Överför gen
Transfergener eller tra-gener (även transfer-operoner eller tra-operoner ), är några gener som är nödvändiga för icke-sexuell överföring av genetiskt material i både grampositiva och gramnegativa bakterier . Tra-lokuset inkluderar pilingenen och regulatoriska gener, som tillsammans bildar pili på cellytan, polymera proteiner som kan fästa sig på ytan av F-bakterier och initiera konjugeringen. Förekomsten av tra-regionen i ett plasmidgenom upptäcktes först 1979 av David H. Figurski och Donald R. Helinski. Under sitt arbete upptäckte Figurski och Helinski också ett andra nyckelfaktum om tra-regionen – att den kan agera i trans till mobiliseringsmarkören som den påverkar.
Detta fynd antydde att det fanns två grundläggande aspekter som var nödvändiga för en plasmid att flytta från en cell till en annan:
- Ett ursprung för överföring – En plasmid utan ursprung för överföring är icke-mobiliserbar.
- Överföringsgenerna – Även om en fungerande uppsättning tragener är nödvändig för plasmidöverföring, kan de finnas på en mängd olika platser inklusive plasmiden i fråga, en annan plasmid i samma värdcell eller till och med i bakteriegenomet.
Tra-generna kodar för proteiner som är användbara för förökning av plasmiden från värdcellen till en kompatibel donatorcell eller underhåll av plasmiden. Alla överföringsoperationer är inte desamma. Vissa gener finns bara i ett fåtal arter eller ett enda släkte av bakterier medan andra (som traL ) finns i mycket liknande former i många bakteriearter. Många av överföringssystemen är inkompatibla. Till exempel oriT och bom två ursprung för överföring som interagerar med olika uppsättningar av överföringsgener. En plasmid med ett mob-ställe (som många som finns i Rhodococcus- arter) kan inte överföras via överföringsgener som normalt interagerar med oriT-stället (vilket är vanligt i E. coli )
| Rollerna för vissa tra-genkodade proteiner: | |
| Pili montering och produktion |
traA, traB, traE, traC, traF, traG, traH, traK, traL, traQ, traU, traV, traW, |
| Proteiner från inre membran |
traB, traE, traG, traL, traP |
| Periplasmatiska proteiner |
traC, traF, traH traK, traU, traW |
| DNA-överföring |
spår, traD, spår, spår, traY |
| Ytuteslutningsproteiner | traS, traT |
| Parningsparstabilisering | traN, traG |
Var och en av de individuella generna i tra- operonet kodar för en annan proteinprodukt. Dessa produkter kan utföra ett antal uppgifter inklusive interaktion med varandra för att utföra parningsfunktioner och reglering av olika regioner av själva tra operonet, eller konjugativ DNA-metabolism och ytuteslutning. Observera också att vissa proteiner utför flera funktioner eller är nära förknippade med proteiner som har icke-liknande funktioner.