Kondroitin B-lyas
| Kondroitin B- | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| lyasidentifierare | |||||||||
| EG nr. | 4.2.2.19 | ||||||||
| CAS-nr. | 52227-83-5 | ||||||||
| Databaser | |||||||||
| IntEnz | IntEnz-vy | ||||||||
| BRENDA | BRENDA inträde | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme-vy | ||||||||
| KEGG | KEGG inträde | ||||||||
| MetaCyc | Metabolisk väg | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB- strukturer | RCSB PDB PDBe PDB summa | ||||||||
| |||||||||
Enzymet kondroitin B-lyas ( EC 4.2.2.19 ) katalyserar följande process:
- Eliminativ klyvning av dermatansulfat innehållande (1→4)-β- D -hexosaminyl och (1→3)-β - D -glukurosonyl eller (1→3)-α- L -iduronosyl-bindningar till disackarider innehållande 4-deoxi-β - D -gluk-4-enuronosylgrupper för att ge en 4,5-omättad dermatansulfatdisackarid (AUA-GalNAc-4S).
Ordlista:
Detta enzym tillhör familjen lyaser , speciellt de kol-syrelyaser som verkar på polysackarider. Det systematiska namnet på denna enzymklass är kondroitin B-lyas . Andra namn i vanlig användning inkluderar kondroitinas B , ChonB och ChnB .
- Gu K, Linhardt RJ, Laliberte M, Gu K, Zimmermann J (1995). "Rening, karakterisering och specificitet av kondroitinlyaser och glykuronidas från Flavobacterium heparinum" . Biochem. J . 312 (Pt 2): 569–77. doi : 10.1042/bj3120569 . PMC 1136300 . PMID 8526872 .
- Pojasek K, Raman R, Kiley P, Venkataraman G, Sasisekharan R (2002). "Biokemisk karakterisering av det aktiva stället för kondroitinas B" . J. Biol. Chem . 277 (34): 31179–86. doi : 10.1074/jbc.M201552200 . PMID 12063249 .
- Pojasek K, Shriver Z, Kiley P, Venkataraman G, Sasisekharan R (2001). "Rekombinant uttryck, rening och kinetisk karakterisering av kondroitinas AC och kondroitinas B från Flavobacterium heparinum". Biochem. Biophys. Res. Commun . 286 (2): 343–51. doi : 10.1006/bbrc.2001.5380 . PMID 11500043 .
- Suzuki K, Terasaki Y, Uyeda M (2002). "Hämning av hyaluronidaser och kondroitinaser av fettsyror". J. Enzyme. Inhib. Med. Chem . 17 (3): 183–6. doi : 10.1080/14756360290032930 . PMID 12443044 .
- Ototani N, Yosizawa Z (1979). "Rening av kondroitinas B och kondroitinas C med användning av glykosaminoglykanbunden AH-Sepharose 4B". kolhydr. Res . 70 (2): 295–306. doi : 10.1016/S0008-6215(00)87109-8 . PMID 427837 .
- K, Zimmermann JJ; Su H (2000). "Isolering och uttryck i Escherichia coli av cslA och cslB, gener som kodar för de kondroitinsulfatnedbrytande enzymerna Chondroitinase AC respektive Chondroitinase B, från Flavobacterium heparinum" . Appl. Environ. Microbiol . 66 (1): 29–35. doi : 10.1128/AEM.66.1.29-35.2000 . PMC 91781 . PMID 10618199 .
- V, Sasisekharan R, Cygler M (2004). "Strukturen av kondroitin B-lyas komplexbunden med glykosaminoglykanoligosackarider avslöjar ett kalciumberoende katalytiskt maskineri" . J. Biol. Chem . 279 (31): 32882–96. doi : 10.1074/jbc.M403421200 . PMC 4135467 . PMID 15155751 .
- Li Y, Matte A, Su H, Cygler M (1999). "Kristallisation och preliminär röntgenanalys av kondroitinas B från Flavobacterium heparinum". Acta Crystallogr. D . 55 (Pt 5): 1055–7. doi : 10.1107/S0907444999002097 . PMID 10216304 .
- Huang W, Matte A, Li Y, Kim YS, Linhardt RJ, Su H, Cygler M (1999). "Kristallstruktur av kondroitinas B från Flavobacterium heparinum och dess komplex med en disackaridprodukt vid 1,7 A upplösning". J. Mol. Biol . 294 (5): 1257–69. doi : 10.1006/jmbi.1999.3292 . PMID 10600383 .
- Lauder RM; Nieduszynski, IA; Giannopoulos, M; Veckor, SD; Sadler, IH; Lauder, RM (2005). "Karakterisering av oligosackarider från kondroitin/dermatansulfater. 1H-NMR och 13C-NMR studier av reducerade trisackarider och hexasackarider". FEBS J . 272 (24): 6276–86. doi : 10.1111/j.1742-4658.2005.05009.x . PMID 16336265 .
Kategorier: