Biologiskt prov
Ett biologiskt prov (även kallat ett bioprov ) är ett biologiskt laboratorieprov som innehas av ett bioförvar för forskning. Ett sådant prov skulle tas genom provtagning för att vara representativt för alla andra prover som tagits från provets källa. När biologiska prover lagras förblir de idealiskt likvärdiga med nyinsamlade prover för forskningsändamål.
Mänskliga biologiska prover lagras i en typ av bioförvar som kallas biobank , och vetenskapen om att bevara biologiska prover är mest aktiv inom biobanksområdet.
Kvalitetskontroll
Att sätta breda standarder för kvaliteten på biologiska prover var från början en underutvecklad aspekt av biobankstillväxt. Det pågår för närvarande diskussioner om vilka standarder som ska finnas och vem som ska hantera dessa standarder. Eftersom många organisationer sätter sina egna standarder och eftersom biobanker nödvändigtvis används av flera organisationer och vanligtvis drivs mot expansion, är harmoniseringen av standardförfaranden för labpraxis en hög prioritet. Procedurerna måste vara evidensbaserade och kommer att förändras med tiden när ny forskning och teknologi blir tillgänglig.
Beslutsfattare
Vissa framsteg för skapandet av politiska organisationer inkluderar National Cancer Institutes 2005 skapande av Office of Biobanking and Biospecimen Research (OBBR) och det årliga Biospecimen Research Network Symposia. International Society for Biological and Environmental Repositories , International Agency for Research on Cancer, Organisation for Economic Co-operation and Development och Australasian Biospecimen Network har också föreslagit policyer och standarder. 2008 AFNOR , en fransk standardiseringsorganisation, den första biobanksspecifika kvalitetsstandarden. Aspekter av ISO 9000 har tillämpats på biobanker.
Kvalitetsmål
Kvalitetskriterier för prover beror på studien som övervägs och det finns ingen universell standardtyp av prover. DNA-integritet är en viktig faktor för studier som involverar amplifiering av hela genomet. RNA-integritet är avgörande för vissa studier och kan bedömas med gelelektrofores . Inte heller biobanker, som lagrar prover, kan inte ta fullt ansvar för provets integritet, eftersom någon måste samla in och bearbeta prover innan de tar tag i prover och effekter som RNA-nedbrytning är mer sannolikt att uppstå från försenad provbehandling än otillräcklig lagring.
Prover lagras
Biorepositories lagrar olika typer av prover. [ citat behövs ] Olika exemplar är användbara för olika ändamål. [ citat behövs ]
| Biobanksexemplar | ||||
|---|---|---|---|---|
| prov | använder | extraktionsteknik | lagring | egenskaper |
| kindvävnad _ | DNA-profilering | buckal svabb | deltagarna kan hämta själva; kan hämtas via post; så lätt att samla in att informerat samtycke kanske inte behandlas tillräckligt | |
| helblod | venpunktion | kräver phlebotomist att samla in | ||
| Torkad blodfläck | ger högkvalitativt DNA och RNA | Fingerstick | lagras lätt i åratal i rumstemperatur | |
| organvävnad _ | ger högkvalitativt DNA , RNA , mitokondrie-DNA och sjukdomskälla | Biopsi | många användningsområden delas med blod; även lämplig för proteomisk analys; kan vara svårt att få tag på | |
| Plasma | begränsat DNA- och RNA-innehåll | Blodplasmafraktionering | kräver phlebotomist att samla in | |
| Urin | markör för vissa diagnostiska tester | Urinering | icke-invasiv | |
| Avföring | markör för vissa diagnostiska tester | Avföringsprov | icke-invasiv | |
| Hud | Används mestadels av kriminaltekniska team som utreder brottmål | i brottmål, samlas in utan givarens samtycke | ||
| Hår | Används mestadels av kriminaltekniska team som utreder brottmål | Håranalys | i brottmål, samlas in utan givarens samtycke | |
Förvaringstekniker
Många exemplar i biobanker är kryokonserverade . [ citat behövs ] Andra exemplar förvaras på andra sätt.
Tekniker kopplade till biobanker
Några av laboratorieteknikerna förknippade med biologisk provförvaring inkluderar fenol-kloroformextraktion , PCR och RFLP . [ citat behövs ]
externa länkar
- Biospecimen research databas , en kurerad samling artiklar om biospecimens
- Office of Biorepositories och Biospecimen Research
- Specimen Central biorepository list , En världsomspännande lista över aktiva biobanker och biorepositories
- Biospecimen Research Network Symposia , en konferens om biobanksexemplar
- Mayo Clinic om biobanking
- Kort offentligt tv-avsnitt om museets samlingar
- Bioprovtagningstjänster