Acyl-CoA-bindande protein
| ACBP | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Acyl-CoA-bindande proteinmonomer, Human
| |||||||||
| Identifiers | |||||||||
| Symbol | ACBP | ||||||||
| Pfam | PF00887 | ||||||||
| InterPro | IPR000582 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00686 | ||||||||
| SCOP2 | 1aca / SCOPe / SUPFAM | ||||||||
| OPM superfamilj | 295 | ||||||||
| OPM-protein | 2wh5 | ||||||||
| CDD | cd00435 | ||||||||
| Membran | 497 | ||||||||
| |||||||||
Inom molekylärbiologi är det Acyl-CoA-bindande proteinet (ACBP) ett litet (10 Kd) protein som binder medel- och långkedjiga acyl-CoA- estrar med mycket hög affinitet och kan fungera som en intracellulär bärare av acyl-CoA- estrar . ACBP är också känd som diazepambindande hämmare (DBI) eller endozepin (EP) på grund av dess förmåga att ersätta diazepam från igenkänningsstället för bensodiazepin (BZD) som finns på GABA typ A- receptorn . Det är därför möjligt att detta protein också fungerar som en neuropeptid för att modulera verkan av GABA- receptorn .
ACBP är ett mycket konserverat protein med cirka 90 aminosyror som finns i alla fyra eukaryota riken, Animalia, Plantae, Fungi och Protista, och i vissa eubakteriella arter .
Även om ACBP förekommer som ett helt oberoende protein, har intakta ACB- domäner identifierats i ett antal stora, multifunktionella proteiner i en mängd olika eukaryota arter. Dessa inkluderar stora membranassocierade proteiner med N-terminala ACB-domäner, multifunktionella enzymer med både ACB och peroxisomal enoyl-CoA Delta(3), Delta(2)-enoyl-CoA- isomerasdomäner och proteiner med både en ACB-domän och ankyrinupprepningar .
ACB-domänen består av fyra alfa-helixar arrangerade i en skålform med ett mycket exponerat acyl-CoA-bindningsställe. Liganden är bunden genom specifika interaktioner med rester på proteinet, framför allt flera konserverade positiva laddningar som interagerar med fosfatgruppen på adenosin-3'-fosfatdelen , och acylkedjan är inklämd mellan de hydrofoba ytorna av CoA och proteinet.
Andra proteiner som innehåller en ACB-domän inkluderar:
- Endozepinliknande peptid (ELP) (gen DBIL5) från mus . ELP är en testikelspecifik ACBP- homolog som kan vara involverad i energimetabolismen hos den mogna spermien .
- MA-DBI, ett transmembranprotein med okänd funktion som har hittats i däggdjur . MA-DBI innehåller en N-terminal ACB-domän.
- DRS-1, ett humant protein med okänd funktion som innehåller en N-terminal ACB-domän och en C-terminal enoyl-CoA-isomeras/hydratas-domän.