Kondroitin AC-lyas
| kondroitin AC- | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| lyasidentifierare | |||||||||
| EG nr. | 4.2.2.5 | ||||||||
| CAS-nr. | 9047-57-8 | ||||||||
| Databaser | |||||||||
| IntEnz | IntEnz-vy | ||||||||
| BRENDA | BRENDA inträde | ||||||||
| ExPASy | NiceZyme-vy | ||||||||
| KEGG | KEGG inträde | ||||||||
| MetaCyc | Metabolisk väg | ||||||||
| PRIAM | profil | ||||||||
| PDB- strukturer | RCSB PDB PDBe PDB summa | ||||||||
| Genontologi | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
Enzymet kondroitin AC-lyas ( EC 4.2.2.5 ) katalyserar den kemiska reaktionen
- Eliminativ nedbrytning av polysackarider innehållande 1,4-β - D -hexosaminyl- och 1,3-β - D -glukuronosylbindningar till disackarider innehållande 4-deoxi-β- D -gluk-4-enuronosylgrupper
Detta enzym tillhör familjen lyaser , speciellt de kol-syrelyaser som verkar på polysackarider. Det systematiska namnet på denna enzymklass är kondroitin AC-lyas . Andra namn i vanlig användning inkluderar kondroitinas (tvetydigt) , kondroitinsulfatlyas , kondroitin AC eliminase , kondroitin AC lyas , kondroitinas AC och ChnAC .
Strukturstudier
I slutet av 2007 har 11 strukturer lösts för denna klass av enzymer, med PDB - accessionskoderna 1CB8 , 1HM2 , 1HM3 , 1HMU , 1HMW , 1RW9 , 1RWA , 1RWC , 1RWF , 1RWRH och .
- NAKADA HI, WOLFE JB (1961). "Studier om enzymet kondroitinas: produktstruktur och joneffekter". Båge. Biochem. Biophys. 94 (2): 244–51. doi : 10.1016/0003-9861(61)90037-6 . PMID 13727579 .
- Pojasek K, Shriver Z, Kiley P, Venkataraman G, Sasisekharan R (2001). "Rekombinant uttryck, rening och kinetisk karakterisering av kondroitinas AC och kondroitinas B från Flavobacterium heparinum". Biochem. Biophys. Res. Commun. 286 (2): 343–51. doi : 10.1006/bbrc.2001.5380 . PMID 11500043 .
- Cygler M; Shilton, BH; Li, Y; Allaire, M; Laliberté, M; Eggimann, B; Cygler, M (1998). "Kristallisation och preliminär analys av kondroitinas AC från Flavobacterium heparinum". Acta Crystallogr. D . 54 (Pt 2): 279–80. doi : 10.1107/S0907444997009037 . PMID 9761894 .
- Lauder RM; Nieduszynski, IA; Giannopoulos, M; Veckor, SD; Sadler, IH; Lauder, RM (2005). "Karakterisering av oligosackarider från kondroitin/dermatansulfater. 1H-NMR och 13C-NMR studier av reducerade trisackarider och hexasackarider". FEBS J. 272 (24): 6276–86. doi : 10.1111/j.1742-4658.2005.05009.x . PMID 16336265 . S2CID 40325628 .
Kategorier: