Zona pellucida-liknande domän
| Zona pellucida-liknande | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| domänidentifierare | |||||||||
| Symbol | Zona_pellucida | ||||||||
| Pfam | PF00100 | ||||||||
| InterPro | IPR001507 | ||||||||
| SMART | SM00241 | ||||||||
| PROSITE | PDOC00577 | ||||||||
| Membran | 146 | ||||||||
| |||||||||
Den Zona pellucida-liknande domänen ( ZP-domän / ZP-liknande domän / ZP-modul ) är en stor proteinregion med cirka 260 aminosyror. Det har känts igen i en mängd olika receptorliknande eukaryota glykoproteiner . Alla dessa molekyler är mosaikproteiner med en stor extracellulär region sammansatt av olika domäner, ofta följt av antingen en transmembranregion och en mycket kort cytoplasmatisk region eller av ett GPI -ankare.
Funktionella och kristallografiska studier avslöjade att "ZP-domänen"-regionen som är gemensam för alla dessa proteiner är en proteinpolymerisationsmodul som består av två distinkta men strukturellt relaterade immunglobulinliknande domäner, ZP-N och ZP-C. ZP-modulen är placerad i den C-terminala delen av den extracellulära regionen och – med undantag för icke-polymer familjemedlem ENG – innehåller 8 eller 10 konserverade Cys-rester involverade i disulfidbindningar.
Den första 3D-strukturen av ett ZP-modulproteinfilament, nativt humant uromodulin ( UMOD ), bestämdes med cryo-EM .
Ytterligare kopior av isolerade ZP-N-domäner finns i den N-terminala regionen av ägghöljesproteinsubenheter som är involverade i befruktning hos både ryggradsdjur och ryggradslösa djur, såsom mänskliga zona pellucida komponenter ZP1 , ZP2 och ZP4 och mollusk vitelline höljereceptor för ägglysin ( VERL).
Exempel
Människans gener som kodar för proteiner som innehåller denna domän inkluderar: