SKI protein

ÅKA SKIDOR
Tillgängliga strukturer PDB Ortologisk sökning: Lista över PDB-id-koder
Identifierare
	, SKI proto-onkogen, SGS, SKV
Externa ID:n
Genplacering ( Human ) Chr. Band Start Slutet
Genplacering ( Mus ) Chr. Band Start Slutet
RNA uttrycksmönster Bgee Mänsklig Mus (ortolog) BioGPS
Genontologi Molekylär funktion Cellkomponent Biologisk process Källor: Amigo / QuickGO
Ortologer Arter Mänsklig Mus Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (protein) Plats (UCSC) PubMed -sökning
Wikidata
Visa/redigera människa Visa/redigera mus

SKI -proteinet är en nukleär proto-onkogen som är associerad med tumörer i höga cellkoncentrationer. SKI har visat sig störa normal cellulär funktion genom att både direkt hindra uttryck av vissa gener inuti cellens kärna samt störa signalproteiner som aktiverar gener.

SKI reglerar transformerande tillväxtfaktor-beta ( TGF-beta ) negativt genom att direkt interagera med Smads och undertrycka transkriptionen av TGF-beta-responsiva gener. Detta har associerats med cancer på grund av det stora antalet roller som peptidtillväxtfaktorer, av vilka TGF-beta är en underfamilj, spelar för att reglera cellulära funktioner såsom cellproliferation, apoptos , specifikation och utvecklingsöde .

Namnet SKI kommer från Sloan-Kettering Institute där proteinet ursprungligen upptäcktes.

Strukturera

Gen

SKI-proto-onkogenen är belägen i en region nära p73- tumörsuppressorgenen vid locus 1p36.3 locus för en gen, vilket tyder på en liknande funktion som p73-genen.

Protein

Kristallstruktur av tax-homologidomänen hos mänsklig SKI.

SKI-proteinet har en sekvens på 728 aminosyror , med flera domäner . Det uttrycks både inuti och utanför kärnan. Det är i samma familj som SnoN -proteinet. De olika domänerna har olika funktioner, där de primära domänerna interagerar med Smad-proteiner. Proteinet har ett helix-turn-helix- motiv , ett cystein- och histidinrikt område som ger upphov till zinkfingermotivet , en basisk aminosyraregion och leucindragkedja . Alla dessa domäner, inklusive en prolinrik region, överensstämmer med det faktum att proteinet måste ha domäner som tillåter det att interagera med andra proteiner. Proteinet har också hydrofoba regioner som kommer i kontakt med Smad-proteiner rika på leucin- och fenylalaninaminosyraregioner . Nyligen genomförda studier har föreslagit en domän som liknar Taxproteinet . SKI-Dachshund-homologidomänen (SKI-DHD) innehåller helixtur-helixdomänerna för proteinet och beta-alfa-beta-svängmotiven.

Fungera

SKI-onkogenen finns i alla celler och är vanligtvis aktiv under utveckling. Specifikt är fågelfibroblaster beroende av SKI-proteinet som en co-regulator för transkription som inducerar transformation. Den tidigare nämnda DHD-regionen används specifikt för protein-protein-interaktioner, medan C-terminalen med 191 aminosyror förmedlar oligomerisering . Ny forskning visar att SKI-proteinet i cancerceller fungerar som en suppressor och hämmar transformerande tillväxtfaktor β (TGF-β) signalering . TGF-β är ett protein som reglerar celltillväxt . Signalering regleras av en familj av proteiner som kallas Smad-proteiner. SKI finns i alla vuxna och embryonala celler i låga nivåer, men ett överuttryck av proteinet är karakteristiskt för tumörceller. Man tror att höga nivåer av SKI-protein inaktiverar tumörsuppression genom förskjutning av andra proteiner och interferens med signalvägen för TGF-β. SKI-proteinet och CPB-proteinet tävlar om bindning med Smad-proteinerna, och tävlar specifikt med Smad-3- och CReB -bindande proteininteraktioner. SKI interagerar också direkt med R-Smad ∙ Smad-4- komplexet, som direkt undertrycker normal transkription av de TGF-β-responsiva generna, inaktiverar cellens förmåga att stoppa tillväxt och delning, vilket skapar cancerceller.

SKI har kopplats till olika cancerformer inklusive humana melanom , esofagus skivepitelcancer, livmoderhalscancer och tumörprogressionsprocessen. Kopplingen mellan SKI och humant melanom har varit det mest studerade området för proteinets koppling till cancer. För närvarande tros det att SKI-proteinet förhindrar svar på TFG-β-nivåer, vilket orsakar tumörbildning.

Relaterad forskning

Annan forskning har identifierat proteiner som liknar Ski. SnoN - proteinet identifierades som ett liknande protein och diskuteras ofta i konjugering med Ski-proteinet i publikationer. Ny forskning tyder på att rollen för SnoN kan vara något annorlunda och potentiellt till och med kunna spela en antagonistisk roll.

Andra nya studier har bestämt att Fussel-15 och Fussel-18 är homologa med Ski/Sno-familjen av proteiner. Fussel-15 har visat sig spela ungefär samma roll som Ski/Sno-proteinerna, men dess uttryck är inte lika allmänt förekommande som Ski/Sno-proteinerna. Fussel-18 har visat sig ha en hämmande roll i TGF-beta-signaleringen.

Tax och SKIDA1 är också i familjen Ski/Sno/Dac ( InterPro : IPR003380 , IPR023216 .

Interaktioner

SKI-protein har visat sig interagera med:

• HIPK2 ,
• MECP2 ,
• Mödrar mot dekapentaplegi homolog 1 och
• Mödrar mot dekapentaplegi homolog 2 ,
• Mödrar mot dekapentaplegi homolog 3 ,
• NFIX ,
• Promyelocytisk leukemiprotein ,
• SKIL , och
• SNW1 .

Vidare läsning

•   Medrano EE (2003). "Repression av TGF-beta-signalering av det onkogena proteinet SKI i humana melanom: konsekvenser för spridning, överlevnad och metastasering" . Onkogen . 22 (20): 3123–9. doi : 10.1038/sj.onc.1206452 . PMID 12793438 .
•    Nomura N, Sasamoto S, Ishii S, Date T, Matsui M, Ishizaki R (1989). "Isolering av humana cDNA-kloner av skidor och den skidrelaterade genen, sno" . Nucleic Acids Res . 17 (14): 5489–500. doi : 10.1093/nar/17.14.5489 . PMC 318172 . PMID 2762147 .
•   Chaganti RS, Balazs I, Jhanwar SC, Murty VV, Koduru PR, Grzeschik KH, Stavnezer E (1987). "Den cellulära homologen av den transformerande genen av SKV-fågelretrovirus kartlägger den mänskliga kromosomregionen 1q22----q24". Cytogenet. Cell Genet . 43 (3–4): 181–6. doi : 10.1159/000132318 . PMID 3026737 .
•    Pearson-White S (1993). "SnoI, en ny alternativt skarvad isoform av skidprotoonkogenhomologen, sno" . Nucleic Acids Res . 21 (19): 4632–8. doi : 10.1093/nar/21.19.4632 . PMC 311202 . PMID 8233802 .
•   Nagase T, Nomura N, Ishii S (1993). "Komplex bildning mellan proteiner som kodas av skigenfamiljen" . J. Biol. Chem . 268 (18): 13710–6. doi : 10.1016/S0021-9258(18)86915-0 . PMID 8514802 .
•    Tarapore P, Richmond C, Zheng G, Cohen SB, Kelder B, Kopchick J, Kruse U, Sippel AE, Colmenares C, Stavnezer E (1997). "DNA-bindning och transkriptionell aktivering av Ski-onkoproteinet förmedlad genom interaktion med NFI" . Nucleic Acids Res . 25 (19): 3895–903. doi : 10.1093/nar/25.19.3895 . PMC 146989 . PMID 9380514 .
•   Dahl R, Wani B, Hayman MJ (1998). "Ski-onkoproteinet interagerar med Skip, den humana homologen av Drosophila Bx42" . Onkogen . 16 (12): 1579–86. doi : 10.1038/sj.onc.1201687 . PMID 9569025 .
•    Cohen SB, Zheng G, Heyman HC, Stavnezer E (1999). "Heterodimerer av SnoN- och Ski-onkoproteinerna bildas företrädesvis framför homodimerer och är mer potenta transformerande medel" . Nucleic Acids Res . 27 (4): 1006–14. doi : 10.1093/nar/27.4.1006 . PMC 148280 . PMID 9927733 .
•    Luo K, Stroschein SL, Wang W, Chen D, Martens E, Zhou S, Zhou Q (1999). "Ski-onkoproteinet interagerar med Smad-proteinerna för att undertrycka TGFbeta-signalering" . Genes Dev . 13 (17): 2196–206. doi : 10.1101/gad.13.17.2196 . PMC 316985 . PMID 10485843 .
•   Sun Y, Liu X, Eaton EN, Lane WS, Lodish HF, Weinberg RA (1999). "Interaktion mellan Ski-onkoproteinet och Smad3 reglerar TGF-beta-signalering" . Mol. Cell . 4 (4): 499–509. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80201-4 . PMID 10549282 .
•   Akiyoshi S, Inoue H, Hanai J, Kusanagi K, Nemoto N, Miyazono K, Kawabata M (2000). "c-Ski fungerar som en transkriptionell co-repressor för att transformera tillväxtfaktor-beta-signalering genom interaktion med smads" . J. Biol. Chem . 274 (49): 35269–77. doi : 10.1074/jbc.274.49.35269 . PMID 10575014 .
•    Steffan JS, Kazantsev A, Spasic-Boskovic O, Greenwald M, Zhu YZ, Gohler H, Wanker EE, Bates GP, Housman DE, Thompson LM (2000). "Proteinet från Huntingtons sjukdom interagerar med p53 och CREB-bindande protein och undertrycker transkription" . Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 97 (12): 6763–8. Bibcode : 2000PNAS...97.6763S . doi : 10.1073/pnas.100110097 . PMC 18731 . PMID 10823891 .
•   Khan MM, Nomura T, Kim H, Kaul SC, Wadhwa R, Shinagawa T, Ichikawa-Iwata E, Zhong S, Pandolfi PP, Ishii S (2001). "Roll av PML och PML-RARalpha i Mad-medierad transkriptionell repression" . Mol. Cell . 7 (6): 1233–43. doi : 10.1016/S1097-2765(01)00257-X . PMID 11430826 .
•   Kokura K, Kaul SC, Wadhwa R, Nomura T, Khan MM, Shinagawa T, Yasukawa T, Colmenares C, Ishii S (2001). "Ski-proteinfamiljen krävs för MeCP2-medierad transkriptionell repression" . J. Biol. Chem . 276 (36): 34115–21. doi : 10.1074/jbc.M105747200 . PMID 11441023 .
•    Prathapam T, Kühne C, Hayman M, Banks L (2001). "Ski interagerar med den evolutionärt bevarade SNW-domänen Skip" . Nucleic Acids Res . 29 (17): 3469–76. doi : 10.1093/nar/29.17.3469 . PMC 55893 . PMID 11522815 .
•   Reed JA, Bales E, Xu W, Okan NA, Bandyopadhyay D, Medrano EE (2001). "Cytoplasmatisk lokalisering av det onkogena proteinet Ski i humana kutana melanom in vivo: funktionella implikationer för att transformera tillväxtfaktor beta-signalering". Cancer Res . 61 (22): 8074–8. PMID 11719430 .
•   Pessah M, Marais J, Prunier C, Ferrand N, Lallemand F, Mauviel A, Atfi A (2002). "c-Jun associerar med onkoproteinet Ski och undertrycker Smad2 transkriptionsaktivitet" . J. Biol. Chem . 277 (32): 29094–100. doi : 10.1074/jbc.M202831200 . PMID 12034730 .
•    Wu JW, Krawitz AR, Chai J, Li W, Zhang F, Luo K, Shi Y (2002). "Strukturell mekanism för Smad4-igenkänning av det nukleära onkoproteinet Ski: insikter om Ski-medierad repression av TGF-beta-signalering" . Cell . 111 (3): 357–67. doi : 10.1016/S0092-8674(02)01006-1 . PMID 12419246 . S2CID 10390985 .
•    Dai P, Shinagawa T, Nomura T, Harada J, Kaul SC, Wadhwa R, Khan MM, Akimaru H, Sasaki H, Colmenares C, Ishii S (2002). "Ski är involverad i transkriptionsreglering av repressorn och fullängdsformer av Gli3" . Genes Dev . 16 (22): 2843–8. doi : 10.1101/gad.1017302 . PMC 187484 . PMID 12435627 .
•   He J, Tegen SB, Krawitz AR, Martin GS, Luo K (2003). "Den transformerande aktiviteten hos Ski och SnoN är beroende av deras förmåga att undertrycka aktiviteten hos Smad-proteiner. " J. Biol. Chem . 278 (33): 30540–7. doi : 10.1074/jbc.M304016200 . PMID 12764135 .