BY1

BY1-
	diagram över strukturen av två polyener bildade av BY1
vetenskaplig klassificering
Rike:	Svampar
Division:	Basidiomycota
Klass:	Agaricomycetes
Beställa:	Russulales
Familj:	Stereaceae
Släkte:	Incertae sedis
Arter:	BY1
Binomialnamn
	BY1 ;
Synonymer
	Svamp BY1

BY1 är en taxonomiskt oidentifierad basidiomycetsvamp . ITS-sekvensering har placerat den i Russulales och kallas en stereaceous basidiomycete. Kemotaxonomiskt stöder dess placering i denna grupp och producerar fomannoxiner och vibralaktoner . Svampens mycel isolerades från död asp i Minnesota , USA. Det antas bryta ner trä genom vitröta .

Myceliet kan odlas på YMG-agar vid rumstemperatur (4 g/L d-glukos, 4 g/L jästextrakt, 10 g/L maltextrakt, 18 g/L agar). Kulturen kan erhållas på Jena Microbial Resource Collection registreringsnummer SF:011241.

När mycelet skadas av skalpellskador uppstår ett gult pigment. Dessa pigment identifierades som polyener genom karakteristiska UV-Vis-spektra. Polyenernas strukturer bestämdes med NMR . De identifierades som 1) (3Z,5E,7E,9E,11E,13Z,15E,17E)-18-metyl-19-oxoicosa-3,5,7,9,11,13,15,17-oktaensyra ; och 2) (3E,5Z,7E,9E,11E,13E,15Z,17E,19E)-20-metyl-21-oxodocosa-3,5,7,9,11,13,15,17,19-nonaenoic syra. Den kortare polyenen visade sig vara mycket giftig mot Drosophila melanogaster -larver. Matningsexperiment med [1-13C]acetat avslöjade ett polyketidiskt ursprung, och matningsexperiment med l-[metyl-13C]metionin avslöjade metylförgrening troligen via S-adenosyl-l-metioninberoende metyltransferas(er). Dessutom MALDI-TOF- avbildning vid mycelets sårställe dessa polylener som lokaliserade i det skadade området. Två förmodade alleler av polyketidgener identifierades, hänvisade till som PPS1 och PPS2 . QRT-PCR- övervakning av PPS1 visade uppreglering av denna gen efter mycelialskada. Domänarkitekturen var följande för PPS1: KS, AT, DH, MT, KR, ACP, och klassificerades således som ett högreducerande polyketidsyntas (HR-PKS). Detta var den första karakteriserade HR-PKS av basidiomycetiskt ursprung och bildar sin egen kladd i jämförelse med ascomycete HR-PKS, bakteriella polyenbildande PKSs, basidiomycete icke-reducerande PKSs och ascomycete icke-reducerande PKSs. Denna forskning har uppmärksammats i media flera gånger.

Svampen producerar även fomannoxiner och vibralaktoner . Famonnixinerna visade sig vara fytotoxiska och vibralaktonerna visade sig vara svampdödande .

Dessutom identifierades en ny prenylfenol, benämnd cloquetin, från svampen genom NMR. Överuttryck av två annoterade icke-reducerande polyketidsyntaser ( PKS1 och PKS2 ) i Aspergillus niger och efterföljande karakterisering av proteinerna identifierade dem som orsellinsyrasyntaser. En prenyltransferasgen , benämnd BYPB , överuttrycktes i E. coli och det efterföljande proteinet bekräftades lägga till en prenylgrupp till orsellinsyra .