Telomerisk upprepad bindningsfaktor 1

TERF1
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, PIN2, TRBF1, TRF, TRF1, hTRF1-AS, t-TRF1, telomerisk upprepningsbindningsfaktor 1
Externa ID:n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS n/a
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

Ej att förväxla med Transferrin , en gen i mus musculus med alias Trf.

Telomerisk upprepad bindande faktor 1 är ett protein som hos människor kodas av TERF1 -genen .

Gen

Den humana TERF1-genen är lokaliserad i kromosom 8 vid 73,921,097-73,960,357 bp. Två transkript av denna gen är alternativt splitsade produkter. TERF1-genen är också känd som TRF, PIN2 (Proteinashämmare 2), TRF1, t-TRF1 och h-TRF1-AS.

Protein

Se även: TERF2 § TERF Homologidomän

Proteinstrukturen innehåller ett C-terminalt Myb-motiv, en dimeriseringsdomän (TERF-homologi) nära dess N-terminal och en sur N-terminal.

Subcellulär distribution

Den cellulära fördelningen av detta DNA-bindande protein har nukleoplasman , kromosomerna , en telomer region, ett nukleärt telomerkapselkomplex , cytoplasman, spindeln , kärnan och en nukleolus och en nukleär kromosom.

Fungera

TERF 1-genen kodar för ett telomerspecifikt protein som är en komponent i telomerens shelterin -nukleoproteinkomplex. Detta protein är närvarande vid telomerer under hela cellcykeln och fungerar som en hämmare av telomeras , som verkar in cis för att begränsa förlängningen av individuella kromosomändar. Det är känt att skydda telomerer hos däggdjur från DNA-mekanismer som används i reparationssyfte och samtidigt reglerar aktiviteten som utförs av telomeras. Det telomeriska repeterande bindande faktor 1-proteinet är närvarande vid telomerer, där cellens åldringsaspekt övervakas, under den typiska cellcykelprocessen. Den progressiva förlusten av de telomera ändarna av kromosomerna är en viktig mekanism i tidpunkten för mänsklig cellulär åldrande. Telomerisk upprepningsfaktor 1 (TRF1) är ett protein som binder vid telomerändarna.

Proteinet har den ultimata användningen av att fungera som en hämmare av telomeras, ett proteinenzym som hjälper till att förlänga kromosomerna genom att lägga till sekvenser av TTAGGG till änden av kromosomerna. Proteinet fungerar som cis-regulatoriska element i processen att begränsa ändarna av individuella kromosomer från att förlängas, vilket underlättas av telomeras och TTAGGG-sekvenserna. Strukturen av proteinet består av en dimeriseringsdomän nära dess aminoterminal, en karboxylterminalsvans , som är den fria karboxylgruppen som avslutar änden av en proteinkedja och en sur aminoterminal, som är den fria amingruppen som avslutar början av ett protein.

Biologiska processer

Proteinet är också aktivt involverat i biologiska processer såsom svaret på läkemedel och den negativa regleringen av upprätthållandet av telomerer genom processen av semi-konservativ replikation, liknande den för cis. Dessutom, enligt Kaplan och Christopher, är proteinet också involverat i de biologiska processerna för positiv reglering av polymerisationen av mikrotubuli och negativ kontroll av processen för DNA-replikation. Detta protein är också användbart i den biologiska processen för mitos och den positiva regleringen av mitos. Det reglerar positivt den mitotiska cellcykeln. Proteinet som kodas av TERF 1-genen är också involverat i den biologiska processen för celldelning och den negativa regleringen av underhållet av telomerer som underlättas av enzymet telomeras.

Förutom att fungera som en hämmare av enzymet telomeras i processen för förlängning av ändarna på kromosomerna, har proteinet andra funktioner. Dessa funktioner inkluderar bindningen av proteinet, underlättande av aktiviteten av proteinhomodimerisering, bindningen av DNA och underlättande av aktiviteten av proteinheterodimerisering såväl som bindningen av mikrotubuli. Dessutom har proteinet en molekylär funktion av att binda telomert DNA och det dubbelsträngade telomera DNA. Det telomeriska repeterande bindande faktor 1-proteinet används också vid bindningen av kromatin och hela aktiviteten av böjning av DNA:t.

Klinisk signifikans

TERF1-proteinnivåer korrelerar med telomerlängd vid kolorektal cancer. Telomerer skyddar kromosomen från nedbrytning av nukleaser och ände till ände fusion. Den progressiva förlusten av de telomera ändarna av kromosomerna är en viktig mekanism i tidpunkten för mänsklig cellulär åldrande. Telomerisk upprepningsfaktor 1 (TRF1) är ett protein som binder vid telomerändarna. För att mäta koncentrationerna av TRF1 och sambanden mellan telomerlängd, telomerasaktivitet och TRF1-nivåer i tumör och normal kolorektal slemhinna, från normala och tumörprover från patienter som opererades för kolorektal cancer analyserade vi TRF1-proteinkoncentrationen och telomerasaktiviteten analyserades . Som ett resultat observerades höga nivåer av TRF1 i 68,7% av tumörproverna, medan majoriteten av normala prover visade negativa eller svaga TRF1-koncentrationer. Bland tumörproverna var telomerlängden signifikant associerad med TRF1-proteinnivåer. Sammanfattningsvis finns det ett samband mellan telomerlängd och TRF1 överflöd av protein i tumörprover, vilket betyder att TRF1 är en viktig faktor i tumörprogressionen och kanske en diagnostisk faktor.

Interaktioner

Det TERF1-kodade proteinet har visats ha interaktioner med följande; SALL1 (Sal-like1- Drosophila, ett protein.), ABL (Abelson murine leukemi viral onkogen homolog, ett protein), MAPRE2 (Microtubule-associated protein RP/EB, a protein), ATM (Ataxia telangiectasia mutated, a protein kinas) , PINX1 (TERF1-interagerande telomerasinhibitor 1), TINF2 (TERF1-interagerande telomeras nukleär faktor), TNKS2 (Tankyras, ett enzym) och NME1 (nukleosid-difosfatkinas). Sammanfattningsvis, som nämnts ovan, den telomera upprepade bindningsfaktorn 1 protein har de flesta av sina funktioner relaterade till bindning av komponenter och reglering av processer.

TERF1 har visat sig interagera med:

• Abl gen ,
• Ataxia telangiectasia muterad ,
• MAPRE1 ,
• NME1 ,
• PINX1
• SALL1 ,
• TINF2 ,
• TNKS2 , och
• TNKS .

Vidare läsning

•    Zhong Z, Shiue L, Kaplan S, de Lange T (1992). "En däggdjursfaktor som binder telomer TTAGGG upprepas in vitro" . Mol. Cell. Biol . 12 (11): 4834–43. doi : 10.1128/mcb.12.11.4834 . PMC 360416 . PMID 1406665 .
•    Chong L, van Steensel B, Broccoli D, Erdjument-Bromage H, Hanish J, Tempst P, de Lange T (1995). "Ett mänskligt telomert protein". Vetenskap . 270 (5242): 1663–7. Bibcode : 1995Sci...270.1663C . doi : 10.1126/science.270.5242.1663 . PMID 7502076 . S2CID 25439525 .
•    Lu KP, Hanes SD, Hunter T (1996). "Ett humant peptidyl-prolylisomeras som är väsentligt för reglering av mitos". Naturen . 380 (6574): 544–7. Bibcode : 1996 Natur.380..544P . doi : 10.1038/380544a0 . PMID 8606777 . S2CID 4258406 .
•    Bilaud T, Koering CE, Binet-Brasselet E, Ancelin K, Pollice A, Gasser SM, Gilson E (1996). "Teloboxen, ett Myb-relaterat telomert DNA-bindande motiv som finns i proteiner från jäst, växter och människor" . Nucleic Acids Res . 24 (7): 1294–303. doi : 10.1093/nar/24.7.1294 . PMC 145771 . PMID 8614633 .
•   Broccoli D, Chong L, Oelmann S, Fernald AA, Marziliano N, van Steensel B, Kipling D, Le Beau MM, de Lange T (1997). "Jämförelse av de mänskliga och musgener som kodar för det telomera proteinet, TRF1: kromosomal lokalisering, uttryck och konserverade proteindomäner" . Brum. Mol. Genet . 6 (1): 69–76. doi : 10.1093/hmg/6.1.69 . PMID 9002672 .
•    Bianchi A, Smith S, Chong L, Elias P, de Lange T (1997). "TRF1 är en dimer och böjer telomert DNA" . EMBO J . 16 (7): 1785–94. doi : 10.1093/emboj/16.7.1785 . PMC 1169781 . PMID 9130722 .
•    Broccoli D, Smogorzewska A, Chong L, de Lange T (1997). "Humana telomerer innehåller två distinkta Myb-relaterade proteiner, TRF1 och TRF2". Nat. Genet . 17 (2): 231–5. doi : 10.1038/ng1097-231 . PMID 9326950 . S2CID 41204064 .
•   Nosaka K, Kawahara M, Masuda M, Satomi Y, Nishino H (1998). "Association av nukleosid-difosfatkinas nm23-H2 med humana telomerer". Biochem. Biophys. Res. Commun . 243 (2): 342–8. doi : 10.1006/bbrc.1997.8097 . PMID 9480811 .
•   Nishikawa T, Nagadoi A, Yoshimura S, Aimoto S, Nishimura Y (1998). "Lösningsstruktur för den DNA-bindande domänen av humant telomert protein, hTRF1" . Struktur . 6 (8): 1057–65. doi : 10.1016/S0969-2126(98)00106-3 . PMID 9739097 .
•    Smith S, Giriat I, Schmitt A, de Lange T (1998). "Tankyras, ett poly(ADP-ribos) polymeras vid humana telomerer". Vetenskap . 282 (5393): 1484–7. CiteSeerX 10.1.1.466.9024 . doi : 10.1126/science.282.5393.1484 . PMID 9822378 .
•    Kim SH, Kaminker P, Campisi J (1999). "TIN2, en ny regulator av telomerlängd i mänskliga celler" . Nat. Genet . 23 (4): 405–12. doi : 10.1038/70508 . PMC 4940194 . PMID 10581025 .
•    Smogorzewska A, van Steensel B, Bianchi A, Oelmann S, Schaefer MR, Schnapp G, de Lange T (2000). "Kontroll av mänsklig telomerlängd med TRF1 och TRF2" . Mol. Cell. Biol . 20 (5): 1659–68. doi : 10.1128/MCB.20.5.1659-1668.2000 . PMC 85349 . PMID 10669743 .
•   Wu G, Lee WH, Chen PL (2000). "NBS1 och TRF1 kolokaliserar sig vid promyelocytiska leukemikroppar under sena S/G2-faser i odödliga telomerasnegativa celler. Implikation av NBS1 i alternativ förlängning av telomerer" . J. Biol. Chem . 275 (39): 30618–22. doi : 10.1074/jbc.C000390200 . PMID 10913111 .
•   Chi NW, Lodish HF (2000). "Tankyrase är ett golgi-associerat mitogenaktiverat proteinkinassubstrat som interagerar med IRAP i GLUT4-vesiklar" . J. Biol. Chem . 275 (49): 38437–44. doi : 10.1074/jbc.M007635200 . PMID 10988299 .
•   Kishi S, Wulf G, Nakamura M, Lu KP (2001). "Telomert protein Pin2/TRF1 inducerar mitotiskt inträde och apoptos i celler med korta telomerer och är nedreglerat i humana brösttumörer" . Onkogen . 20 (12): 1497–508. doi : 10.1038/sj.onc.1204229 . PMID 11313893 .
•   Kishi S, Zhou XZ, Ziv Y, Khoo C, Hill DE, Shiloh Y, Lu KP (2001). "Telomert protein Pin2/TRF1 som ett viktigt ATM-mål som svar på dubbelsträngad DNA-brott" . J. Biol. Chem . 276 (31): 29282–91. doi : 10.1074/jbc.M011534200 . PMID 11375976 .
•   Fairall L, Chapman L, Moss H, de Lange T, Rhodes D (2001). "Struktur av TRFH-dimeriseringsdomänen för de humana telomera proteinerna TRF1 och TRF2" . Mol. Cell . 8 (2): 351–61. doi : 10.1016/S1097-2765(01)00321-5 . PMID 11545737 .
•    Zhou XZ, Lu KP (2001). "Det Pin2/TRF1-interagerande proteinet PinX1 är en potent telomerasinhibitor" . Cell . 107 (3): 347–59. doi : 10.1016/S0092-8674(01)00538-4 . PMID 11701125 . S2CID 6822193 .
•   Nishikawa T, Okamura H, Nagadoi A, König P, Rhodes D, Nishimura Y (2001). "Lösningsstruktur av ett telomert DNA-komplex av human TRF1" . Struktur . 9 (12): 1237–51. doi : 10.1016/S0969-2126(01)00688-8 . PMID 11738049 .