SORBS1

SORBS1
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, CAP, FLAF2, R85FL, SH3D5, SH3P12, SORB1, sorbin och SH3-domän som innehåller 1
externt ID:n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

CAP/Ponsin -protein , även känt som Sorbin och SH3-domäninnehållande protein 1, är ett protein som hos människor kodas av SORBS1 - genen . Det är en del av en liten familj av adapterproteiner som reglerar celladhesion , tillväxtfaktorsignalering och cytoskelettbildning . Det uttrycks huvudsakligen i hjärta , skelettmuskulatur , lever , fettvävnad och makrofager ; i tvärstrimmig muskelvävnad är den lokaliserad till costamere strukturer.

Strukturera

CAP/Ponsin kan existera som tretton alternativt splitsade isoformer, från 81 kDa till 142 kDa. Det är en del av en adapterproteinfamilj, som ArgBP2 och vinexin är en del av. Dessa proteiner innehåller en konserverad sorbinhomologi (SOHO) domän och tre SH3-domäner , och CAP/Ponsin uttrycks i hjärta , skelettmuskulatur , lever , fettvävnad och makrofager .

Fungera

I muskler spelar CAP/Ponsin en roll i bildandet av mogna costamerer från fokala adhesionsliknande kontakter under montering av den kontraktila apparaten , eftersom överuttryck av CAP/Ponsin störde normal cell-matriskontaktmorfologi. I en musmodell av viral myokardit på grund av Coxsackievirusinfektion stabiliserade CAP/Ponsin antiviral typ I interferonproduktion och var skyddande mot apoptos och cytotoxicitet. Det har också visat sig vara en viktig regulator av insulinstimulerad signalering och reglering av glukosupptag , genom att potentiera insulininducerad fosforylering och rekrytering av CBL till ett lipidflottsignalkomplex som involverar flotillin . En roll för det i makrofagfunktionen belystes av upptäckten att, hos möss som hyser SORBS1 -bristiga makrofager i benmärgen , det var skyddande mot fettrik diet-inducerad insulinresistens och visade minskad inflammation . I icke-muskelceller hämmar det cellspridning och fokal adhesionsomsättning , eftersom dess siRNA -medierade knockdown resulterade i förbättrad PAK / MEK / ERK -aktivering och cellmigrering.

Klinisk signifikans

CAP/Ponsin visades vara nedreglerad hos patienter med hjärtsvikt i slutstadiet; en effekt som återställdes vid mekanisk lossning. En enskild nukleotidpolymorfism i SORBS1 visade sig vara associerad med typ 2-diabetes och fetma .

Interaktioner

SORBS1 har visat sig interagera med:

• CBL ,
• FLOT1 ,
• INPPL1 ,
• INSM1 ,
• MLLT4 ,
• PXN , och
• Vinculin .

Vidare läsning

•   Kioka N (nov 2002). "[En ny adapterproteinfamilj som reglerar cytoskelettorganisation och signaltransduktion - Vinexin, CAP/ponsin, ArgBP2]". Seikagaku. Journal of Japanese Biochemical Society . 74 (11): 1356–60. PMID 12510380 .
•   Ribon V, Herrera R, Kay BK, Saltiel AR (feb 1998). "En roll för CAP, ett nytt, multifunktionellt Src-homologi 3-domäninnehållande protein i bildandet av aktinstressfibrer och fokala vidhäftningar" . Journal of Biological Chemistry . 273 (7): 4073–80. doi : 10.1074/jbc.273.7.4073 . PMID 9461600 .
•    Asakura T, Nakanishi H, Sakisaka T, Takahashi K, Mandai K, Nishimura M, Sasaki T, Takai Y (okt 1999). "Liknande och differentiellt beteende mellan nectin-afadin-ponsin- och cadherin-catenin-systemen under bildandet och störningen av den polariserade junctional inriktningen i epitelceller" . Gener till celler . 4 (10): 573–81. doi : 10.1046/j.1365-2443.1999.00283.x . PMID 10583506 . S2CID 24023429 .
•   Nagase T, Kikuno R, Ishikawa KI, Hirosawa M, Ohara O (feb 2000). "Förutsägelse av de kodande sekvenserna för oidentifierade mänskliga gener. XVI. De kompletta sekvenserna av 150 nya cDNA-kloner från hjärnan som kodar för stora proteiner in vitro" . DNA-forskning . 7 (1): 65–73. doi : 10.1093/dnares/7.1.65 . PMID 10718198 .
•    Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (november 2000). "DNA-kloning med användning av platsspecifik rekombination in vitro" . Genomforskning . 10 (11): 1788–95. doi : 10.1101/gr.143000 . PMC 310948 . PMID 11076863 .
•   Lebre AS, Jamot L, Takahashi J, Spassky N, Leprince C, Ravisé N, Zander C, Fujigasaki H, Kussel-Andermann P, Duyckaerts C, Camonis JH, Brice A (maj 2001). "Ataxin-7 interagerar med ett Cbl-associerat protein som det rekryterar till neuronala intranukleära inneslutningar" . Human molekylär genetik . 10 (11): 1201–13. doi : 10.1093/hmg/10.11.1201 . PMID 11371513 .
•   Lin WH, Huang CJ, Liu MW, Chang HM, Chen YJ, Tai TY, Chuang LM (maj 2001). "Kloning, kartläggning och karakterisering av den humana sorbin- och SH3-domänen som innehåller 1 (SORBS1) gen: ett protein associerat med c-Abl under insulinsignalering i hepatomcellinjen Hep3B" (PDF ) . Genomik . 74 (1): 12–20. doi : 10.1006/geno.2001.6541 . PMID 11374898 .
•    Kimura A, Baumann CA, Chiang SH, Saltiel AR (jul 2001). "Sorbinhomologidomänen: ett motiv för inriktning av proteiner till lipidflottar" . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 98 (16): 9098–103. Bibcode : 2001PNAS...98.9098K . doi : 10.1073/pnas.151252898 . PMC 55379 . PMID 11481476 .
•   Lin WH, Chiu KC, Chang HM, Lee KC, Tai TY, Chuang LM (aug 2001). "Molekylär skanning av humant sorbin och SH3-domän-innehållande-1 (SORBS1)-genen: positiv association av T228A-polymorfismen med fetma och typ 2-diabetes" . Human molekylär genetik . 10 (17): 1753–60. doi : 10.1093/hmg/10.17.1753 . PMID 11532984 .
•    Cowan CA, Henkemeyer M (sep 2001). "SH2/SH3-adaptern Grb4 transducerar B-ephrin omvända signaler". Naturen . 413 (6852): 174–9. Bibcode : 2001Natur.413..174C . doi : 10.1038/35093123 . PMID 11557983 . S2CID 4313061 .
•    Liu J, Kimura A, Baumann CA, Saltiel AR (juni 2002). "APS underlättar c-Cbl-tyrosinfosforylering och GLUT4-translokation som svar på insulin i 3T3-L1-adipocyter" . Molekylär och cellulär biologi . 22 (11): 3599–609. doi : 10.1128/MCB.22.11.3599-3609.2002 . PMC 133825 . PMID 11997497 .
•    Xie J, Cai T, Zhang H, Lan MS, Notkins AL (juli 2002). "Zinkfingertranskriptionsfaktorn INSM1 uttrycks under embryoutveckling och interagerar med det Cbl-associerade proteinet" . Genomik . 80 (1): 54–61. doi : 10.1006/geno.2002.6800 . PMC 1237014 . PMID 12079283 .
•    Nakayama M, Kikuno R, Ohara O (november 2002). "Protein-proteininteraktioner mellan stora proteiner: tvåhybridscreening med ett funktionellt klassificerat bibliotek bestående av långa cDNA. " Genomforskning . 12 (11): 1773–84. doi : 10.1101/gr.406902 . PMC 187542 . PMID 12421765 .
•   Vandenbroere I, Paternotte N, Dumont JE, Erneux C, Pirson I (Jan 2003). "Det c-Cbl-associerade proteinet och c-Cbl är två nya partners till det SH2-innehållande inositolpolyfosfatet 5-fosfatas SHIP2". Biokemisk och biofysisk forskningskommunikation . 300 (2): 494–500. doi : 10.1016/S0006-291X(02)02894-2 . PMID 12504111 .
•   Yang WS, Lee WJ, Huang KC, Lee KC, Chao CL, Chen CL, Tai TY, Chuang LM (april 2003). "mRNA-nivåer av den insulinsignalerande molekylen SORBS1 i fettdepåerna hos kvinnor utan diabetes" . Forskning om fetma . 11 (4): 586–90. doi : 10.1038/oby.2003.82 . PMID 12690089 .