SIRCAMS
Scottish Instrumentation and Research Centre for Advanced Mass Spectrometry (SIRCAMS) är en anläggning för ultrahögupplösningsmasspektrometri av biomolekyler . SIRCAMS är baserat på University of Edinburgh School of Chemistry .
Mycket av forskningsverksamheten är inriktad på utveckling och tillämpning av masspektrometri för analys av intakta peptider , proteiner , protein-protein och protein - RNA / DNA - komplex. Nyligen genomförda studier har inkluderat: identifiering av platineringsställen i peptider ( bombesin , substans P , angiotensin , bradykinin ) med hjälp av infraröd multifotondissociation (IRMPD), kollisionsinducerad dissociation (CID) och elektroninfångningsdissociation (ECD), noggranna massmätningar på intakt proteiner (YdaE 6,5 kDa, ubiquitin 8,6 kDa, trypsinogen 24 kDa, kolsyraanhydras 28 kDa, beSOD 31 kDa, FbpA 33 kDa, BSA 66 kDa) under naturliga och denaturerande förhållanden, i identifiering av translact human post-down-modifiering, i top-down-modifiering. -nedidentifiering av proteiner från komplexa blandningar, samt noggrann massanalys av oligonukleotid -DNA-strängar (40 bp).
Kapitalkostnaden för FTICR-instrument som arbetar med fältstyrkor högre än 9,4 T är sådana att få universitetsinstitutioner över hela världen kan erbjuda tillgång. SIRCAMS ger användaren tillgång till en 12T Bruker SolariX FTICR masspektrometer inom anläggningen. Genom att dra nytta av den forskningsexpertis som har utvecklats av personalen inom anläggningen får användarna tillgång till tekniker för noggrann massmätning av intakta proteiner med isotoptoppanpassning , top-down proteinsekvensering från komplexa blandningar (som biomarköridentifiering ) lösning och gasfas HDX för proteinkonformationsstudier, kartläggning av posttranslationella modifieringar i peptider och proteiner, och identifiering av DNA-modifieringar .