Vibrio regulatoriskt RNA av OmpA
| Vibrioregulatoriskt RNA av OmpA | |
|---|---|
 En representation av VrrA- sekundärstrukturen inklusive ett färgschema som indikerar graden av sekvenskonservering.
| |
| Identifierare | |
| Symbol | VrrA |
| Rfam | RF00024 |
| Övriga uppgifter | |
| RNA -typ | Gen- antisens-RNA |
| Domän(er) | Bakterie |
| PDB- strukturer | PDBe |
VrrA ( Vibrio regulatory RNA of OmpA ) är ett icke-kodande RNA som är konserverat över alla Vibrio -bakterier och fungerar som en repressor för syntesen av det yttre membranproteinet OmpA . Detta icke-kodande RNA identifierades initialt från Tn5- transposonmutantbibliotek av Vibrio cholerae och dess placering inom bakteriegenomet kartlades till den intergena regionen mellan generna VC1741 och VC1743 genom RACE -analys.
Yttre membranvesiklar utsöndras från ytan av gramnegativa bakterier , där de tros hjälpa till vid virulens . Lite är känt om hur dessa vesiklar hjälper till med virulens, men det har spekulerats i att de kan bidra genom att utsöndra toxiner och hjälpa till att undvika immunsystemet .
Nyligen genomförda studier visade att VrrA-uttryck aktiveras av den alternativa stress sigma-faktorn , sigma E; till skillnad från andra bakteriestammar som E. coli och Salmonella , kräver det inte Hfq -proteinet för att reglera sigmafaktorn. Det visades också att VrrA -transkription ökar vid exponering för UV-ljus och att överuttryck av VrrA resulterade i en ökning av utsöndrade yttre membranvesiklar. Från dessa studier har det föreslagits att VrrA verkar för att lindra yttre membranstress genom att begränsa syntesen av OmpA-protein och att yttre membranvesiklar ger bakterierna fysiskt skydd mot UV-ljus.