Cathepsin E

CTSE
Protein CTSE PDB 1tzs.png
Tillgängliga strukturer
PDB Ortologisk sökning:
Identifierare
, Ctse, A430072O03Rik, C920004C08Rik, CE, CatE, cathepsin E
Externa IDs
Ortologer
Arter Mänsklig Mus
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Plats (UCSC)
PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus
Cathepsin E-
identifierare
EG nr. 3.4.23.34
CAS-nr. 110910-42-4
Databaser
IntEnz IntEnz-vy
BRENDA BRENDA inträde
ExPASy NiceZyme-vy
KEGG KEGG inträde
MetaCyc Metabolisk väg
PRIAM profil
PDB- strukturer RCSB PDB PDBe PDB summa
Sök
PMC artiklar
PubMed artiklar
NCBI proteiner

Cathepsin E är ett enzym ( EC 3.4.23.34 ) som hos människor kodas av CTSE -genen . Enzymet är också känt som långsamt rörligt proteinas , erytrocytmembran asparaginproteinas , SMP , EMAP , icke-pepsinproteinas , katepsin D-liknande syraproteinas , katepsin E-liknande syraproteinas , katepsin D-typ proteinas) är ett enzym .

Cathepsin E är ett proteas som finns i djur, såväl som i olika andra organismer, som tillhör asparaginproteasgruppen . Hos människor kodas den av CTSE- genen som ligger vid 1q32 på kromosom 1 . Det är ett intracellulärt icke-lysosomalt glykoprotein som främst finns i huden och i immunceller. Proteinet är ett aspartylproteas som fungerar som en disulfidkopplad homodimer och har en oligosackaridkedja av typen högmannos. Det är en medlem av peptidas A1-familjen och observerar därför specificitet liknande den för Pepsin A och Cathepsin D. Cathepsin E är ett intracellulärt enzym och verkar inte vara inblandat i matsmältningen av protein. Det finns i högsta överflöd på magens epitelslemproducerande cellytor. Det är det första asparaginsyraproteaset som finns i fostrets mage och finns i mer än hälften av magcancer, vilket leder till att det verkar vara ett oncofetalt antigen . Transkriptvarianter som använder alternativa polyadenyleringssignaler och två transkriptvarianter som kodar för olika isoformer existerar för denna gen.

En brist på nivåerna av Cathepsin E i kroppen kan spela en roll vid inflammatoriska hudsjukdomar som atopisk dermatit , för vilka behandling skulle förlita sig på att fixera funktionalitet och nivåer av proteinet i kroppen. Tillsammans med renin och Cathepsin D är Cathepsin E en av de få asparaginproteaser som är kända för att göras i andra mänskliga vävnader än de i gastrointestinala och fortplantningsorgan.

Strukturera

Strukturen för Cathepsin E är mycket lik de för Cathepsin D och BACE1 , och alla 3 har nästan identiska områden med aktiva ställen. Skillnaderna mellan dem ligger i mikromiljöerna som omger deras aktiva platser . Resterna DTG 96-98 och DTG 281-283 bidrar till bildningen av enzymets aktiva ställe. Det finns också två par av disulfidbindningar vid resterna Cys 272-276 och Cys 314-351. Två andra Cys-rester vid positionerna 109 och 114 på aminosyrakedjan ligger nära varandra i tredimensionellt utrymme, men avståndet mellan deras svavelatomer är 3,53 Å, vilket är för stort för bildandet av en riktig disulfidbindning. Strukturen har också fyra vätebindningar mellan Asp-resterna på det aktiva stället och de omgivande resterna. En utmärkande faktor för Cathepsin E i jämförelse med strukturen av Cathepsin D och BACE1 kan ses vid bildandet av en extra vätebindning mellan Asp 96 och Ser 99 resterna, och frånvaron av en vätebindning med Leu/Met vid Asp 281.

Plats

Enzymet distribueras i celler i mag-tarmkanalen , lymfoida vävnader, blodkroppar, urinorgan och mikroglia . Dess intracellulära lokalisering i olika däggdjursceller skiljer sig från dess analog Cathepsin D. Cathepsin E associeras med membranvävnaden i de intracellulära canaliculi av gastriska parietalceller , gallcanaliculi av leverceller, celler i rinal proximal tubuli i njuren, epitelial celler i tarmen, luftstrupen och bronkierna, osteoklaster och även i erytrocyter. Dess lokalisering i endosomstrukturerna kan ses i många olika celltyper såsom antigenpresenterande B-cellslymfoblaster, magceller och mikroglia. Dess närvaro detekteras också i cisternerna i cellens endoplasmatiska retikulum .

Fungera

Cathepsin E spelar en viktig roll i proteinnedbrytning, antigenbearbetning via MHC klass II- vägen och generering av bioaktivt protein. Enzymet tros också vara involverat i utförande av åldersinducerad neuronal dödsväg samt överdriven stimulering av glutamatreceptorer med excitotoxiner och övergående ischemi i framhjärnan . I ett experiment utfört på råttor upptäcktes Cathepsin E knappt i hjärnvävnaden hos unga råttor, men hos äldre råttor ökade dess nivå kraftigt i neostriatum och hjärnbarken . Enzymet uttrycktes också i höga nivåer i de aktiverade mikroglia i hippocampus CA1-regionen och i degenererande neuroner under en vecka efter övergående ischemi i framhjärnan. Cathepsin E har en möjlig roll i utvecklingen av väldifferentierat adenokarcinom från intestinal metaplasi . Enzymet spelar också en roll i samband med dendritiska celler där det genererar CD4-repertoaren som svar på egna och främmande proteiner.

Modifiering efter översättning

Enzymet är glykosylerat . Olika celltyper bidrar till skillnaderna i kolhydratkedjans karaktär. En oligosackarid av hög mannostyp observeras i proenzymet i fibroblaster, men det mogna enzymet kan ses med en oligosackarid av komplex typ. I erytrocyternas membran har det mogna enzymet och proenzymet båda en oligosackarid av komplex typ. Autokatalytisk klyvning producerar två former av enzymet, med Form 1 som börjar vid rest Ile 54 och Form 2 vid Thr 57.

Se även

Vidare läsning

externa länkar