktober 2011

[3] Scalfani, Vincent F.; Williams, Antony J.; Tkachenko, Valery; Karapetyan, Karen; Pshenichnov, Alexey; Hanson, Robert M.; Liddie, Jahred M.; Bara, Jason E. (23 november 2016). "Programmatisk konvertering av kristallstrukturer till 3D-utskrivbara filer med Jmol" . Journal of Cheminformatics . 8 (1): 66. doi : 10.1186/s13321-016-0181-z . PMC 5122160 . PMID 27933103 .