7SK RNA

Reversibel association av P-TEFb med 7SK snRNP. P-TEFb frisätts från 7SK snRNP av Brd4 eller HIV Tat. HEXIM kastas ut och de två proteinerna ersätts av hrRNPs. Det omvända av denna process kräver andra okända faktorer.

7SK RNA
Förutspådd sekundär struktur och sekvenskonservering av 7SK-
identifierare
Symbol	7SK
Rfam	RF00100
Övriga uppgifter
RNA -typ	Gen
Domän(er)	Eukaryota
SÅ	SO:0000274
PDB- strukturer	PDBe

RN7SK
-identifierare
Symbol	RN7SK
NCBI-genen	125050
Övriga uppgifter
Ställe	Chr. 6 p12.2

Inom molekylärbiologi är 7SK ett rikligt litet nukleärt RNA som finns i metazoer . Det spelar en roll för att reglera transkription genom att kontrollera den positiva transkriptionsförlängningsfaktorn P-TEFb . 7SK finns i ett litet nukleärt ribonukleoproteinkomplex (snRNP) med ett antal andra proteiner som reglerar komplexets stabilitet och funktion.

Strukturera

En tidig studie visade att 7SK i celler är associerat med ett antal proteiner och undersökning av den sekundära strukturen föreslog en modell för basparning mellan olika regioner av RNA:t. Ett genombrott i funktionen av 7SK snRNP kom med upptäckten att den positiva transkriptionsförlängningsfaktorn P-TEFb var en komponent i komplexet. 7SK associerar med och hämmar den cyklinberoende kinasaktiviteten hos P-TEFb genom verkan av de RNA-bindande proteinerna HEXIM1 eller HEXIM2 . Gammafosfatet vid 5'-änden av 7SK metyleras av metylfosfatkapslingsenzymet MEPCE som är en konstitutiv komponent i 7SK snRNP. Ett La-relaterat protein LARP7 finns också associerat med 7SK, förmodligen delvis genom dess interaktion med 3'-änden av RNA:t. Minskning av antingen MEPCE eller LARP7 genom siRNA-medierad knockdown leder till destabilisering av 7SK in vivo. En delmängd av 7SK snRNPs saknar P-TEFb och HEXIM, men innehåller istället hnRNPs.

Fungera

Huvudfunktionen hos 7SK snRNP är kontroll av P-TEFb, en faktor som reglerar förlängningsfasen av transkription. Kinasaktiviteten av P-TEFb hämmas när faktorn finns i 7SK snRNP. P-TEFb kan frisättas från 7SK snRNP av antingen HIV-transaktivatorn Tat eller den bromodomän som innehåller proteinet BRD4 . Denna frisättning leder till en konformationsförändring i 7SK RNA och utstötning av HEXIM. hnRNPs stabiliserar komplexet som saknar P-TEFb och HEXIM. Efter att P-TEFb fungerar på specifika gener återsekvestreras den i 7SK snRNP av en okänd mekanism. 7SK snRNP har karakteriserats i både människa och Drosophila. Detaljerad recension.

externa länkar

• Mänskligt 7SK- genomplacering och 7SK- geninformationssida i UCSC Genome Browser .
• Mänskligt RN7SK- genomplacering och RN7SK- geninformationssida i UCSC Genome Browser .