Charles David Allis

Charles David Allis
C. David Allis.jpg
Född ( 1951-03-22 ) 22 mars 1951
dog 8 januari 2023 (2023-01-08) (71 år)
Utbildning
University of Cincinnati ( BSc ) Indiana University ( MSc , PhD )
Känd för Forskning av histonmodifikationer
Utmärkelser





Kanada Gairdner International Award Japan-priset Grand Prix Charles-Leopold Mayers genombrottspris i biovetenskap Gruber-priset i genetik Albert Lasker-priset för grundläggande medicinsk forskning Albany Medical Center-priset
Vetenskaplig karriär
Fält Epigenetik
institutioner


Rockefeller University University of Virginia University of Rochester Baylor College of Medicine
Avhandling Isolering och karakterisering av polceller och polära granuler från embryon av Drosophila melanogaster' (   1978)
Doktorand rådgivare Anthony Mahowald

Charles David Allis (22 mars 1951 – 8 januari 2023) var en amerikansk molekylärbiolog och professorn Joy and Jack Fishman vid Rockefeller University . Han var också chef för Laboratory of Chromatin Biology and Epigenetics och professor vid Tri-Institutional MD–PhD-programmet (de andra två institutionerna är Memorial Sloan Kettering Cancer Center och Weill Cornell Medicine ).

tidigt liv och utbildning

Allis föddes och växte upp i Cincinnati , Ohio . Hans far var stadsplanerare och hans mamma lågstadielärare . Han gick in på University of Cincinnati 1969, med huvudämne i biologi . Han hade sin första erfarenhet av grundforskning under sitt seniora (eller fjärde) år på BSc . Erfarenheten lockade honom till forskning, och han gick till Indiana University för forskarstudier. Han tog examen med en MSc 1975 och en doktorsexamen tre år senare, under ledning av Anthony Mahowald .

Karriär

Allis genomförde ett postdoktoralt stipendium vid University of Rochester efter att ha tagit sin doktorsexamen . 1981 började han på Baylor College of Medicine som biträdande professor vid avdelningen för biokemi och avdelningen för cellbiologi, och befordrades till docent 1986 och professor 1989. Han började på avdelningen för biologi vid Syracuse University College of Arts and Sciences 1990.

Allis återvände till University of Rochester 1995 och blev Marie Curran Wilson och Joseph Chamberlain Wilson professor i biologi två år senare. 1998 gick Allis till institutionen för biokemi och molekylär genetik vid University of Virginia School of Medicine . Han började på Rockefeller University 2003 som Joy and Jack Fishman- professor och chef för Laboratory of Chromatin Biology and Epigenetics .

Allis hade behandlats för cancer. Han dog den 8 januari 2023 på ett sjukhus i Seattle , Washington .

Forskning

Allis var känd för sin forskning om histonmodifieringar och deras relation till kromatinstruktur . Han började arbeta på Tetrahymena , en cilierad encellig eukaryot . Tetrahymena är en idealisk kandidat för att studera histonacetylering på grund av dess dubbla kärna . Den har en större makrokärna som är transkriptionellt aktiv och somatisk , och en mindre mikrokärna som är transkriptionellt tyst och könslinjeformig . Kromatinbiologi på den tiden var inte ett populärt ämne; inte heller var användningen av cilierade organismer.

1996 isolerade hans grupp histonacetyltransferas p55 från Tetrahymena , ett enzym som acetylerar histoner , och fann att enzymet var homologt med Gcn5p, en känd transkriptionell co-aktivator i jäst . Detta var första gången som histonacetyltransferaser kopplades till DNA -transkriptionsaktivering , vilket verifierade Vincent Allfreys hypotes på 1960 - talet att histonacetylering reglerar transkription.

Efter denna nyskapande rapport fortsatte Allis att studera histonacetylering och upptäckte fler histonacetyltransferaser, inklusive TAF1 (en del av transkriptionsfaktorn TF II D som behövs för att initiera transkription). Allis började också forska om histonfosforylering och histonmetylering . Han kopplade histonfosforylering till mitos och mitogenstimulering , och etablerade ett synergistiskt förhållande mellan histonfosforylering och acetylering. Han bestämde också rollen för metylering vid lysin 9 av histon H3 , identifierade SET-domäninnehållande proteiner som histonmetyltransferas och fann att histonubikvitylering reglerar histonmetylering.

År 2000 föreslog Allis och Brian Strahl " histonkodhypotesen ", som säger att DNA- transkription till stor del regleras av histonmodifieringar . Senare associerade Allis (tillsammans med Thomas Jenuwein ) explicit histonkoden med epigenetik och insåg den kliniska betydelsen av histonmodifieringar, särskilt i cancer .

På senare år har hans uppmärksamhet vänts mot "onkohistoner", som är histoner med mutationer som förvränger normala histonmodifieringar, vilket leder till cancer.

Heder och utmärkelser

Allis var medlem i Phi Beta Kappa när han tog examen från University of Cincinnati .

C. David Allis Mentorskapsfond för unga forskare vid Rockefeller University inrättades till hans ära.