ANKS1A

ANKS1A
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, ANKS1, ankyrinupprepning och steril alfamotivdomän som innehåller 1A
externa ID:n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Ankyrin repeat och SAM-domän-innehållande protein 1A (ANKS1A), även känt som ODIN, är ett protein som hos människor kodas av ANKS1A -genen på kromosom 6 .

Det uttrycks överallt i många vävnader och celltyper. ODIN är känt för att reglera signalvägarna för epidermal tillväxtfaktorreceptor (EGFR) och EphA-receptorn . Som ett Src-familjekinasmål har ODIN varit inblandad i utvecklingen av cancer . ANKS1A - genen innehåller också en av 27 SNP: er associerade med ökad risk för kranskärlssjukdom .

Strukturera

Gen

ANKS1A - genen finns på kromosom 6 vid bandet 6p21.31 och inkluderar 29 exoner . Denna gen producerar 2 isoformer genom alternativ splitsning .

Protein

ODIN är en medlem av familjen ankyrinupprepning och steril alfamotiv domäninnehållande (ANKS) familj och innehåller 6 ankyrinupprepningar , 1 fosfotyrosinbindande (PTD) domän och 2 tandem sterila alfamotiv (SAM) domäner. Den första SAM-domänen binder till SAM-domänen av EphA2- receptorn genom att anta en mid-loop/end-helix-konformation och kan reglera EphA2- endocytos .

Fungera

ODIN uttrycks brett i vävnader inklusive hjärta , hjärna , placenta , lunga , lever , skelettmuskulatur , njure och bukspottkörtel . ODIN har identifierats som ett av de tyrosinfosforylerade proteinerna som induceras av aktivering av epidermal tillväxtfaktor eller trombocyt-härledda tillväxtfaktorreceptortyrosinkinaser . ODIN är involverad i negativ reglering av EGFR- signalvägen. Det rapporteras att ODIN-nivån är korrelerad med graden av ökad EGF-inducerad EGFR-handel för att återvinna endosomer och återvinna tillbaka till cellytan , vilket tyder på en roll i EGFR-återvinning. Dessutom fungerar ODIN som ett nyckeladapterprotein som reglerar EphA-receptorns signalväg, vilket är avgörande för att reglera EphA8 -medierad cellmigration och neuritutväxt . Det har visats att deletion av den fosfotyrosinbindande domänen i ODIN kommer att leda till ett omoget utvecklat subkommissuralt organ (SCO) med en allvarlig hydrocefalisk fenotyp i mitthjärnan, vilket betyder att ODIN också spelar en roll i den korrekta utvecklingen av SCO och i ependymala celler i den cerebrala akvedukten .

Klinisk signifikans

Som ett nytt mål för kinaser från Src-familjen , som är inblandade i utvecklingen av vissa kolorektala cancerformer, kan ODIN vara involverad i cancercellssignaleringsmekanismer. I en studie testades 64 kolorektala cancercellinjer för deras uttryck av Lck. Massspektrometriska analyser av Lck-renade proteiner identifierade därefter flera proteiner som lätt är kända som SFK-kinassubstrat, inklusive kortaktin, Tom1L1 (SRCASM), GIT1, vimentin och AFAP1L2 (XB130). Ytterligare proteiner som tidigare rapporterats som substrat för andra tyrosinkinaser detekterades också, inklusive ODIN. ODIN analyserades ytterligare och visade sig innehålla väsentligt mindre pY vid hämning av SFK-aktivitet i SW620-celler, vilket indikerar att det är ett tidigare okänt SFK-mål i kolorektala karcinomceller. Vidare har det visat sig att ODIN reglerar COPII-medierad anterograd transport av receptortyrosinkinaser, vilket är en kritisk mekanism i processen för tumörgenes.

Klinisk markör

En multi-locus genetisk riskpoängstudie baserad på en kombination av 27 loci , inklusive ANKS1A-genen, identifierade individer med ökad risk för både incidenter och återkommande kranskärlssjukdomar , samt en förbättrad klinisk nytta av statinbehandling . Studien baserades på en samhällskohortstudie ( Malmo Diet and Cancer-studien) och ytterligare fyra randomiserade kontrollerade studier av primära preventionskohorter (JUPITER och ASCOT) och sekundära preventionskohorter (CARE och PROVE IT-TIMI 22).

externa länkar

• Mänskligt ANKS1A- genomplacering och ANKS1A- geninformationssida i UCSC Genome Browser .
• Översikt över all strukturell information tillgänglig i PDB för UniProt : Q92625 (Human Ankyrin repeat och SAM-domäninnehållande protein 1A) vid PDBe-KB .
• Översikt över all strukturell information tillgänglig i PDB för UniProt : P59672 (Mus Ankyrin repeat och SAM-domäninnehållande protein 1A) vid PDBe-KB .

Vidare läsning

•   Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (september 1996). "Normalisering och subtraktion: två metoder för att underlätta genupptäckt" . Genomforskning . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
•   Pandey A, Blagoev B, Kratchmarova I, Fernandez M, Nielsen M, Kristiansen TZ, Ohara O, Podtelejnikov AV, Roche S, Lodish HF, Mann M (november 2002). "Klonning av en ny fosfotyrosinbindande domän innehållande molekyl, Odin, involverad i signalering av receptortyrosinkinaser" . Onkogen . 21 (52): 8029–36. doi : 10.1038/sj.onc.1205988 . PMID 12439753 .
•    Beausoleil SA, Jedrychowski M, Schwartz D, Elias JE, Villén J, Li J, Cohn MA, Cantley LC, Gygi SP (augusti 2004). "Storskalig karakterisering av HeLa cell nukleära fosfoproteiner" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 101 (33): 12130–5. Bibcode : 2004PNAS..10112130B . doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935 .
•    Jin J, Smith FD, Stark C, Wells CD, Fawcett JP, Kulkarni S, Metalnikov P, O'Donnell P, Taylor P, Taylor L, Zougman A, Woodgett JR, Langeberg LK, Scott JD, Pawson T (augusti 2004) . "Proteomisk, funktionell och domänbaserad analys av in vivo 14-3-3-bindande proteiner involverade i cytoskelettreglering och cellulär organisation" . Aktuell biologi . 14 (16): 1436–50. doi : 10.1016/j.cub.2004.07.051 . PMID 15324660 . S2CID 2371325 .
•   Ballif BA, Villén J, Beausoleil SA, Schwartz D, Gygi SP (november 2004). "Fosfoproteomisk analys av den utvecklande mushjärnan" . Molekylär och cellulär proteomik . 3 (11): 1093–101. doi : 10.1074/mcp.M400085-MCP200 . PMID 15345747 .
•   Kristiansen TZ, Nielsen MM, Blagoev B, Pandey A, Mann M (augusti 2004). "Embryonala fibroblaster från mus härrörande från möss med Odin-brist visar en hyperproliiferativ fenotyp". DNA-forskning . 11 (4): 285–92. PMID 15500253 .
•   Benzinger A, Muster N, Koch HB, Yates JR, Hermeking H (juni 2005). "Riktad proteomisk analys av 14-3-3 sigma, en p53-effektor som vanligtvis tystas i cancer" . Molekylär och cellulär proteomik . 4 (6): 785–95. doi : 10.1074/mcp.M500021-MCP200 . PMID 15778465 .