SroB RNA
| sroB RNA | |
|---|---|
 Förutspådd sekundär struktur och sekvenskonservering av sroB-
| |
| identifierare | |
| Symbol | sroB |
| Rfam | RF00368 |
| Övriga uppgifter | |
| RNA -typ | Gen ; sRNA |
| Domän(er) | Bakterie |
| SÅ | SO:0000655 |
| PDB- strukturer | PDBe |
sroB -RNA: t (även känt som MicM, rybC eller ChiX) är en icke-kodande RNA- gen med en längd på 90 nukleotider. sroB finns i flera enterobakterier men dess funktion är okänd. SroB finns i den intergena regionen på den motsatta strängen till ybaK- och ybaP-generna. SroB uttrycks i stationär fas. Experiment har visat att SroB är ett Hfq-bindande sRNA .
Ytterligare bevis har visat att SroB negativt reglerar det yttre membranproteinet YbfM genom att sekvestrera ribosombindningsstället för ybfM mRNA genom en antisens-interaktion. SroB reglerar även DpiA/DpiB tvåkomponentsystemet . Dessutom verkar SroB själv vara målet för ett icke-kodande transkript från den intergena chbBC-regionen.
Vidare läsning
- Plumbridge J, Bossi L, Oberto J, Wade JT, Figueroa-Bossi N (5 mars 2014). "Samspel mellan transkriptionella och små RNA-beroende kontrollmekanismer reglerar kitosockerupptag i Escherichia coli och Salmonella" . Molekylär mikrobiologi . 92 (4): 648–658. doi : 10.1111/mmi.12573 . PMID 24593230 . S2CID 25492913 .