Sf kaspas-1

Sf kaspas-1
Sf caspase-1 structure by Ni 2006, PDB 2NN3.jpg
Sf kaspas-1 struktur av Ni et al. 2006
Identifierare
Organism Spodoptera frugiperda (höstarmémask)
Symbol N/A
PDB 2NN3
RefSeq (mRNA) U81510.1
RefSeq (Prot) AAC47442.1
UniProt P89116
Söka efter
Strukturer Schweizisk modell
Domäner InterPro

Proteinet Sf caspase-1 är insektortologen av de mänskliga effektorkaspaserna CASP3 (CPP32) och CASP7 (MCH3) i arten Spodoptera frugiperda (Fall armyworm ) . Det identifierades som målet för det bakulovirala kaspasinhibitorproteinet P35 , som det klyver och genom vilket det hämmas . Liksom andra kaspaser är Sf-kaspas-1 ett aspartatspecifikt cysteinproteas som produceras som ett inaktivt proenzym och aktiveras av autokatalytisk klyvning . Sf-kaspas-1-proenzymet klyvs efter aminosyraresterna Asp-28 och Asp-195, vilket resulterar i ett mindre 12 kDa -fragment och ett större 19 kDa-fragment. Precis som med humana kaspaser CASP3 eller CASP7 bildar de två klyvningsfragmenten heterodimerer, som återigen bildar biologiskt aktiva dimerer-av-heterodimerer bestående av två mindre och två större fragment. Vissa experiment visade också klyvning av Sf-kaspas-1 vid resten Asp-184, vilket resulterade i ett 18 kDa-fragment istället för 19 kDa-fragment, men detta resultat är sannolikt en artefakt in vitro . Insektsimmunofilinet FKBP46 är ett substrat av Sf caspase-1, som klyver FKBP46 av full längd (~46 kDa) vilket resulterar i ett ~25 kDa-fragment .