TA hol familj

Den förmodade 3-4 TMS-transglykosylasassocierade Holin (TA Hol)-familjen ( TC # 1.E.43 ) tros vara en grupp holiner som inte tillhör någon av de sju holin-superfamiljerna. Homologer inkluderar tusentals olika fag- och bakterieproteiner mellan 80 och 140 aminoacylrester (aas) i längd som uppvisar 3 till 4 transmembransegment (TMS). Dessa proteiner är holinliknande till sin storlek och topologi och betecknas 'Transglykosylasassocierat', 'Putativt holin', 'Fagliknande transmembranprotein', 'YeaQ-protein', etc. i NCBI-proteindatabasen. Från och med början av 2016 förblir de funktionellt okarakteriserade. De härrör från ett brett spektrum av bakterie- och arkeala phyla inklusive både gramnegativa och grampositiva bakterier . Dessa proteiner är relaterade till RDD-familjen ( TC# 9.B.45 ) i den konserverade domändatabasen. En representativ lista över proteiner som tillhör familjen TA Hol finns i Transporter Classification Database .

Se även

• Holin
• Lysin
• Databas för klassificering av transportörer

Vidare läsning

•    Reddy, BL; Saier, MH (2013). "Topologiska och fylogenetiska analyser av bakteriella holinfamiljer och superfamiljer" . Biochim. Biophys. Acta . 1828 (11): 2654–71. doi : 10.1016/j.bbamem.2013.07.004 . PMC 3788059 . PMID 23856191 . .
•    Saier, MH; Reddy, BL (2015). "Holiner i bakterier, eukaryoter och arkéer: multifunktionella xenologer med potentiella biotekniska och biomedicinska tillämpningar" . J. Bacteriol . 197 (1): 7–17. doi : 10.1128/JB.02046-14 . PMC 4288690 . PMID 25157079 . .
•   Wang, IN; Smith, DL; Young, R (2000). "Holins: proteinklockorna för bakteriofaginfektioner". Annu. Rev. Microbiol . 54 : 799-825. doi : 10.1146/annurev.micro.54.1.799 . PMID 11018145 . .
•   Young, R; Bläsi, U (1995). "Holins: form och funktion i bakteriofaglys". FEMS Microbiol. Rev. _ 17 (1–2): 191–205. doi : 10.1111/j.1574-6976.1995.tb00202.x . PMID 7669346 . .

Från och med denna redigering använder den här artikeln innehåll från "1.E.43 Putative 3-4 TMS Transglycosylase-associated Holin (TA Hol) Family", som är licensierad på ett sätt som tillåter återanvändning under Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported Licens , men inte under GFDL . Alla relevanta villkor måste följas.